TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g38710
TIGR annotation:AMMECR1 family
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1238.2   129.69
 992.6 
 1043 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  601.7   50.71
 498.3 
 593.6 
 602.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  609.2   7.95
 615.5 
 596.5 
 608.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  871   9.56
 886.5 
 893.9 
 885.1 
 0.70 Seedling (SL01)  898.7   11.72
 889.9 
 875.5 
 0.70 Seedling (SL02)  1053.3   67.86
 927.5 
 946.4 
 0.70 Seedling (SL10)  1243.5   85.87
 1072.9 
 1175.2 
 0.70 Seedling (SL12)  883.1   2.79
 878.4 
 883.4 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  1528   82.86
 1548.9 
 1396.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1627.6   307.06
 1871.3 
 1261.2 
 1.00 Seedling (SL07)  1062.6   24.38
 1028.1 
 1.00 Seedling (SL09)  1130.3   47.74
 1213.3 
 1212.8 
 1.00 Seedling (SL11)  1071.4   95.94
 1003.2 
 868 
 1071.6 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1045.4   7.22
 1035.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1023.2   107.59
 811.4 
 884 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1113.7   67.25
 1186 
 1051.6 
 1.02 Seedling (SL08)  959.4   62.92
 1048.4 
 1.02 Roots (RT01)  1706.7   30.63
 1750 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1545.3   93.81
 1431.2 
 1617.2 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  765.4   54.09
 843.4 
 739.5 
 1.05 Rosette (LF11)  771   46.23
 699.1 
 785.4 
 1.14 Rosette (LF12)  679.1   68.94
 812.4 
 715 
 1.14 Rosette (LF13)  728.3   46.72
 794.4 
 3.20 Whole plant (WP05)  882.2   23.94
 924.1 
 883.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  717.5   36.29
 645 
 677.7 
 3.70 Adult leaf (LF02)  743.7   50.05
 681.6 
 644.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  777.7   38.3
 724.1 
 798.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  831.8   91.13
 955.7 
 1009.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  871.4   104.39
 1057.4 
 1046.5 
 3.90 Rosette (SH01)  734.4   130.97
 959.3 
 963.2 
 3.90 Roots (RT04)  1035   59.99
 1151.6 
 1117.8 
 3.90 Roots (RT05)  1230.3   43.84
 1282.8 
 1317.4 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  803.6   56.47
 922.9 
 803.2 
 835.7 
 5.10 Flower, buds (FB01)  982   53.03
 1057 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1163.9   45.66
 1247.6 
 1174.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1060.9   18.74
 1060 
 1092.9 
 5.10 Roots (RT02)  1454.7   50.48
 1383.3 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  1085   4.39
 1091.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1197.3   142.84
 995.3 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  470   67.37
 374.7 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  345   59.6
 260.7 
 6.00 Leaf (LF08)  1037.7   87.06
 880.8 
 893.8 
 6.00 Leaf (LF16)  737.4   25.21
 771.3 
 786.6 
 6.00 Inflorescence (IN01)  915.7   135.93
 723.4 
 6.10 Leaf (LF10)  1031.2   155.33
 739.2 
 793.2 
 6.10 Stem base (ST01)  2067.1   186.31
 1803.6 
 6.10 Stem top (ST02)  982.5   81.26
 867.6 
 6.10 Flower, open (FL01)  1172   86.95
 1049 
 6.30 Silique, young (FS01)  965.3   52.72
 1039.8 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1409.3   215.4
 1801.4 
 1450.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  737.4   128.16
 772.9 
 975 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1190.9   74.92
 1048.9 
 1078.3 
 Suspension cell culture (SU01)  947.4   195.45
 1298.6 
 1271.6 
 Suspension cell culture (SU02)  1307.7   42.6
 1247.4 
 Xylem (XL01)  1339.6   277.79
 1230.7 
 1757 
 Cork (CR01)  1428   108.87
 1384.8 
 1221.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  1163   717.25
 1919.2 
 2596.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  961.1   851.89
 2097.7 
 430.2 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  2472.6   2107.82
 386.2 
 4601.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1634   4310.91
 8353 
 314.5 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  2251.7   516.92
 1326 
 2187.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1542.4   523.81
 1243.5 
 2262.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  3137.5   404.05
 2803.7 
 2333.2 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  1581.2   348.61
 2242.5 
 1720.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  836.8   166.16
 642.7 
 506.1 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress