TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g01520
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  947   281.14
 1308.9 
 755.2 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  2857.4   135.62
 2888.7 
 2965.8 
 2648.5 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  2137.2   37.02
 2131.3 
 2089.6 
 2058.6 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  770   51.24
 729.6 
 647 
 720.4 
 0.70 Seedling (SL01)  1542.5   34.46
 1496.4 
 1475.1 
 0.70 Seedling (SL02)  1495.4   98.86
 1471.5 
 1313.5 
 0.70 Seedling (SL10)  914.4   88.8
 758.6 
 762.8 
 0.70 Seedling (SL12)  1399.3   256.61
 1665.6 
 1152.5 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  3361.5   57.93
 3315.9 
 3246.5 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  3134.3   143.72
 3316.8 
 3033.3 
 1.00 Seedling (SL07)  2190.1   227.78
 1867.9 
 1.00 Seedling (SL09)  2349.5   164.35
 2422 
 2663.4 
 1.00 Seedling (SL11)  1717.2   271.85
 1602.5 
 1999.4 
 1343.7 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  3925.8   246.69
 3576.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1281.6   148.18
 1050.3 
 1005.5 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  3769   119.13
 3716 
 3943.7 
 1.02 Seedling (SL08)  2362.6   2.59
 2358.9 
 1.02 Roots (RT01)  1568.4   303.29
 1997.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  2677.3   172.26
 2600.7 
 2929.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1564.5   97.88
 1716.3 
 1747.5 
 1.05 Rosette (LF11)  859.1   62.73
 753 
 864 
 1.14 Rosette (LF12)  2097.4   274.81
 1549.4 
 1859.8 
 1.14 Rosette (LF13)  1325   126.89
 1504.5 
 3.20 Whole plant (WP05)  1698.4   68.3
 1722.7 
 1594.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  995.9   30.41
 1028.5 
 1056.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1117.6   74.84
 970.9 
 1070 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  2161   132.79
 2228.5 
 1972.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1702.4   826.43
 3180 
 3082.7 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1237.5   775.86
 2617.7 
 2541.8 
 3.90 Rosette (SH01)  1324.3   267.41
 1858.8 
 1605.2 
 3.90 Roots (RT04)  1456.3   266.86
 1899.3 
 1935.6 
 3.90 Roots (RT05)  1713.5   273.68
 1594.7 
 2116.8 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  622.8   26.01
 681.5 
 673.5 
 661.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1167.5   300.63
 742.4 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1353.6   88.22
 1196.8 
 1205 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1540.9   158.56
 1254.7 
 1279.6 
 5.10 Roots (RT02)  1722.9   47.17
 1789.6 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  315.3   11.59
 331.7 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  356.1   15.93
 378.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  475.5   25.21
 511.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  607.8   6.05
 616.4 
 6.00 Leaf (LF08)  2188.9   229.75
 1734.9 
 2023 
 6.00 Leaf (LF16)  1998.8   57.31
 2104.9 
 2089.3 
 6.00 Inflorescence (IN01)  770.1   104.82
 621.9 
 6.10 Leaf (LF10)  1933.2   236.89
 1643.3 
 1463.7 
 6.10 Stem base (ST01)  3537   124.78
 3360.6 
 6.10 Stem top (ST02)  897.1   55.11
 975 
 6.10 Flower, open (FL01)  1247   136.42
 1439.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  601.5   77.01
 710.4 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1671   160.82
 1991.7 
 1810.4 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  1661.1   80.35
 1729.1 
 1568.9 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1691   170.02
 1890.9 
 2029.2 
 Suspension cell culture (SU01)  1446.3   288.25
 1984.6 
 1894.3 
 Suspension cell culture (SU02)  2257.1   204.79
 2546.7 
 Xylem (XL01)  3912.8   144.3
 3761.4 
 3624.3 
 Cork (CR01)  3781.4   184.28
 3702.9 
 4054 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  359.2   395.05
 1141 
 651.6 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  455.7   669.06
 1626.4 
 479.8 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  976.4   298.85
 591.8 
 387.9 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1342.2   546.29
 296.9 
 544.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  719.8   43.82
 806.9 
 755.1 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  681.9   105.76
 760.3 
 891.3 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  409.3   191.95
 668.9 
 294.2 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  918.8   269.29
 380.2 
 647.3 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  1470.2   624.97
 348 
 432.4 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress