TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g11480
TIGR annotation:S-adenosyl-L-methionine:carboxyl methyltransferase family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  90.9   30.22
 120 
 151.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  210.3   32.49
 173.5 
 251.4 
 224.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  149.3   34.56
 222 
 217.8 
 214.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  103.4   17.94
 130.4 
 141.3 
 141.6 
 0.70 Seedling (SL01)  167.1   22.32
 183.8 
 139.6 
 0.70 Seedling (SL02)  121.2   3.7
 113.8 
 117.4 
 0.70 Seedling (SL10)  40.9   10.99
 62.5 
 48.1 
 0.70 Seedling (SL12)  90.4   11.22
 112.5 
 97.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  103.5   9.86
 83.8 
 94.8 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  77.8   11.54
 85.2 
 100.4 
 1.00 Seedling (SL07)  140   15.72
 117.7 
 1.00 Seedling (SL09)  42.6   4.43
 51.3 
 48.3 
 1.00 Seedling (SL11)  97.4   28.48
 84.4 
 41.3 
 43.6 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  95   6.96
 104.8 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  158.8   13.52
 152.5 
 132.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  140.5   5.47
 149.2 
 150.6 
 1.02 Seedling (SL08)  109.4   18.33
 135.3 
 1.02 Roots (RT01)  118.8   17.42
 143.4 
 1.02 Lateral roots (RH01)  150.5   4.77
 160 
 155.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  148.3   27.71
 135.4 
 95.2 
 1.05 Rosette (LF11)  140.4   8.48
 127.1 
 142.9 
 1.14 Rosette (LF12)  137.8   2.57
 136.1 
 141.2 
 1.14 Rosette (LF13)  108.4   1.22
 106.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  117.8   9.66
 128 
 137.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  128.7   15.51
 156.3 
 130.3 
 3.70 Adult leaf (LF02)  170.8   17.3
 147.1 
 180.8 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  137.9   10.24
 144.2 
 157.9 
 3.90 Adult leaf (LF03)  279.4   70.68
 169.6 
 147.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  245   58.93
 131.4 
 161 
 3.90 Rosette (SH01)  135.1   14.09
 136.1 
 160 
 3.90 Roots (RT04)  111.4   5
 113.6 
 104.1 
 3.90 Roots (RT05)  91   30.3
 133.6 
 149.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  130.8   6.33
 120.5 
 134.2 
 123.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  560.5   329.14
 1025.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  934.6   287.73
 426.8 
 915.1 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  484.3   86.32
 652.3 
 602.8 
 5.10 Roots (RT02)  139.7   30.88
 96.1 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  221.3   14.02
 241.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  145.6   49.3
 215.3 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  224.4   35.76
 275 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  205.3   32.65
 251.4 
 6.00 Leaf (LF08)  175   36.06
 225.7 
 155.8 
 6.00 Leaf (LF16)  53   2.17
 53.4 
 49.4 
 6.00 Inflorescence (IN01)  315.9   79.79
 203 
 6.10 Leaf (LF10)  165.1   21.66
 129.6 
 125.8 
 6.10 Stem base (ST01)  154.9   43.28
 216.1 
 6.10 Stem top (ST02)  345.8   89.12
 471.8 
 6.10 Flower, open (FL01)  162.9   55.12
 240.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  88.8   121.37
 260.4 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  166.7   23.78
 121.7 
 130.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  222   31.45
 207 
 161.6 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  179.9   32.27
 152.8 
 115.7 
 Suspension cell culture (SU01)  122.2   3.56
 129.1 
 127.2 
 Suspension cell culture (SU02)  191.5   55.94
 112.4 
 Xylem (XL01)  128.6   13.15
 104 
 108.3 
 Cork (CR01)  97.9   3.89
 90.2 
 94.9 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  395.3   95.86
 294.9 
 486.6 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  385.7   74
 454.5 
 533.6 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  333.7   116.67
 194 
 425.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  336.1   74.04
 396.7 
 483.4 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  176   26.83
 213.6 
 228 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  210.3   45.05
 139.9 
 223.9 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  536.2   128.4
 307.3 
 320.8 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  184.6   231.08
 154 
 568.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  420.4   57.86
 498.1 
 385 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress