TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g30580
TIGR annotation:zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  141.3   27.33
 191.8 
 148.5 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  136.2   10.26
 155.8 
 138.5 
 132.8 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  143.5   7.7
 137.4 
 129.2 
 126.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  135.3   2.02
 139.3 
 135.7 
 134.9 
 0.70 Seedling (SL01)  127.2   6.4
 121.9 
 134.7 
 0.70 Seedling (SL02)  117.1   9.94
 98.2 
 102.2 
 0.70 Seedling (SL10)  120.5   17.58
 101.9 
 137 
 0.70 Seedling (SL12)  76.3   18.49
 48.7 
 83.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  192.3   4.86
 201.1 
 193.2 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  152.4   12.44
 163 
 138.2 
 1.00 Seedling (SL07)  143.3   18
 168.8 
 1.00 Seedling (SL09)  134.4   8.02
 147.4 
 149 
 1.00 Seedling (SL11)  137.4   11.94
 143.9 
 117.3 
 125.2 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  138.1   9.85
 124.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  134.8   9.47
 132.2 
 117.3 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  130.2   10.78
 123.9 
 109.2 
 1.02 Seedling (SL08)  116.7   0.68
 115.7 
 1.02 Roots (RT01)  196.6   24.85
 161.5 
 1.02 Lateral roots (RH01)  116   7.63
 103.4 
 117.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  107.8   9.1
 105.9 
 122.5 
 1.05 Rosette (LF11)  116.1   12.81
 139.1 
 117.8 
 1.14 Rosette (LF12)  147.2   4.02
 152.3 
 144.3 
 1.14 Rosette (LF13)  147.8   0.98
 149.2 
 3.20 Whole plant (WP05)  84.6   2.04
 88.2 
 84.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  105.7   3.59
 99.9 
 99.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  100.8   7.23
 111.8 
 114.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  107.7   4.36
 101.7 
 110.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  125   11.12
 134.6 
 112.5 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  123.1   8.04
 127.9 
 112.2 
 3.90 Rosette (SH01)  132.3   12.33
 113.8 
 137.1 
 3.90 Roots (RT04)  111.8   3.55
 116.9 
 110.1 
 3.90 Roots (RT05)  128.4   1.23
 127.9 
 130.2 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  155.2   5.91
 152.5 
 141.5 
 149.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  264.7   33.83
 216.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  196.9   7.05
 210.8 
 201.7 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  214.7   16.44
 183.4 
 207.9 
 5.10 Roots (RT02)  129.9   8.69
 117.6 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  641.6   40.64
 584.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  684.2   16.84
 708 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  692.5   20.38
 663.7 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  477   29.51
 518.7 
 6.00 Leaf (LF08)  146.5   4.78
 137 
 142 
 6.00 Leaf (LF16)  162.3   15.01
 140.4 
 133.6 
 6.00 Inflorescence (IN01)  226.1   24.65
 191.2 
 6.10 Leaf (LF10)  117.2   9
 133 
 132.6 
 6.10 Stem base (ST01)  166.2   10.41
 151.5 
 6.10 Stem top (ST02)  137.3   2.91
 141.4 
 6.10 Flower, open (FL01)  207.5   28.66
 167 
 6.30 Silique, young (FS01)  178.7   27.71
 217.9 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  154.6   10.88
 169.1 
 147.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  117.5   16.2
 123.4 
 148 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  202.5   28.79
 183.1 
 145.8 
 Suspension cell culture (SU01)  269.1   23.88
 301.4 
 315.7 
 Suspension cell culture (SU02)  216.1   24.07
 182 
 Xylem (XL01)  254.6   16.1
 235.7 
 267.7 
 Cork (CR01)  163.7   5.73
 154.3 
 153.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  240.1   29.91
 250.1 
 194 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  269.3   599.04
 368.1 
 1352.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  399.2   154.44
 146.6 
 119 
 Heart embryo, roots (EHR1)  445.2   434.15
 1049.8 
 207.7 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  456.5   177.84
 385 
 722.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  535.8   126.16
 717.5 
 475 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  2561.3   1313.18
 451.9 
 151.5 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  614.9   311.36
 718.7 
 135.1 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  192.1   111.43
 118.4 
 337.4 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress