TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g02380
TIGR annotation:late embryogenesis abundant 3 family protein / LEA3 family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  3467.7   388.32
 2901 
 3644.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  743   80.38
 599.8 
 756.7 
 624.2 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  1119.2   31.6
 1136.1 
 1094.4 
 1169.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  3959.2   125.53
 3767.6 
 4029.5 
 4037.3 
 0.70 Seedling (SL01)  5847.6   621.62
 5854.2 
 6927.6 
 0.70 Seedling (SL02)  6413.8   560.34
 6239.5 
 5368 
 0.70 Seedling (SL10)  5269   251.31
 4797.1 
 5182.9 
 0.70 Seedling (SL12)  6683.2   1267.49
 8794.3 
 6523.5 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  5182.6   389.15
 4485.6 
 4534 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1420.3   118.68
 1365.1 
 1192.8 
 1.00 Seedling (SL07)  5855.9   227.65
 5534 
 1.00 Seedling (SL09)  7717.5   1003.1
 6304.2 
 8244 
 1.00 Seedling (SL11)  4406.2   754.38
 4515.7 
 3965 
 2863.9 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1848.1   42.07
 1907.6 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  2328.4   250.33
 2825.4 
 2629.3 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  8682.7   558.9
 7802.2 
 8838.8 
 1.02 Seedling (SL08)  5606.5   243.03
 5262.9 
 1.02 Roots (RT01)  4080.7   594.04
 4920.8 
 1.02 Lateral roots (RH01)  6949.5   276.37
 6424.1 
 6835.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  4949.1   888.66
 6602.7 
 6340.1 
 1.05 Rosette (LF11)  903.2   57.25
 901.4 
 1001.4 
 1.14 Rosette (LF12)  4972.9   1262.46
 2497.5 
 4166.3 
 1.14 Rosette (LF13)  3421.1   514.3
 4148.5 
 3.20 Whole plant (WP05)  3727.1   162.76
 3581.6 
 3402.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1608.5   66.43
 1492.2 
 1494.8 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1756.6   87.53
 1614.3 
 1773.8 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1395.5   255.93
 1121.2 
 884.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  5411.8   1529.45
 8400 
 7471.9 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  2901.6   2203.02
 6963.8 
 6410.5 
 3.90 Rosette (SH01)  6791.7   836.99
 7388.9 
 5736 
 3.90 Roots (RT04)  5238.5   925.77
 6897.6 
 6780 
 3.90 Roots (RT05)  7843.4   889.21
 6508.7 
 8193.9 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  382.2   246.4
 800 
 959.1 
 635.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  4580   1926.45
 1855.6 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  2117.5   1766.83
 362.7 
 3896.3 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  2425.9   3254.22
 2634 
 8163.5 
 5.10 Roots (RT02)  6356.8   1070.13
 4843.4 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  411.2   15.79
 388.8 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1269.2   211.55
 970 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  9232.1   295.15
 9649.5 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  13489.2   370.24
 12965.6 
 6.00 Leaf (LF08)  6098.9   2753.21
 1538.9 
 1145.8 
 6.00 Leaf (LF16)  3016.6   49.6
 2958.7 
 2917.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1575.1   207.87
 1869 
 6.10 Leaf (LF10)  1130.5   628.67
 404.2 
 1656.2 
 6.10 Stem base (ST01)  8062.7   328.56
 7598 
 6.10 Stem top (ST02)  774.1   33.38
 726.9 
 6.10 Flower, open (FL01)  7687.4   1034.95
 6223.8 
 6.30 Silique, young (FS01)  1471.4   731.11
 2505.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  2670.1   775.53
 1371 
 1286.7 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  2088.6   2382.36
 1749.9 
 6035.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  8463   687.65
 8773.7 
 9778.6 
 Suspension cell culture (SU01)  6781.3   430.58
 7360.8 
 6519.4 
 Suspension cell culture (SU02)  5137.5   272.43
 5522.7 
 Xylem (XL01)  1484.7   153.58
 1369.1 
 1180.4 
 Cork (CR01)  2115.1   239.02
 2238 
 2576.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  476.6   19.87
 492.6 
 516.1 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  466.1   57.29
 411.9 
 526.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  522   79.55
 368.7 
 408.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  328.9   67.37
 378.9 
 462.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  577.9   151.76
 805.7 
 865.6 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  257.6   161.34
 145.4 
 463.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  414.1   272.5
 800 
 273.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  194.4   108.46
 218.5 
 393.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  577.4   139.11
 345.9 
 328 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress