TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g15170
TIGR annotation:cup-shaped cotyledon1 protein / CUC1 protein (CUC1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  117.1   5.84
 106.5 
 107.6 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  94.3   20.28
 130.6 
 85.1 
 93.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  79.9   7.35
 87.5 
 78.6 
 94.4 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  102.8   19.24
 120.8 
 136 
 92.6 
 0.70 Seedling (SL01)  126.4   20.48
 139.9 
 99.7 
 0.70 Seedling (SL02)  109.4   13.8
 118.2 
 91.2 
 0.70 Seedling (SL10)  68.4   2.93
 64.3 
 70 
 0.70 Seedling (SL12)  70.7   3.81
 75 
 78.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  86.1   2.11
 89.2 
 90.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  94   2.2
 95.7 
 98.3 
 1.00 Seedling (SL07)  77.3   11.74
 93.9 
 1.00 Seedling (SL09)  58.4   6.69
 61.1 
 48.4 
 1.00 Seedling (SL11)  53.6   15.69
 70.3 
 32.2 
 48.2 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  103.2   1.47
 101.1 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  104   6.58
 117.1 
 110.6 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  127.3   17.51
 92.3 
 112 
 1.02 Seedling (SL08)  76.1   13.49
 57 
 1.02 Roots (RT01)  84.1   3.06
 88.5 
 1.02 Lateral roots (RH01)  98   13.13
 95.4 
 74.1 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  104.4   19.17
 108.1 
 73.2 
 1.05 Rosette (LF11)  91.3   7.13
 94.5 
 104.9 
 1.14 Rosette (LF12)  88.6   8.28
 77.5 
 93.7 
 1.14 Rosette (LF13)  99.8   3.4
 95 
 3.20 Whole plant (WP05)  76.5   6.45
 89.3 
 82.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  100.6   5.67
 107.2 
 111.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  95.2   1.62
 97.3 
 98.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  102.5   13.48
 127.4 
 123.8 
 3.90 Adult leaf (LF03)  109.1   14.91
 82.6 
 107.6 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  122.5   14.77
 95.3 
 99 
 3.90 Rosette (SH01)  86.5   26.7
 133.2 
 132.3 
 3.90 Roots (RT04)  102.1   3.36
 107.6 
 101.4 
 3.90 Roots (RT05)  96.9   15.59
 127.2 
 118.4 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  130.5   19.63
 106 
 102.9 
 82.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  69.5   2.43
 73 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  132   28.87
 77.1 
 89.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  100.3   11.4
 78.2 
 84.6 
 5.10 Roots (RT02)  80.8   0.08
 81 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  124.4   23.46
 157.6 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  104.3   32.13
 149.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  145.9   3.23
 141.3 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  146.4   30.21
 189.1 
 6.00 Leaf (LF08)  86.2   16.67
 69 
 102.3 
 6.00 Leaf (LF16)  57.6   0.84
 56.6 
 58.3 
 6.00 Inflorescence (IN01)  150.3   25.3
 114.5 
 6.10 Leaf (LF10)  122.9   15.14
 93 
 104.1 
 6.10 Stem base (ST01)  91.2   14.69
 112 
 6.10 Stem top (ST02)  118.1   3.15
 113.6 
 6.10 Flower, open (FL01)  55.8   4.37
 62 
 6.30 Silique, young (FS01)  62.4   0.35
 61.9 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  91.9   4.05
 87.7 
 83.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  89.3   17.08
 88.1 
 118.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  95.4   5.66
 85.8 
 85.3 
 Suspension cell culture (SU01)  195.2   19.03
 157.5 
 172 
 Suspension cell culture (SU02)  156.8   5.44
 164.5 
 Xylem (XL01)  74.5   2.19
 77.7 
 73.5 
 Cork (CR01)  127.7   13.21
 116.7 
 101.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  295.9   49.37
 344.8 
 246.1 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  2496.6   1262.69
 392.6 
 235 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  562.1   173.43
 262.6 
 260.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  209.9   16.74
 242.6 
 220 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  142.3   36.83
 214.1 
 192.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  166.1   108.41
 330.2 
 125.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  256.4   81.28
 163.3 
 325.3 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  312.9   102.95
 245.6 
 110.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  172.3   30.83
 216.4 
 157.1 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress