TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g54510
TIGR annotation:early-responsive to dehydration protein-related / ERD protein-related
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  665.5   94.88
 487.6 
 519.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  1217.6   67.53
 1155.5 
 1299.7 
 1158.8 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  960.9   50.02
 1031.3 
 916 
 937.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  568.1   27.96
 610.7 
 627.5 
 627.1 
 0.70 Seedling (SL01)  215.5   24.22
 185 
 232.9 
 0.70 Seedling (SL02)  215.6   25.9
 185 
 164.1 
 0.70 Seedling (SL10)  146.2   0.7
 147.4 
 147.5 
 0.70 Seedling (SL12)  143.7   7.89
 139 
 154.4 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  190.3   24.29
 144 
 154.4 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  151.2   12.01
 158.9 
 135.3 
 1.00 Seedling (SL07)  149.2   24.88
 184.4 
 1.00 Seedling (SL09)  254.3   47.1
 279 
 187.9 
 1.00 Seedling (SL11)  68.1   9.19
 82.4 
 90.2 
 81.9 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  160.1   4.86
 153.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  128.1   3.42
 134.1 
 128.4 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  255.5   31.22
 207.8 
 196.8 
 1.02 Seedling (SL08)  128.8   19.29
 156.1 
 1.02 Roots (RT01)  180.1   1.71
 177.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  131.3   13.97
 153.8 
 128.2 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  159.7   22.8
 135.1 
 114.2 
 1.05 Rosette (LF11)  146   27.19
 199.4 
 181.6 
 1.14 Rosette (LF12)  141   2.31
 145.3 
 141.6 
 1.14 Rosette (LF13)  145.4   1.86
 142.8 
 3.20 Whole plant (WP05)  123.1   5.61
 131.4 
 120.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  208.4   16.91
 178.4 
 206.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  186.4   8.92
 177.6 
 195.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  148.5   7.06
 134.4 
 142.5 
 3.90 Adult leaf (LF03)  132.5   19.58
 161.7 
 169.7 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  143.2   27.79
 186.1 
 195.2 
 3.90 Rosette (SH01)  127.5   25.37
 178.2 
 155 
 3.90 Roots (RT04)  211.9   46.2
 173.7 
 119.9 
 3.90 Roots (RT05)  183.4   32.27
 221.2 
 247.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  147.4   14.6
 178.5 
 148 
 160.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  90.3   0.15
 90.5 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  139.3   43.42
 225.7 
 174.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  147.8   20.24
 181.7 
 183.9 
 5.10 Roots (RT02)  138.1   22.49
 169.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  212.2   4.31
 206.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  237.4   5.15
 244.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  663.4   26.12
 626.4 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  316.7   0.18
 317 
 6.00 Leaf (LF08)  147.7   25.3
 197.8 
 179.1 
 6.00 Leaf (LF16)  142.4   9.31
 158.9 
 143.3 
 6.00 Inflorescence (IN01)  216.5   36.45
 164.9 
 6.10 Leaf (LF10)  202   39.6
 125.7 
 145.5 
 6.10 Stem base (ST01)  130.4   0.61
 129.6 
 6.10 Stem top (ST02)  139.9   8.65
 127.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  100.2   19.2
 127.4 
 6.30 Silique, young (FS01)  84.3   11.91
 67.5 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  163.3   8.22
 160 
 147.7 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  772.3   206.36
 614.2 
 363.1 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  276.8   85.95
 155.5 
 110.7 
 Suspension cell culture (SU01)  168.1   23.16
 124.7 
 132.4 
 Suspension cell culture (SU02)  141.3   6.37
 150.3 
 Xylem (XL01)  124.2   17.76
 150.2 
 158.2 
 Cork (CR01)  147.1   14.24
 174.4 
 167.7 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  242.2   116.67
 475.5 
 354.6 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  382.3   68.55
 298.2 
 434.1 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  224   114.79
 448.9 
 296.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  236.6   47.19
 284.7 
 330.9 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  684.2   64.85
 810.5 
 772.9 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  549.8   223.07
 238.9 
 671.4 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  539.2   83.79
 466.4 
 372.1 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  292.7   320.8
 228.5 
 813.4 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  504.2   286.69
 1020.8 
 547.2 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress