TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g46960
TIGR annotation:DEAD/DEAH box helicase, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  647.8   100.77
 848.9 
 736.9 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  780.9   56.85
 731.2 
 863.7 
 760.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  787.1   23.41
 815.7 
 798.6 
 841 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  770.1   59.31
 902.6 
 874.6 
 881.8 
 0.70 Seedling (SL01)  723   30.22
 769.6 
 779.6 
 0.70 Seedling (SL02)  532.8   19.08
 537.4 
 502.3 
 0.70 Seedling (SL10)  419.7   39.92
 496.7 
 439.7 
 0.70 Seedling (SL12)  451.3   23.54
 478.5 
 498.2 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  545.1   17.89
 565.4 
 529.8 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  609   58.6
 631.5 
 719.9 
 1.00 Seedling (SL07)  602.6   18.31
 576.7 
 1.00 Seedling (SL09)  343.7   12.39
 359.1 
 334.6 
 1.00 Seedling (SL11)  433.8   64.9
 476.4 
 361.3 
 335.4 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  578.6   17.95
 603.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  638.5   59.03
 674 
 558.7 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  626.6   40.99
 683.4 
 706.2 
 1.02 Seedling (SL08)  589.4   59.77
 673.9 
 1.02 Roots (RT01)  588.6   19.26
 615.8 
 1.02 Lateral roots (RH01)  560.2   31.49
 567.4 
 509.6 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  640.5   38.5
 636.2 
 571.8 
 1.05 Rosette (LF11)  552.3   51.12
 521.5 
 452.5 
 1.14 Rosette (LF12)  539.3   45.5
 480.9 
 570.5 
 1.14 Rosette (LF13)  533.7   22.77
 501.5 
 3.20 Whole plant (WP05)  453.8   36.14
 526.1 
 488.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  480   20.38
 505.8 
 520.3 
 3.70 Adult leaf (LF02)  498   10.65
 519.2 
 506.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  592.6   34.54
 526.1 
 575.4 
 3.90 Adult leaf (LF03)  829.8   141.49
 564.5 
 611.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  941.3   199.22
 557.2 
 657.4 
 3.90 Rosette (SH01)  635.1   18.25
 662.4 
 627.8 
 3.90 Roots (RT04)  707.9   60.78
 709.6 
 603.5 
 3.90 Roots (RT05)  498   114.59
 709.3 
 680.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  619   37.29
 639.9 
 698.3 
 685 
 5.10 Flower, buds (FB01)  395.3   87.58
 519.1 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  938   157.33
 742.6 
 626.7 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  729.5   39.7
 650.1 
 687.2 
 5.10 Roots (RT02)  654   72.44
 551.5 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  954   72.48
 1056.5 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  851.2   160.65
 1078.4 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  647.5   60.98
 733.8 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  561.8   46.67
 627.8 
 6.00 Leaf (LF08)  541.8   46.29
 634.1 
 582.1 
 6.00 Leaf (LF16)  452.1   38.51
 390.5 
 381.3 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1050.3   36.54
 1102 
 6.10 Leaf (LF10)  573.8   4.59
 565.1 
 566.9 
 6.10 Stem base (ST01)  633.4   96.06
 769.2 
 6.10 Stem top (ST02)  705.9   105.72
 855.5 
 6.10 Flower, open (FL01)  408.9   15.05
 430.2 
 6.30 Silique, young (FS01)  455.3   9.79
 469.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1176.9   163.24
 856.9 
 960.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  567   30.72
 625.1 
 578.7 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1206.5   280.19
 747.6 
 698.5 
 Suspension cell culture (SU01)  717.6   38.69
 779.1 
 707.7 
 Suspension cell culture (SU02)  733   39.87
 676.7 
 Xylem (XL01)  641.8   16.81
 610.6 
 615.5 
 Cork (CR01)  635.8   81.6
 619.2 
 768.1 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  1072.1   393.54
 1272.9 
 1831.6 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  1112   169.01
 1448.7 
 1254.5 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1148.1   74.83
 1051.3 
 1198.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1342.3   93.98
 1230.8 
 1155.5 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  785.7   33.96
 719.7 
 738.6 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  659.7   73.77
 797.1 
 774.9 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  1443.3   182.33
 1276.1 
 1079.1 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  684.4   550.92
 897.5 
 1727.1 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  1290.4   273.08
 1310 
 827.5 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress