TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g25530
TIGR annotation:6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding domain-containing protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1139.4   247.1
 1531.7 
 1075.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  229   42.21
 313 
 231.2 
 225.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  241.6   18.73
 222.3 
 235.3 
 266.9 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  792.1   126.53
 986.1 
 1046.9 
 812 
 0.70 Seedling (SL01)  1430.7   46.72
 1398.9 
 1490.9 
 0.70 Seedling (SL02)  1397   88.6
 1531 
 1564.4 
 0.70 Seedling (SL10)  1484.4   114.55
 1560.7 
 1335.5 
 0.70 Seedling (SL12)  1391.5   109.18
 1215.1 
 1414.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  679.5   37.45
 754.4 
 715.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  677.8   79.97
 644.3 
 525.6 
 1.00 Seedling (SL07)  1407.7   11.75
 1391.1 
 1.00 Seedling (SL09)  868.2   45.03
 799.5 
 884.3 
 1.00 Seedling (SL11)  1373.1   134.53
 1301.8 
 1199.8 
 1520 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  469   57.95
 387 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1461.3   45.78
 1405.3 
 1370.6 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  948.1   34.68
 1001.4 
 1013.2 
 1.02 Seedling (SL08)  1003.9   80.66
 1118 
 1.02 Roots (RT01)  1331   128.54
 1149.2 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1256.9   34.78
 1245.1 
 1191.7 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1401   62.89
 1343.3 
 1275.4 
 1.05 Rosette (LF11)  1595.4   80.6
 1450.7 
 1461.6 
 1.14 Rosette (LF12)  1456.2   143.44
 1742.9 
 1591.8 
 1.14 Rosette (LF13)  1574.1   21.02
 1544.4 
 3.20 Whole plant (WP05)  1159   79.72
 1023.8 
 1018.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1784.2   40.35
 1716.5 
 1712.3 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1919.6   50.87
 1859.7 
 1818.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1853.1   69.94
 1988.1 
 1888.9 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1522.9   334.99
 938.7 
 946.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1915.9   589.09
 847.9 
 951.1 
 3.90 Rosette (SH01)  1152.5   92.57
 1011.9 
 1186.5 
 3.90 Roots (RT04)  824.5   82.3
 667.6 
 702.9 
 3.90 Roots (RT05)  978.9   144.72
 979.4 
 728.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1303.9   20.45
 1274.9 
 1296.8 
 1324.5 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1207.2   64.99
 1299.1 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1313.2   82.17
 1148.9 
 1232.3 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1434.4   221.65
 1474.8 
 1072.3 
 5.10 Roots (RT02)  1045.3   49.24
 1114.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  973   76.98
 1081.9 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1109   15.36
 1130.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  436.6   16.42
 459.8 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  332.7   76.09
 225.1 
 6.00 Leaf (LF08)  1318.8   42.83
 1341.4 
 1401.6 
 6.00 Leaf (LF16)  746.7   46.27
 838.8 
 800.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1126.4   80.31
 1012.8 
 6.10 Leaf (LF10)  1618.1   73.79
 1642.4 
 1504.2 
 6.10 Stem base (ST01)  1404.3   135.06
 1595.3 
 6.10 Stem top (ST02)  1741   18.18
 1766.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  1243.1   35.47
 1293.3 
 6.30 Silique, young (FS01)  1834   84.38
 1953.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  2223   250.48
 1948.3 
 1722.9 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  178.8   125.19
 265.6 
 425.6 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1501   72.32
 1468.3 
 1362.6 
 Suspension cell culture (SU01)  536.7   38.22
 483.9 
 462.4 
 Suspension cell culture (SU02)  590.1   59.18
 673.8 
 Xylem (XL01)  595   31.99
 543.1 
 601.4 
 Cork (CR01)  494.1   33.34
 429.8 
 477.5 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  3514.7   842.35
 1839.7 
 2520.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  3770.4   1857.76
 3183.2 
 299.5 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  4317.9   2329.78
 268.9 
 296.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  3923.7   1710.64
 6761.4 
 3687.4 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1677.9   129.68
 1420.2 
 1574.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1895.5   375.52
 1153.4 
 1424.3 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  358.4   707.43
 1764.4 
 924.2 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  528.1   587.73
 1113.9 
 1703.6 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  215.9   358.43
 472.1 
 923.8 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress