TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g01420
TIGR annotation:pathogen-responsive alpha-dioxygenase, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  114   6.41
 108 
 120.8 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  213.6   23.06
 261.9 
 214.3 
 239 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  224.7   14.34
 211.3 
 194.3 
 195.8 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  126.9   7.43
 122.3 
 109.3 
 120.2 
 0.70 Seedling (SL01)  942.7   45.28
 922.7 
 856.2 
 0.70 Seedling (SL02)  2389.4   20.68
 2373 
 2348.4 
 0.70 Seedling (SL10)  805   26.15
 785.2 
 753.2 
 0.70 Seedling (SL12)  1181.6   274.32
 633.2 
 892.2 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  93.8   3.89
 87.2 
 94 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  87.5   1.8
 91.1 
 89.6 
 1.00 Seedling (SL07)  1713.4   66.48
 1807.4 
 1.00 Seedling (SL09)  4296.5   75.24
 4184 
 4326.8 
 1.00 Seedling (SL11)  3077.5   285.6
 3074.5 
 3615.4 
 2995.6 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  74   3.14
 78.4 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1988.6   344.51
 1405.3 
 1379.4 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  350.5   8.76
 333 
 342.9 
 1.02 Seedling (SL08)  1112.4   30.59
 1069.1 
 1.02 Roots (RT01)  5574.3   262.8
 5202.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  858.2   613.11
 847 
 1914.5 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  3280.3   608.96
 3220.4 
 4303.8 
 1.05 Rosette (LF11)  114.9   6.81
 109.8 
 101.4 
 1.14 Rosette (LF12)  354.3   100.22
 155.1 
 274.3 
 1.14 Rosette (LF13)  399.5   35.16
 449.2 
 3.20 Whole plant (WP05)  84.3   9.78
 102.7 
 87.6 
 3.70 Adult leaf (LF01)  79.8   8.5
 73.4 
 90.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  86.3   3.04
 81.9 
 87.8 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  84.9   3.71
 83.7 
 90.6 
 3.90 Adult leaf (LF03)  231.1   97.66
 423.9 
 354.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  137.1   48.59
 229 
 210.5 
 3.90 Rosette (SH01)  187.5   233.32
 602.3 
 209.8 
 3.90 Roots (RT04)  2756.4   640.96
 4038.2 
 3413.6 
 3.90 Roots (RT05)  2692.5   292.53
 2398.2 
 2983.3 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  86.9   3.57
 92.2 
 87 
 93.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  41.1   1.64
 43.4 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  87.7   10.44
 67.2 
 73.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  98.9   16.63
 66.5 
 89.1 
 5.10 Roots (RT02)  2413.8   1304.55
 568.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  114.2   23.66
 147.6 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  85.8   25.34
 121.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  133.4   19.69
 161.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  151.6   16.45
 174.9 
 6.00 Leaf (LF08)  134.5   17.97
 118.4 
 98.6 
 6.00 Leaf (LF16)  99.8   10.47
 86.1 
 106.7 
 6.00 Inflorescence (IN01)  208.9   80.87
 94.6 
 6.10 Leaf (LF10)  119.6   56.41
 67.5 
 180.2 
 6.10 Stem base (ST01)  105.1   7.07
 115.1 
 6.10 Stem top (ST02)  86.6   0.53
 85.8 
 6.10 Flower, open (FL01)  71.1   6.97
 61.3 
 6.30 Silique, young (FS01)  81.6   202.35
 367.8 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1580.2   820.23
 1610.5 
 174.9 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  861.4   415.67
 148.4 
 134.8 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1973.9   376.46
 1871.1 
 1276.6 
 Suspension cell culture (SU01)  181.9   60.05
 81.5 
 74.6 
 Suspension cell culture (SU02)  95.8   36.89
 148 
 Xylem (XL01)  66.2   4.33
 67.9 
 74.4 
 Cork (CR01)  108   15.31
 92.6 
 77.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  90   21.69
 108.2 
 133.2 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  204.8   71.66
 79.3 
 82.1 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  62.7   37.01
 136.7 
 97.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  65.9   21.5
 108.6 
 91.9 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  135.8   24.07
 183.3 
 152.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  120.1   185.09
 458.7 
 159.8 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  220.1   17.22
 187 
 211.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  559   206.24
 292.5 
 153.1 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  299.4   52.35
 202 
 283.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress