TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g28160
TIGR annotation:basic helix-loop-helix (bHLH) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  80.1   18.25
 100.5 
 116.6 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  121.8   8.02
 139.2 
 132.6 
 138.4 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  132.9   13.99
 100.9 
 106.5 
 115 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  106.3   8.61
 119.7 
 107.5 
 98.9 
 0.70 Seedling (SL01)  155.9   4.35
 147.8 
 149.1 
 0.70 Seedling (SL02)  130.6   4.2
 135.9 
 138.9 
 0.70 Seedling (SL10)  63   5.5
 72.5 
 72.5 
 0.70 Seedling (SL12)  89   4.3
 91.3 
 97.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  100.5   5.51
 89.5 
 94.4 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  98.9   11.29
 78.1 
 96.1 
 1.00 Seedling (SL07)  86.2   17.32
 110.7 
 1.00 Seedling (SL09)  125.2   21.29
 82.8 
 107.1 
 1.00 Seedling (SL11)  124.4   12.83
 96.8 
 100.3 
 114.6 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  77.3   1.12
 78.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  197.4   29.32
 178.2 
 139.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  96.6   1.93
 100.2 
 99.7 
 1.02 Seedling (SL08)  96.5   18.56
 122.8 
 1.02 Roots (RT01)  404.7   67.84
 308.8 
 1.02 Lateral roots (RH01)  376.7   82.67
 368.8 
 515.8 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  149.8   14.53
 125.9 
 123.5 
 1.05 Rosette (LF11)  102.4   9.36
 113.2 
 121.1 
 1.14 Rosette (LF12)  109.4   1.11
 107.9 
 107.2 
 1.14 Rosette (LF13)  99.5   5.52
 107.3 
 3.20 Whole plant (WP05)  92.7   3.92
 96.5 
 100.6 
 3.70 Adult leaf (LF01)  118.1   6.47
 122.7 
 109.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  123   7.27
 115.8 
 130.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  114.1   7.01
 118.7 
 127.8 
 3.90 Adult leaf (LF03)  180.5   24.12
 139.4 
 138.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  161.4   15.62
 130.2 
 146.2 
 3.90 Rosette (SH01)  97.9   13.3
 92.2 
 117.5 
 3.90 Roots (RT04)  191.6   83.94
 346.4 
 325.2 
 3.90 Roots (RT05)  545.3   112.94
 464.1 
 687.2 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  110.7   3.66
 113.5 
 116.9 
 108.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  57.3   2.36
 53.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  130.3   29.09
 80.9 
 78.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  108   17.99
 81 
 73.9 
 5.10 Roots (RT02)  322.7   51.33
 250.1 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  125.7   31.06
 169.6 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  121.3   34.46
 170 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  162.5   22.88
 194.8 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  188.4   2.55
 192 
 6.00 Leaf (LF08)  115.5   6.31
 123.7 
 111.3 
 6.00 Leaf (LF16)  53.4   4.54
 52.2 
 45 
 6.00 Inflorescence (IN01)  126.1   14.55
 105.6 
 6.10 Leaf (LF10)  118.8   15.4
 88.7 
 98 
 6.10 Stem base (ST01)  138.8   21.93
 169.9 
 6.10 Stem top (ST02)  100.2   14.34
 120.5 
 6.10 Flower, open (FL01)  52.6   5.52
 60.4 
 6.30 Silique, young (FS01)  63.9   4.78
 57.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  135.8   22.88
 92 
 102.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  107.2   6.68
 98.6 
 94.1 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  145   27.58
 105.1 
 92.1 
 Suspension cell culture (SU01)  234.5   80.74
 90.3 
 99.6 
 Suspension cell culture (SU02)  134.2   10.51
 149 
 Xylem (XL01)  112.4   13.57
 100.1 
 85.3 
 Cork (CR01)  99   8.62
 81.8 
 91.9 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  274.4   47.32
 364.6 
 294.7 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  375.2   51.68
 276.4 
 352.3 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  235.1   94.36
 201.1 
 378.9 
 Heart embryo, roots (EHR1)  240.4   32.96
 298.4 
 296.6 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  155   23.83
 202.1 
 184.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  182.6   105.22
 363.2 
 179.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  422.9   162.19
 295.6 
 617.6 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  540.7   144.77
 251.3 
 387.5 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  566.2   329.75
 895.4 
 1225.7 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress