TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g35930
TIGR annotation:U-box domain-containing protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  61.8   1.82
 65.2 
 64.7 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  73.6   7.9
 72.2 
 67.5 
 56.2 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  55.5   3.65
 64.1 
 57.9 
 59.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  58.3   0.88
 59.8 
 58 
 57.8 
 0.70 Seedling (SL01)  251.1   7.37
 253.6 
 265 
 0.70 Seedling (SL02)  235.7   26.55
 182.7 
 210.8 
 0.70 Seedling (SL10)  229.3   22.08
 273 
 245.4 
 0.70 Seedling (SL12)  179.4   13.16
 205.5 
 195.7 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  98.2   12.26
 76.9 
 98 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  54.2   2.77
 59.6 
 58.2 
 1.00 Seedling (SL07)  469.4   2.31
 466.1 
 1.00 Seedling (SL09)  213.7   8.2
 210.6 
 198.2 
 1.00 Seedling (SL11)  300.4   94.17
 294.6 
 349 
 496.6 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  169.4   170.92
 411.1 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  352.7   98.79
 196.1 
 170.1 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  444.6   35.12
 385.7 
 381.9 
 1.02 Seedling (SL08)  863.2   115.55
 1026.6 
 1.02 Roots (RT01)  1133.5   7.35
 1123.1 
 1.02 Lateral roots (RH01)  570.2   47.07
 501 
 590.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  582.8   203.53
 984.1 
 724.4 
 1.05 Rosette (LF11)  128.3   20.4
 141.7 
 168.3 
 1.14 Rosette (LF12)  116.9   7.03
 111.7 
 125.7 
 1.14 Rosette (LF13)  181.6   2.66
 185.3 
 3.20 Whole plant (WP05)  157.5   4.88
 163.7 
 167.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  64.3   21.41
 107.1 
 83.7 
 3.70 Adult leaf (LF02)  67.5   2.59
 71.5 
 66.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  84.4   3.27
 78 
 80.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  229.2   418.83
 996.1 
 904.6 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  96.7   1067.28
 1253.8 
 2228.7 
 3.90 Rosette (SH01)  245.2   33.45
 223.2 
 179.5 
 3.90 Roots (RT04)  756.1   13.96
 744.4 
 772.2 
 3.90 Roots (RT05)  890.6   52.14
 788.3 
 821.8 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  321.8   25.77
 369.3 
 329.6 
 309.7 
 5.10 Flower, buds (FB01)  59.4   3.45
 64.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  81.4   47.44
 158.5 
 72.1 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  64.1   9.08
 46.4 
 58.8 
 5.10 Roots (RT02)  610   369.28
 1132.2 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  75.3   17.55
 100.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  73.2   1.67
 70.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  86.2   6.12
 77.6 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  89   104.58
 236.9 
 6.00 Leaf (LF08)  93.7   9.79
 77.5 
 76.1 
 6.00 Leaf (LF16)  830.3   58.88
 817.5 
 925.3 
 6.00 Inflorescence (IN01)  65   4.17
 59.1 
 6.10 Leaf (LF10)  45.2   44.31
 102.6 
 132.4 
 6.10 Stem base (ST01)  164.7   2.71
 160.9 
 6.10 Stem top (ST02)  79.4   3.99
 85.1 
 6.10 Flower, open (FL01)  45   2.35
 41.7 
 6.30 Silique, young (FS01)  42.1   2.92
 37.9 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  74.2   6.34
 64.4 
 76.2 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  60.6   3.01
 56.6 
 62.4 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  73.6   7.93
 85.8 
 70.9 
 Suspension cell culture (SU01)  101.4   5.26
 107 
 111.9 
 Suspension cell culture (SU02)  712.3   96.12
 848.2 
 Xylem (XL01)  61.9   7.31
 50.5 
 48.2 
 Cork (CR01)  80.3   10.7
 69.2 
 58.9 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  271.1   44.09
 182.9 
 228.2 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  461   141.14
 265.8 
 186.8 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  124.3   16.26
 156.2 
 146 
 Heart embryo, roots (EHR1)  124.2   32.15
 187.9 
 148 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  134.4   22.02
 163.6 
 177.6 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  153.5   41.13
 73.6 
 130.3 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  102   23.19
 92.5 
 57.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  76.8   80.25
 63.5 
 208.6 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  197.1   65.35
 68.2 
 113.8 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress