TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g54900
TIGR annotation:CAX-interacting protein 1 (CAXIP1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  583.9   76.13
 565.8 
 705.8 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  669.9   41.8
 587.6 
 582.5 
 637.2 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  596.9   10.04
 593.1 
 615.2 
 607.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  538.4   16.32
 499.7 
 522.6 
 527.5 
 0.70 Seedling (SL01)  1276.9   76.93
 1365.2 
 1211.9 
 0.70 Seedling (SL02)  2759.9   99.94
 2802 
 2611.7 
 0.70 Seedling (SL10)  1119.1   156.41
 1273.9 
 1431.9 
 0.70 Seedling (SL12)  2084.5   330.47
 2504 
 1851.9 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  1132.8   140.66
 1369.1 
 1383.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  997.8   33.68
 942.4 
 1003.2 
 1.00 Seedling (SL07)  2216.5   139.41
 2019.3 
 1.00 Seedling (SL09)  3324.3   221.98
 3167.2 
 2886.1 
 1.00 Seedling (SL11)  2915.2   673.57
 2829.4 
 1717.3 
 1697.3 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  951.7   1.02
 953.1 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  2664.4   139.01
 2550.2 
 2387.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1749.1   35.81
 1792.8 
 1820.1 
 1.02 Seedling (SL08)  939.6   49.11
 1009 
 1.02 Roots (RT01)  821.8   82.06
 705.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  610.9   73.39
 654 
 754 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  2518.3   187.67
 2215.4 
 2174.9 
 1.05 Rosette (LF11)  2772.1   263.42
 2527.9 
 3054.3 
 1.14 Rosette (LF12)  2348.9   248.02
 2840.8 
 2650 
 1.14 Rosette (LF13)  2881.8   77.91
 2771.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  3678.3   78.18
 3564.8 
 3714.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  2869.5   56.09
 2831.6 
 2759.1 
 3.70 Adult leaf (LF02)  2797.7   59.15
 2892.1 
 2783.1 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  2678.1   162.95
 2589.1 
 2362.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  2029.3   19.4
 2050.4 
 2068 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1676   171.27
 2000 
 1934.3 
 3.90 Rosette (SH01)  1774.5   71.57
 1808.5 
 1911.9 
 3.90 Roots (RT04)  725.6   191.71
 992.8 
 1097.4 
 3.90 Roots (RT05)  916.7   46.58
 934.3 
 846.3 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  2431   112.45
 2159.5 
 2276.1 
 2255.3 
 5.10 Flower, buds (FB01)  962   249.92
 1315.4 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1353   223.56
 907.1 
 1158.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  990   175.97
 1331 
 1236 
 5.10 Roots (RT02)  919.9   121.74
 747.8 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  431.1   61.08
 344.7 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  423   58.13
 340.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  293.2   4.21
 287.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  364.9   4.26
 358.9 
 6.00 Leaf (LF08)  2806.7   345.39
 3169.7 
 3497.2 
 6.00 Leaf (LF16)  2802.4   170.91
 2535.7 
 2854.3 
 6.00 Inflorescence (IN01)  662.4   155.64
 882.5 
 6.10 Leaf (LF10)  3241.1   477.15
 2407.5 
 2422 
 6.10 Stem base (ST01)  1574.5   86.95
 1451.5 
 6.10 Stem top (ST02)  1287.3   91.62
 1157.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  935.3   165.58
 1169.4 
 6.30 Silique, young (FS01)  1620.7   20.83
 1650.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  725.7   214.48
 1153.6 
 965.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  946.2   101.21
 769.3 
 772.5 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  625.6   313.45
 1065.4 
 1232.4 
 Suspension cell culture (SU01)  653.7   135.29
 899.8 
 874.2 
 Suspension cell culture (SU02)  968.5   142.11
 767.5 
 Xylem (XL01)  1358.5   65.87
 1486.6 
 1449.3 
 Cork (CR01)  1004.5   79.29
 1156.5 
 1041.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  230.3   39.5
 309.1 
 274.5 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  252.7   113.33
 399.6 
 475.6 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  420.3   52.38
 357 
 316.4 
 Heart embryo, roots (EHR1)  285.6   121.83
 458.6 
 223.5 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  216.9   46.27
 203.4 
 289.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  240.4   223.12
 593.5 
 180.6 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  253.6   94.26
 341.7 
 442 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  779.7   301.1
 430.9 
 180.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  428.9   15.23
 439.9 
 409.8 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress