TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g38240
TIGR annotation:oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  277.5   9.28
 260 
 263.2 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  331   16.87
 352.1 
 370.3 
 340.8 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  324.3   26.54
 335.7 
 275 
 305.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  291.6   9.83
 308.7 
 305.8 
 314.8 
 0.70 Seedling (SL01)  242.3   6.16
 246.7 
 254.5 
 0.70 Seedling (SL02)  323.9   19.63
 326.4 
 291.2 
 0.70 Seedling (SL10)  327.6   32.01
 375.2 
 314.3 
 0.70 Seedling (SL12)  283.6   189.55
 661 
 503.7 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  218.6   16.66
 185.4 
 204.8 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  216.1   6.44
 218.3 
 206.2 
 1.00 Seedling (SL07)  227.6   7.9
 238.7 
 1.00 Seedling (SL09)  218.3   14.74
 195 
 222.3 
 1.00 Seedling (SL11)  163.7   15.85
 157.9 
 173.4 
 194 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  213.5   11.31
 197.5 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  297.1   68.11
 204.9 
 337.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1091   9.21
 1092.3 
 1075.8 
 1.02 Seedling (SL08)  288.1   24.76
 253 
 1.02 Roots (RT01)  163.9   31.31
 208.2 
 1.02 Lateral roots (RH01)  199.6   15.27
 208.1 
 178.4 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  316.3   168.15
 642.1 
 406.7 
 1.05 Rosette (LF11)  287.4   54.04
 389.2 
 369.6 
 1.14 Rosette (LF12)  344.7   57.21
 245.3 
 344 
 1.14 Rosette (LF13)  333.5   37.41
 386.5 
 3.20 Whole plant (WP05)  235.8   19.61
 275 
 254.8 
 3.70 Adult leaf (LF01)  276.2   6.71
 277.9 
 265.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  298.3   13.16
 279.4 
 304.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  259.1   20.53
 218.2 
 242.6 
 3.90 Adult leaf (LF03)  283.2   103.49
 489.8 
 397.2 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  345.3   33.72
 390.6 
 411.2 
 3.90 Rosette (SH01)  497.9   112.91
 718.4 
 566.1 
 3.90 Roots (RT04)  267.9   27.02
 241 
 213.9 
 3.90 Roots (RT05)  248.1   29.3
 306.5 
 281 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  349.5   49.3
 432.9 
 455.4 
 374.9 
 5.10 Flower, buds (FB01)  423.4   135.45
 231.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  174.2   62.12
 221.1 
 297.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  221.1   209.43
 586.1 
 581.6 
 5.10 Roots (RT02)  160   16.62
 183.5 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  227.3   26.29
 264.5 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  213.6   23.25
 246.5 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  253.4   17.13
 277.6 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  371.6   9.19
 384.6 
 6.00 Leaf (LF08)  236.8   76.55
 372.8 
 243.9 
 6.00 Leaf (LF16)  210.9   6.69
 208.3 
 198.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  301.6   29.95
 259.3 
 6.10 Leaf (LF10)  496.4   102.18
 305 
 338.6 
 6.10 Stem base (ST01)  201.7   64.47
 292.9 
 6.10 Stem top (ST02)  234   10.76
 218.8 
 6.10 Flower, open (FL01)  177.6   47.82
 245.2 
 6.30 Silique, young (FS01)  108.6   16.61
 132.1 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  179.7   14.7
 204.2 
 206 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  302.5   11.45
 312.6 
 325.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  228.7   28.29
 177.3 
 182.5 
 Suspension cell culture (SU01)  233.7   50.84
 138.1 
 155.9 
 Suspension cell culture (SU02)  220.5   3.31
 215.8 
 Xylem (XL01)  520.6   169.68
 239.7 
 215.3 
 Cork (CR01)  354.1   38.76
 281.3 
 294.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  628.2   102
 831.8 
 741.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  684.5   121.98
 678.2 
 892.6 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  654.8   115.06
 674.3 
 863.1 
 Heart embryo, roots (EHR1)  616.1   61
 701.6 
 734.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  481   68.67
 560.2 
 617.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  538.2   158.61
 251 
 511.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  562.8   46.83
 564.9 
 644.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  408.9   334
 255.1 
 894.9 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  1075.9   402.32
 959.1 
 328 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress