TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g47710
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1462.4   271.3
 1968 
 1544.7 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  326.9   33.49
 364 
 385.3 
 312.3 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  353.8   10.35
 354.2 
 342.8 
 332.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  695.9   25.3
 655.4 
 709.7 
 666.2 
 0.70 Seedling (SL01)  1651.4   238.44
 1948.8 
 2123 
 0.70 Seedling (SL02)  1331   17.48
 1352.9 
 1318.4 
 0.70 Seedling (SL10)  1865.9   136.77
 1674.6 
 1600.9 
 0.70 Seedling (SL12)  891.3   89.66
 1007.1 
 830.6 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  4549.7   131.8
 4812.5 
 4699.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  5768.9   282.07
 6073.7 
 5510.2 
 1.00 Seedling (SL07)  2069.9   244.7
 1723.8 
 1.00 Seedling (SL09)  1417.9   113.94
 1591.1 
 1376.3 
 1.00 Seedling (SL11)  1367.8   107.61
 1397.9 
 1303 
 1556.3 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  5151.6   287.76
 4744.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1467.5   319.79
 889.9 
 940.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  3134.1   200.23
 2882.6 
 3278.3 
 1.02 Seedling (SL08)  2660.2   250.56
 3014.5 
 1.02 Roots (RT01)  1288.6   118.43
 1456.1 
 1.02 Lateral roots (RH01)  470.2   72.69
 467.5 
 594.8 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1514.3   79.8
 1636.8 
 1664.2 
 1.05 Rosette (LF11)  1408.1   100.59
 1494 
 1608.6 
 1.14 Rosette (LF12)  2294.3   439.63
 3132 
 2481.8 
 1.14 Rosette (LF13)  1831.8   189.5
 2099.8 
 3.20 Whole plant (WP05)  3524.3   179.81
 3425.3 
 3175.4 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1641.8   17.95
 1608.6 
 1613.4 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1625.1   71
 1483.2 
 1548.3 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1096.9   203.7
 1429.9 
 1060.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1314.8   354.69
 1751.1 
 2017.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  2126.3   761.76
 3563.6 
 3282.4 
 3.90 Rosette (SH01)  1786.6   140.7
 2066.9 
 1947.9 
 3.90 Roots (RT04)  619.4   36.49
 547.5 
 594.4 
 3.90 Roots (RT05)  628.6   65.61
 595.9 
 502.2 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1385.2   90.61
 1580.6 
 1393.1 
 1438.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  2202.1   190.22
 1933.1 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  2970.7   186.55
 3141.8 
 3343.4 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  3048.3   142.58
 2792.7 
 2810.9 
 5.10 Roots (RT02)  1062.7   48.65
 1131.5 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  500   33.09
 546.8 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  474.9   10.45
 489.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  112   11.9
 128.9 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  194.4   25.02
 159 
 6.00 Leaf (LF08)  2864.1   374.86
 2696.5 
 2147.5 
 6.00 Leaf (LF16)  2112   195.19
 2470 
 2425.7 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1296.9   95.49
 1432 
 6.10 Leaf (LF10)  2217.6   207.24
 1989.9 
 1803.8 
 6.10 Stem base (ST01)  2820.4   120.22
 2990.4 
 6.10 Stem top (ST02)  1469.4   296.5
 1888.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  2454.1   214.51
 2757.4 
 6.30 Silique, young (FS01)  1377.9   157.2
 1600.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  4429.6   567.52
 3403.5 
 3496.4 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  1786.6   508.15
 1855.5 
 2699.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  4039.3   138.09
 4108.4 
 4305.4 
 Suspension cell culture (SU01)  743.2   319.96
 1295.2 
 1299.5 
 Suspension cell culture (SU02)  725.8   45.57
 790.3 
 Xylem (XL01)  6818.7   291.64
 6498.8 
 6236.4 
 Cork (CR01)  6980.3   299.97
 6389.3 
 6774.1 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  3014.9   1367.01
 1558.4 
 282.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  307.5   920.79
 2011.3 
 554 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  2222.6   1079.41
 347.7 
 358.3 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1347.6   1422.07
 3150.9 
 344.6 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1720.7   316.12
 1307.8 
 1929 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1713.9   726.76
 313.3 
 1350.3 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  307.4   573.91
 1248.4 
 208.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  116.4   206.17
 471.8 
 475.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  1038.8   459.14
 397.9 
 148.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress