TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g25930
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  90.2   5.59
 100.4 
 99.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  104.1   18.4
 67.7 
 106.1 
 102.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  101   5.97
 107.6 
 100.5 
 93 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  72   22.04
 122.4 
 92.1 
 110.4 
 0.70 Seedling (SL01)  434.6   38.35
 360.7 
 379.8 
 0.70 Seedling (SL02)  1176.8   84.89
 1049.1 
 1016.1 
 0.70 Seedling (SL10)  182.1   35.51
 163.1 
 113.3 
 0.70 Seedling (SL12)  498.1   91.03
 572.6 
 391.5 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  186.9   11.07
 165.5 
 171.2 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  84.6   13.87
 111.2 
 91 
 1.00 Seedling (SL07)  561.3   26.71
 523.5 
 1.00 Seedling (SL09)  882.2   72.09
 1018.2 
 991.6 
 1.00 Seedling (SL11)  393.1   118.73
 377.4 
 618.7 
 551.4 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  79.4   8.22
 67.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  449   19.84
 449.9 
 415.1 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  207.3   28.05
 199.2 
 155.1 
 1.02 Seedling (SL08)  508.5   143.48
 711.4 
 1.02 Roots (RT01)  1220.7   6.41
 1229.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  2392.5   124.66
 2450.3 
 2211.4 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  488.7   106.07
 332.7 
 535.3 
 1.05 Rosette (LF11)  83.8   25.6
 97.8 
 133.5 
 1.14 Rosette (LF12)  98.6   21.95
 142.4 
 123.5 
 1.14 Rosette (LF13)  147.1   33.5
 194.4 
 3.20 Whole plant (WP05)  41.2   2.44
 37.1 
 41.3 
 3.70 Adult leaf (LF01)  139.7   13.13
 117 
 139.8 
 3.70 Adult leaf (LF02)  141.1   8
 150 
 134.1 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  116   12.69
 91.2 
 98.7 
 3.90 Adult leaf (LF03)  202.2   51.72
 112.6 
 112.7 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  167.5   39.37
 105.9 
 94.3 
 3.90 Rosette (SH01)  107.2   23.49
 153.6 
 136.7 
 3.90 Roots (RT04)  1210.6   318.72
 1805 
 1308.4 
 3.90 Roots (RT05)  1224.4   215.05
 1154.8 
 1557.1 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  102.9   21.31
 131.7 
 88.7 
 84.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  66.9   2.99
 62.7 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  131.7   54.83
 207.2 
 100.6 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  133.1   15.29
 102.6 
 116.5 
 5.10 Roots (RT02)  1680.2   17.15
 1704.4 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  129   44.17
 191.5 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  97.4   41.01
 155.4 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  176.1   4.84
 169.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  150.6   67.22
 245.7 
 6.00 Leaf (LF08)  126.1   22.13
 163.3 
 165.6 
 6.00 Leaf (LF16)  28.2   9.38
 43.2 
 45.4 
 6.00 Inflorescence (IN01)  162.6   15.7
 140.4 
 6.10 Leaf (LF10)  155.4   5.84
 151.9 
 144 
 6.10 Stem base (ST01)  909   142.61
 707.3 
 6.10 Stem top (ST02)  134.8   3.21
 139.4 
 6.10 Flower, open (FL01)  27.5   9.3
 40.7 
 6.30 Silique, young (FS01)  34.9   9.25
 21.8 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  160.2   45.83
 247.6 
 180.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  85.6   11.31
 100 
 77.7 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  177   22.72
 141.2 
 134.9 
 Suspension cell culture (SU01)  104.5   16.52
 73 
 80 
 Suspension cell culture (SU02)  124.6   49.51
 54.5 
 Xylem (XL01)  86.1   59.12
 94 
 192.2 
 Cork (CR01)  161.4   17.79
 196.9 
 180.5 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  480.8   26.74
 514.8 
 533.5 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  448.4   121.64
 480.5 
 255.6 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  395.7   112.22
 611.6 
 450.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  326.3   313.21
 439.2 
 916.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  68   6.78
 81.5 
 75.7 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  106.4   22.21
 62.9 
 76.8 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  155.5   145.71
 105.3 
 379 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  102.4   45.17
 41.5 
 129.8 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  210.3   42.4
 234.6 
 292.8 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress