TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g26744
TIGR annotation:basix helix-loop-helix (bHLH) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  2563.1   168.42
 2552.9 
 2266.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  2255   192.51
 2116 
 2505.3 
 2081.3 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  1936.3   112.56
 2200.9 
 2095.9 
 2020 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  1740.4   146.03
 1963.8 
 2094.1 
 1932.9 
 0.70 Seedling (SL01)  1120.8   45.05
 1137.1 
 1052.2 
 0.70 Seedling (SL02)  1184.7   49.6
 1115.9 
 1212.2 
 0.70 Seedling (SL10)  1079   49.73
 1172 
 1156 
 0.70 Seedling (SL12)  922.9   25.62
 890 
 872.4 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  565.7   19.83
 540.1 
 579.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  492.4   27.52
 501.2 
 449.7 
 1.00 Seedling (SL07)  849.8   17.36
 825.2 
 1.00 Seedling (SL09)  877.4   46.62
 868.8 
 792.7 
 1.00 Seedling (SL11)  845.7   92.76
 810.4 
 658.5 
 681.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  713.5   1.18
 711.8 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  967.4   9.8
 951.2 
 949.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  785.7   35.34
 853.3 
 801.7 
 1.02 Seedling (SL08)  705.9   1.99
 703.1 
 1.02 Roots (RT01)  452.5   26.34
 489.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  323.9   6.54
 337 
 330.7 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  949.9   93.11
 827.2 
 767.3 
 1.05 Rosette (LF11)  1301.2   32.13
 1360.3 
 1308.9 
 1.14 Rosette (LF12)  799.9   52.82
 729.7 
 833.1 
 1.14 Rosette (LF13)  1044.2   70.11
 1143.3 
 3.20 Whole plant (WP05)  655.2   19.85
 615.7 
 632.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1100.1   11.96
 1105.9 
 1082.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  975.4   49.73
 1064.7 
 1057.9 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  778.9   77.25
 625.6 
 685.9 
 3.90 Adult leaf (LF03)  890.6   41.67
 820 
 893.6 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1422.1   95.21
 1232.2 
 1315.1 
 3.90 Rosette (SH01)  921.5   113.87
 924.2 
 725.7 
 3.90 Roots (RT04)  323.1   10.36
 323.8 
 305.5 
 3.90 Roots (RT05)  345.1   18.42
 381.6 
 359.3 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1403.6   215.83
 1927.2 
 1727.9 
 1695 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1284.1   126.48
 1463 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1600.7   211.35
 2004.3 
 1911.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1994.4   261.32
 1595.7 
 1502.5 
 5.10 Roots (RT02)  411.7   12.39
 394.1 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  462.7   5.29
 470.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  507.2   31.53
 551.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  607.4   28.87
 566.6 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  420.9   13.13
 439.5 
 6.00 Leaf (LF08)  647.9   75.2
 786.8 
 667.3 
 6.00 Leaf (LF16)  578.1   63.84
 704.2 
 658.1 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1264.2   214.51
 1567.5 
 6.10 Leaf (LF10)  760.4   84.48
 876.2 
 924.9 
 6.10 Stem base (ST01)  806.9   83.58
 688.7 
 6.10 Stem top (ST02)  1525.9   87.5
 1402.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  1661.4   93.64
 1529 
 6.30 Silique, young (FS01)  1183.6   118.63
 1351.4 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  2751.6   104.08
 2587.6 
 2558.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  3046.6   532.94
 1989.5 
 2636.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  787.5   140.35
 542.2 
 546.8 
 Suspension cell culture (SU01)  242.7   20.27
 202.8 
 216.6 
 Suspension cell culture (SU02)  294   66.35
 200.1 
 Xylem (XL01)  217.1   4.16
 209 
 214.7 
 Cork (CR01)  640.1   27.93
 590.3 
 637.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  2945.4   1063.61
 2735.6 
 1007.3 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  2906.6   1042.2
 2471.4 
 923.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  2999.9   2064.08
 355.3 
 4422.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  3171.7   1119.15
 3004.5 
 1155.1 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  3448.9   370.85
 2715.8 
 2985.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  4030   1673.68
 808 
 3204.9 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  1718.3   430.08
 2357 
 1538.6 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  270.8   2335.75
 3184.5 
 4889.9 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  978.8   32.62
 913.9 
 952 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress