TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g21210
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein / DC1 domain-containing protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  75.6   22.02
 93.9 
 119.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  122   10.53
 143.9 
 143.1 
 142 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  156.8   12.23
 133.8 
 144 
 129.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  114.9   9.89
 128.7 
 105.6 
 110.7 
 0.70 Seedling (SL01)  106.2   9.5
 123.8 
 108.9 
 0.70 Seedling (SL02)  88.9   0.93
 87.6 
 89.4 
 0.70 Seedling (SL10)  57.6   5.99
 63.9 
 69.6 
 0.70 Seedling (SL12)  66.8   7.64
 63.4 
 78 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  95.1   13.32
 69.9 
 75 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  73.9   11.3
 71.8 
 92.3 
 1.00 Seedling (SL07)  110.1   0.72
 109.1 
 1.00 Seedling (SL09)  45.5   2.5
 48 
 50.5 
 1.00 Seedling (SL11)  72.7   14.37
 72.8 
 47.1 
 48.6 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  78.2   4.7
 84.8 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  102.1   8.21
 95.2 
 85.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  86.8   12.9
 85 
 108.2 
 1.02 Seedling (SL08)  90.3   12.77
 108.3 
 1.02 Roots (RT01)  80.5   3.29
 75.9 
 1.02 Lateral roots (RH01)  98.7   19.16
 124.4 
 86.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  88.7   9.57
 88.6 
 72.1 
 1.05 Rosette (LF11)  85.1   6.33
 97.3 
 94.2 
 1.14 Rosette (LF12)  93.6   8.67
 108.2 
 92.7 
 1.14 Rosette (LF13)  80.4   7.91
 69.2 
 3.20 Whole plant (WP05)  67.8   1.21
 69 
 66.6 
 3.70 Adult leaf (LF01)  83.5   7.07
 97.6 
 89.7 
 3.70 Adult leaf (LF02)  90.5   4.58
 97.2 
 99.3 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  91.7   5.72
 101.9 
 101.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  144.1   28.3
 92.3 
 98.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  103   10.08
 108 
 122.4 
 3.90 Rosette (SH01)  82.3   7.59
 94.6 
 96.1 
 3.90 Roots (RT04)  93.5   10.61
 109.9 
 90 
 3.90 Roots (RT05)  94.3   16.84
 113.7 
 127.9 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  98.7   11.21
 98.4 
 100.5 
 121.5 
 5.10 Flower, buds (FB01)  49.7   0.07
 49.6 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  86.5   10.54
 70.4 
 66.6 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  94.5   9.08
 83.6 
 76.5 
 5.10 Roots (RT02)  95.5   5.32
 88 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  125.6   12.35
 143.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  113.9   16.51
 137.3 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  146   41.14
 204.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  164.9   29.37
 206.5 
 6.00 Leaf (LF08)  90.9   7.34
 102.7 
 89.3 
 6.00 Leaf (LF16)  49.3   7.79
 60.5 
 45.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  127.2   21.23
 97.1 
 6.10 Leaf (LF10)  85   7.84
 98.4 
 98.7 
 6.10 Stem base (ST01)  101.8   13.22
 120.5 
 6.10 Stem top (ST02)  92.5   9.4
 105.8 
 6.10 Flower, open (FL01)  55.3   1.8
 57.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  61   2.94
 56.8 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  101.2   5.04
 101.6 
 92.7 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  94.7   6.49
 101 
 88 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  125.6   20.31
 107.3 
 85 
 Suspension cell culture (SU01)  172.7   46.34
 97.7 
 88.1 
 Suspension cell culture (SU02)  124.8   30.03
 82.4 
 Xylem (XL01)  80.9   6.13
 73.2 
 68.8 
 Cork (CR01)  78   2.56
 78 
 82.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  234.4   83.18
 361.2 
 204.5 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  346.1   41.96
 267 
 330.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  237.3   64.26
 349.1 
 238.3 
 Heart embryo, roots (EHR1)  188.5   49.44
 251.6 
 286 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  172.5   30.7
 230 
 219.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  182.8   7.97
 179.4 
 194.6 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  298.1   65.59
 311.4 
 191.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  310.1   77.53
 159.9 
 268.1 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  444.3   133.55
 548.7 
 283.6 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress