TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g19760
TIGR annotation:eukaryotic translation initiation factor 4A, putative / eIF-4A, putative / DEAD box RNA helicase, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  2010.6   173.7
 2006.4 
 1707.7 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  1218.8   73.26
 1045.9 
 1114.2 
 1091.2 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  1250.8   76.5
 1372.8 
 1402.3 
 1263.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  1751.4   74.19
 1725.6 
 1837.8 
 1658.4 
 0.70 Seedling (SL01)  1066.8   6.3
 1061.4 
 1074 
 0.70 Seedling (SL02)  1262.6   35.56
 1194.9 
 1247.5 
 0.70 Seedling (SL10)  1889.2   150.32
 2174.8 
 2113.2 
 0.70 Seedling (SL12)  1756.9   74.62
 1653.4 
 1798.2 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  1273.9   44.21
 1338.9 
 1358.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1037   75.82
 1024.1 
 899.7 
 1.00 Seedling (SL07)  1165.3   0.19
 1165.1 
 1.00 Seedling (SL09)  1603.8   80.71
 1738.2 
 1593.6 
 1.00 Seedling (SL11)  1083   329.34
 1188 
 1564.7 
 1791.2 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  871.4   54.46
 948.4 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1174.8   28.66
 1161.2 
 1216.2 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  940.9   107.2
 864.9 
 729.3 
 1.02 Seedling (SL08)  1108.8   77.68
 999 
 1.02 Roots (RT01)  1705.9   217.1
 1398.9 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1336.8   207.44
 1249 
 1644.1 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1285.6   65.9
 1348.4 
 1216.7 
 1.05 Rosette (LF11)  1024.5   105.56
 1145.4 
 1234.9 
 1.14 Rosette (LF12)  897.5   77.79
 952.6 
 1051.1 
 1.14 Rosette (LF13)  1280.9   85.7
 1402.1 
 3.20 Whole plant (WP05)  629.2   30.97
 567.7 
 604.8 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1131.3   25.09
 1094.1 
 1083.5 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1013.3   24.44
 1059 
 1021 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1122.8   177.78
 820.7 
 809.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  807   94.02
 966.4 
 973.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  778.9   122.63
 1021.2 
 867 
 3.90 Rosette (SH01)  1299   85.38
 1244.8 
 1131.7 
 3.90 Roots (RT04)  1305.1   129.63
 1135.4 
 1050.6 
 3.90 Roots (RT05)  956.3   105.08
 983.7 
 789.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1266.5   109.68
 1403.6 
 1236 
 1138.2 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1525.2   7.8
 1536.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1246.1   191.32
 1625.8 
 1476.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1280.6   153.17
 1583.9 
 1395.3 
 5.10 Roots (RT02)  1135.4   120.62
 1306 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  1312.8   277.16
 920.8 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1340.8   286.35
 935.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  763.2   132.58
 575.7 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  909.6   12.03
 892.6 
 6.00 Leaf (LF08)  939.4   42.65
 1005.8 
 926.3 
 6.00 Leaf (LF16)  1248.1   221.37
 1507 
 1688.6 
 6.00 Inflorescence (IN01)  749.8   292.09
 1162.9 
 6.10 Leaf (LF10)  777.6   193.67
 1140.1 
 1077 
 6.10 Stem base (ST01)  1330.1   215.06
 1025.9 
 6.10 Stem top (ST02)  1336.9   14
 1356.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  1787.2   77.37
 1677.8 
 6.30 Silique, young (FS01)  1493.5   53.29
 1418.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  485.4   84.79
 593.1 
 652.7 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  1386.1   454.13
 1691.2 
 2279.5 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  481.8   128.98
 595.9 
 739.2 
 Suspension cell culture (SU01)  1112.3   183.98
 1456.6 
 1396.8 
 Suspension cell culture (SU02)  1584.2   414.97
 997.3 
 Xylem (XL01)  1165.5   49.04
 1260.5 
 1234.2 
 Cork (CR01)  1337.2   121.96
 1347.4 
 1553.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  887.8   412.44
 692.9 
 96.2 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  1444.3   657.44
 523.6 
 170.9 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1338.3   630.52
 234.4 
 258.3 
 Heart embryo, roots (EHR1)  705.8   285.19
 219.1 
 205 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1553.3   355.67
 863.7 
 1359.7 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1215.6   565.67
 366.2 
 1438.1 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  241.8   536.37
 833.3 
 1312.5 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  112.4   520.71
 612.2 
 1153.5 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  437.8   129.08
 205.3 
 224.3 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress