TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g16670
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  255.8   35.75
 270.2 
 323.6 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  366.3   26.07
 333.3 
 378.6 
 394.8 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  374.7   25.67
 331 
 316.4 
 327.4 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  305.4   14.81
 318.6 
 283 
 298.8 
 0.70 Seedling (SL01)  290.2   6.09
 284.3 
 278 
 0.70 Seedling (SL02)  550.3   113.21
 563.5 
 361.1 
 0.70 Seedling (SL10)  232.8   16.73
 199.6 
 219.9 
 0.70 Seedling (SL12)  236.2   31.71
 278.5 
 298.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  242.5   35.72
 172.3 
 195.7 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  225.6   15.61
 202.6 
 195.8 
 1.00 Seedling (SL07)  330.8   2.77
 334.7 
 1.00 Seedling (SL09)  815.8   242.75
 357.5 
 448 
 1.00 Seedling (SL11)  521   155.93
 708.7 
 360.4 
 402.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  217.3   2.94
 221.4 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  493   172.07
 631 
 835 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  296.5   8.34
 299.5 
 312.2 
 1.02 Seedling (SL08)  2595.3   247.32
 2245.5 
 1.02 Roots (RT01)  205.8   8.32
 217.6 
 1.02 Lateral roots (RH01)  282.1   48.77
 309.4 
 214.7 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1408   474.83
 886.7 
 460 
 1.05 Rosette (LF11)  944.1   173.85
 1249.3 
 1240.9 
 1.14 Rosette (LF12)  789.5   126.36
 556.9 
 758.8 
 1.14 Rosette (LF13)  1871.2   132.89
 2059.1 
 3.20 Whole plant (WP05)  825.1   7.98
 809.2 
 818.3 
 3.70 Adult leaf (LF01)  2386.1   201.54
 2636.2 
 2237.4 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1869.8   75.69
 1718.7 
 1786.2 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  264.8   8.26
 248.4 
 254.7 
 3.90 Adult leaf (LF03)  407.8   51.78
 510.1 
 473.2 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  417   208.88
 645.1 
 834.1 
 3.90 Rosette (SH01)  701   191.78
 644.2 
 344.1 
 3.90 Roots (RT04)  266.5   25.04
 302.2 
 254 
 3.90 Roots (RT05)  300.4   69.36
 412.1 
 427.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  3062.2   289
 2630.9 
 2783.4 
 2371 
 5.10 Flower, buds (FB01)  122.5   4.15
 128.3 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  272.4   24.91
 227.3 
 231.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  261.7   16.01
 244.4 
 229.7 
 5.10 Roots (RT02)  253.9   11.21
 238 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  307.1   32.28
 352.8 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  264   78.05
 374.4 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  421.3   41.03
 479.3 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  507.1   50.34
 578.3 
 6.00 Leaf (LF08)  537.4   88.84
 399.5 
 371.4 
 6.00 Leaf (LF16)  2516.5   163.92
 2745.3 
 2834.3 
 6.00 Inflorescence (IN01)  544.6   167.97
 307.1 
 6.10 Leaf (LF10)  497   56.4
 384.7 
 431.1 
 6.10 Stem base (ST01)  251   40.89
 308.8 
 6.10 Stem top (ST02)  263.3   5.09
 256.1 
 6.10 Flower, open (FL01)  141.5   7.56
 130.8 
 6.30 Silique, young (FS01)  141.8   2.22
 138.7 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  298.2   5.04
 304 
 294 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  276.1   18.21
 290.8 
 254.6 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  302.6   48.76
 296.6 
 215.3 
 Suspension cell culture (SU01)  316.9   44.26
 234.7 
 247.3 
 Suspension cell culture (SU02)  319   73.29
 422.6 
 Xylem (XL01)  219.3   5.67
 208 
 212.9 
 Cork (CR01)  208.6   5.59
 197.4 
 202.2 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  423.4   58.81
 539.4 
 497.7 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  501   20.81
 461.7 
 493.3 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  385   94.49
 572.2 
 500.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  395.5   72.11
 539.7 
 465.8 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  305   32.36
 362.6 
 359.3 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  336.5   238.55
 737.7 
 313.4 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  626   118.55
 411 
 605.1 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  1065.4   284.62
 615.2 
 538.5 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  699.8   243.44
 994.1 
 511.1 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress