TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g20340
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  115.7   39.84
 187.6 
 121.8 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  436   24.83
 384.6 
 415 
 385.8 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  395.4   16.63
 354.9 
 377.9 
 378 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  261   48.12
 162.1 
 176.7 
 240.7 
 0.70 Seedling (SL01)  236.2   5.07
 226.6 
 234.2 
 0.70 Seedling (SL02)  162.9   9
 147.8 
 163.8 
 0.70 Seedling (SL10)  91.8   3.97
 84.4 
 85.6 
 0.70 Seedling (SL12)  207.7   59.58
 291.2 
 175.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  258.4   20.31
 298.4 
 272.8 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  147.6   10.32
 165.1 
 165.8 
 1.00 Seedling (SL07)  342   43.07
 402.9 
 1.00 Seedling (SL09)  141.8   1.89
 138.8 
 138.3 
 1.00 Seedling (SL11)  111.7   47.87
 109 
 166.8 
 208.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  74.3   0.25
 74.6 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  132.8   16.35
 106.7 
 102.6 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  494.4   31.05
 536.6 
 554.9 
 1.02 Seedling (SL08)  234   16.34
 257.2 
 1.02 Roots (RT01)  434.2   82.47
 317.6 
 1.02 Lateral roots (RH01)  188.5   16.79
 179.1 
 211.8 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  171.2   19.24
 193.2 
 154.9 
 1.05 Rosette (LF11)  94.7   0.92
 92.9 
 94.3 
 1.14 Rosette (LF12)  90.4   7.01
 76.3 
 83.9 
 1.14 Rosette (LF13)  78.7   57.87
 160.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  118.1   5.17
 119.7 
 110 
 3.70 Adult leaf (LF01)  82.3   9.01
 79.4 
 96.3 
 3.70 Adult leaf (LF02)  87.7   2.06
 90.7 
 91.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  71.1   9.97
 64.6 
 84.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  187.5   35.32
 218.9 
 148.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  177.8   31.67
 240.9 
 213.8 
 3.90 Rosette (SH01)  102.2   19.8
 136.8 
 136.3 
 3.90 Roots (RT04)  380.1   108.87
 589.1 
 537.5 
 3.90 Roots (RT05)  292.6   51.67
 321.4 
 393 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  86.2   3.83
 85.6 
 92.8 
 92.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  146.5   47.85
 78.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  453.5   159.23
 255.7 
 138.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  154.4   13.44
 127.9 
 137 
 5.10 Roots (RT02)  625.6   61.67
 712.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  125.9   43.97
 188.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  106.6   34.21
 155 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  166.1   28.24
 206.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  164.7   60.37
 250.1 
 6.00 Leaf (LF08)  81.1   10.94
 103 
 91.5 
 6.00 Leaf (LF16)  309.4   18.88
 276.1 
 277.4 
 6.00 Inflorescence (IN01)  149   32.31
 103.3 
 6.10 Leaf (LF10)  135.6   24.61
 93 
 92.9 
 6.10 Stem base (ST01)  459.5   20.62
 430.4 
 6.10 Stem top (ST02)  112.7   43.36
 174 
 6.10 Flower, open (FL01)  58.8   8.41
 46.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  56.8   11.15
 72.6 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  631.9   203.39
 318.7 
 250.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  281.4   92.95
 151.5 
 101.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  283.9   75.49
 147.8 
 159.2 
 Suspension cell culture (SU01)  140.7   39.3
 68.8 
 77.2 
 Suspension cell culture (SU02)  104   9.07
 91.2 
 Xylem (XL01)  92.5   4.89
 101.7 
 94.2 
 Cork (CR01)  126.2   1.16
 126.7 
 128.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  195.2   77.35
 349.4 
 261.6 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  190.9   76.77
 224.3 
 337.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  162.3   82.21
 287.1 
 317.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  216.6   12.51
 240.8 
 234.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  203.6   7.57
 204.7 
 217.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  208.1   15.08
 224.2 
 194.1 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  320.7   118.51
 208 
 444.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  211.1   381.24
 122.5 
 822.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  223.9   262.2
 462.1 
 747.6 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress