TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g28220
TIGR annotation:meprin and TRAF homology domain-containing protein / MATH domain-containing protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS4

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  191.2   4.93
 200.2 
 199.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  361.4   221.01
 817.4 
 381.9 
 384.3 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  377.1   43.98
 281 
 302 
 289.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  285.1   52.2
 267 
 185.8 
 187.3 
 0.70 Seedling (SL01)  133.9   13.81
 128.3 
 154.5 
 0.70 Seedling (SL02)  388.8   120.55
 406.3 
 605.8 
 0.70 Seedling (SL10)  247.4   34.2
 253.2 
 309.3 
 0.70 Seedling (SL12)  377.3   39.7
 298.1 
 342.5 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  255.1   55.82
 143.4 
 200 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  408.4   92.27
 423.2 
 256.5 
 1.00 Seedling (SL07)  604.3   1.05
 602.8 
 1.00 Seedling (SL09)  772.3   43.75
 692.1 
 701.9 
 1.00 Seedling (SL11)  1670.9   479.4
 1258.2 
 1533 
 592.1 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  128.5   2.04
 131.4 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1513   145.29
 1230.1 
 1314.2 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  286.1   14.41
 276.5 
 257.7 
 1.02 Seedling (SL08)  109.9   118.04
 276.9 
 1.02 Roots (RT01)  168.6   16.13
 145.8 
 1.02 Lateral roots (RH01)  120.7   56.35
 198.2 
 88.6 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  412.3   369.5
 1128.7 
 613.5 
 1.05 Rosette (LF11)  1103.8   132.68
 1194.8 
 1365.1 
 1.14 Rosette (LF12)  361.8   61.29
 377.4 
 264.3 
 1.14 Rosette (LF13)  1365.9   238.56
 1028.5 
 3.20 Whole plant (WP05)  993.3   11
 1006.2 
 1015.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1236.3   144.21
 957.6 
 1032.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  737.8   163.45
 429.7 
 678.3 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  288.4   110.31
 452.6 
 242.9 
 3.90 Adult leaf (LF03)  168.4   205.54
 242 
 555.5 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  172.9   69.22
 296.8 
 288.3 
 3.90 Rosette (SH01)  3468.6   1173.87
 1121 
 2313.6 
 3.90 Roots (RT04)  177.9   40.41
 108.5 
 107.3 
 3.90 Roots (RT05)  240.2   95.55
 398 
 412.4 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  2382.9   211.11
 2743.7 
 2249.9 
 2523.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  870.4   539.24
 1633 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1716.4   456.23
 976.6 
 1809 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  793.4   387.45
 1514.5 
 1399.8 
 5.10 Roots (RT02)  168.6   62.82
 257.4 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  158.6   45.85
 223.5 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  156.9   35.47
 207.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  269.6   43.52
 331.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  373.9   30.35
 330.9 
 6.00 Leaf (LF08)  962.7   369.93
 477.5 
 236.4 
 6.00 Leaf (LF16)  303   51.99
 202.6 
 229.4 
 6.00 Inflorescence (IN01)  670.7   212.59
 370 
 6.10 Leaf (LF10)  1819.9   118.3
 2039.4 
 2006.1 
 6.10 Stem base (ST01)  135.6   19.63
 163.3 
 6.10 Stem top (ST02)  1052   139.88
 854.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  443.7   101.45
 587.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  389.5   300.16
 814 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  249.2   67.76
 337.7 
 204.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  172.2   35.29
 222.4 
 154.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  221.4   55.83
 255.9 
 146.7 
 Suspension cell culture (SU01)  1002.5   491.26
 136.8 
 167.2 
 Suspension cell culture (SU02)  148.7   219.21
 458.7 
 Xylem (XL01)  137.6   17.58
 155.9 
 172.7 
 Cork (CR01)  152.2   27.74
 126.3 
 96.8 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  190.4   8.54
 175.6 
 175.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  186.5   35.44
 131.7 
 198 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  127   24.37
 116.1 
 162.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  121.7   18.31
 123.2 
 154.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  125.6   15.17
 141.3 
 156 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  134.3   24.17
 85.9 
 108.8 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  190.4   66.58
 103 
 233.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  124.4   43.66
 94.5 
 180.5 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  347.1   97.63
 390.2 
 203.7 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress