TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g18440
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  287.3   13.28
 271.7 
 298.1 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  353   81.77
 234.4 
 397.3 
 416.8 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  374.5   23.89
 346.8 
 320.4 
 329 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  270.4   10.71
 274.3 
 264 
 249.9 
 0.70 Seedling (SL01)  233.7   5.71
 243.2 
 233 
 0.70 Seedling (SL02)  206.7   19.69
 170.6 
 202.2 
 0.70 Seedling (SL10)  238.8   17.72
 204.6 
 213.6 
 0.70 Seedling (SL12)  168   18.51
 204.9 
 183.6 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  338.8   15.53
 360.5 
 368.9 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  371.6   18.55
 350.3 
 387.3 
 1.00 Seedling (SL07)  321.3   1.81
 323.8 
 1.00 Seedling (SL09)  177.3   5.34
 181.9 
 171.2 
 1.00 Seedling (SL11)  222.9   19.48
 223.3 
 200.6 
 183 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  369.7   17.3
 345.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  368.9   18.33
 342.9 
 333.6 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  241.9   12.42
 225.5 
 249.9 
 1.02 Seedling (SL08)  339   33.7
 386.7 
 1.02 Roots (RT01)  369.2   5.89
 360.9 
 1.02 Lateral roots (RH01)  498.1   39.72
 521.1 
 443.8 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  355.6   28.24
 356.4 
 307.1 
 1.05 Rosette (LF11)  273.6   22.48
 312.5 
 273.5 
 1.14 Rosette (LF12)  420.1   10.63
 440.7 
 434.7 
 1.14 Rosette (LF13)  224   12.39
 241.5 
 3.20 Whole plant (WP05)  191.4   2.15
 189.4 
 193.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  226.4   6.82
 237.1 
 239 
 3.70 Adult leaf (LF02)  268.5   25.08
 229.2 
 275.9 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  382.3   21.22
 369.3 
 340.8 
 3.90 Adult leaf (LF03)  361.4   51.55
 262 
 288 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  443   91.14
 298.8 
 274.3 
 3.90 Rosette (SH01)  282.9   33.76
 320.7 
 350.3 
 3.90 Roots (RT04)  321.6   18.49
 297.6 
 285.3 
 3.90 Roots (RT05)  278.6   44.19
 352.8 
 357.3 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  264.9   12.48
 251.3 
 250.4 
 276.7 
 5.10 Flower, buds (FB01)  227.2   23.38
 194.1 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  449.5   85.27
 313.5 
 292.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  365.2   35.85
 362.5 
 301.8 
 5.10 Roots (RT02)  339.3   71.66
 237.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  400.6   22.71
 432.7 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  419.8   36.16
 470.9 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  252.5   29.43
 294.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  166.1   105.33
 315 
 6.00 Leaf (LF08)  418.2   61.09
 337.4 
 298.4 
 6.00 Leaf (LF16)  251.6   21.53
 208.8 
 234.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  345.2   34.28
 393.6 
 6.10 Leaf (LF10)  399.4   57.21
 298.8 
 301.9 
 6.10 Stem base (ST01)  467.9   38.08
 521.8 
 6.10 Stem top (ST02)  351.6   21.15
 381.5 
 6.10 Flower, open (FL01)  361.8   15.22
 383.3 
 6.30 Silique, young (FS01)  204.7   16.61
 228.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  338.8   54.1
 375.1 
 445.2 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  335.8   23.92
 313 
 288 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  476.6   15.54
 458.9 
 445.7 
 Suspension cell culture (SU01)  500.5   8.94
 482.7 
 491.7 
 Suspension cell culture (SU02)  457.4   84.77
 337.5 
 Xylem (XL01)  443.9   33.39
 388.3 
 384.1 
 Cork (CR01)  374.8   10.26
 390.8 
 393.9 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  396.3   31.54
 434.6 
 458.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  279   163.62
 438.9 
 606.2 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  186   214.25
 613.6 
 424 
 Heart embryo, roots (EHR1)  211.4   125.29
 333.1 
 461.9 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  190   18.55
 220 
 186 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  242.5   227.63
 652 
 274.9 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  275.6   5.66
 267 
 264.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  604   216.8
 635 
 244.9 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  368.3   57.43
 253.6 
 306.7 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress