TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g06050
TIGR annotation:alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant (AhpC/TSA)/mal allergen family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1736.1   54.68
 1726.5 
 1637 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  2397.8   113.31
 2232.5 
 2464.8 
 2249.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  3189.8   227.1
 3513.2 
 3144.6 
 2968.6 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  1622.9   90.61
 1787.6 
 1818.8 
 1800.5 
 0.70 Seedling (SL01)  915.8   50.95
 993 
 896.9 
 0.70 Seedling (SL02)  1244.4   19.9
 1222.4 
 1262.2 
 0.70 Seedling (SL10)  2389.9   105.37
 2384.9 
 2204.9 
 0.70 Seedling (SL12)  1270.6   115.72
 1130.4 
 1360 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  803.4   62.52
 928.4 
 863.5 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1032.1   52.47
 1097.8 
 994.1 
 1.00 Seedling (SL07)  750.5   13.31
 731.7 
 1.00 Seedling (SL09)  1046.2   40.86
 1049.9 
 1118.7 
 1.00 Seedling (SL11)  1291.8   141.72
 1264.9 
 1509 
 1535.7 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  773.4   6.49
 782.6 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  881.6   274.83
 1392.9 
 1312.2 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1131.7   53.42
 1060.3 
 1164.9 
 1.02 Seedling (SL08)  1423.3   16.25
 1446.3 
 1.02 Roots (RT01)  1303.1   257.34
 1667 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1718.2   48.83
 1625.2 
 1697.6 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1494   189.83
 1471.9 
 1154.7 
 1.05 Rosette (LF11)  1159.2   103.35
 1016.9 
 1217.9 
 1.14 Rosette (LF12)  1630.6   174.69
 1454.9 
 1804.2 
 1.14 Rosette (LF13)  1215.9   38.33
 1161.7 
 3.20 Whole plant (WP05)  1619.3   94.56
 1548.2 
 1432 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1539.2   47.73
 1456.5 
 1456.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1586.2   26.36
 1534.8 
 1570.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1539.8   249.29
 1193.2 
 1056.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  856.6   102.23
 1018.8 
 1045.6 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  700.9   171.61
 1034.7 
 937 
 3.90 Rosette (SH01)  1432.5   182.8
 1792 
 1669.9 
 3.90 Roots (RT04)  1083   113.28
 1287.6 
 1101 
 3.90 Roots (RT05)  1085.8   45.22
 1033.5 
 1123.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1123.1   103.49
 1332.5 
 1141.6 
 1115.3 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1491.5   7.77
 1480.6 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  750.1   207.54
 1097.1 
 1121 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  730.4   428.66
 1587.7 
 1163.1 
 5.10 Roots (RT02)  832.2   25.51
 868.2 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  1389.6   258.31
 1024.3 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1782.3   422.4
 1184.9 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  2602.6   441.74
 1977.8 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  1223.3   413.65
 638.3 
 6.00 Leaf (LF08)  1662.4   193.74
 1395.3 
 1285.7 
 6.00 Leaf (LF16)  929.4   38.44
 1001 
 989.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  436.2   61.63
 523.4 
 6.10 Leaf (LF10)  1072.4   126.52
 1324.4 
 1217.6 
 6.10 Stem base (ST01)  870.3   46.29
 804.8 
 6.10 Stem top (ST02)  1082.4   93.74
 949.8 
 6.10 Flower, open (FL01)  1000.1   111.25
 1157.4 
 6.30 Silique, young (FS01)  1056.3   0.57
 1055.4 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  645.6   75.84
 742.7 
 795.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  2342.3   143.9
 2153.6 
 2059.7 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1106.1   115.85
 908.4 
 1111.9 
 Suspension cell culture (SU01)  1066.3   129.24
 1323.8 
 1214.4 
 Suspension cell culture (SU02)  958.4   125.13
 781.4 
 Xylem (XL01)  739.2   38.95
 671.9 
 739.5 
 Cork (CR01)  1132   91.17
 967.6 
 981.5 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  557.8   108.91
 465.7 
 682.7 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  272.1   171.93
 578.7 
 290.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1178.7   449.36
 422 
 380.4 
 Heart embryo, roots (EHR1)  509.5   342.02
 1033.2 
 1152.4 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  925.9   231.92
 854.4 
 493.3 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  717.1   308.37
 227.7 
 797.4 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  213.5   138.03
 458.8 
 445.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  216.6   47.23
 272.8 
 310.4 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  366.4   122.07
 122.3 
 249.7 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress