TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g04340
TIGR annotation:early-responsive to dehydration protein-related / ERD protein-related
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS4

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  650.3   41.19
 665.9 
 588 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  1016.8   18.27
 1012.2 
 1037 
 1051.4 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  903.3   42.87
 918.8 
 900.2 
 823.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  635.8   29.93
 608.4 
 608.3 
 563.5 
 0.70 Seedling (SL01)  1170.7   120.08
 1003.5 
 937.8 
 0.70 Seedling (SL02)  1077.6   45.46
 1071 
 1152.8 
 0.70 Seedling (SL10)  600.5   44.73
 689.8 
 649 
 0.70 Seedling (SL12)  1331.8   125.39
 1122 
 1107.9 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  1085.5   35.23
 1137.2 
 1069.9 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  706   18.92
 678.5 
 669.7 
 1.00 Seedling (SL07)  1161.3   54.4
 1238.2 
 1.00 Seedling (SL09)  1125.4   77.94
 1278.8 
 1226 
 1.00 Seedling (SL11)  1232.5   351.65
 1204.1 
 1948.9 
 1322 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  989.7   87.62
 865.8 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1625.9   126.52
 1819.6 
 1581.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  847.1   18.54
 859.8 
 823.3 
 1.02 Seedling (SL08)  982   22.16
 1013.4 
 1.02 Roots (RT01)  620.3   35.12
 670 
 1.02 Lateral roots (RH01)  437.9   18.84
 462.2 
 425.2 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1380   137.15
 1328 
 1587.2 
 1.05 Rosette (LF11)  1038.2   140.86
 787.2 
 802 
 1.14 Rosette (LF12)  2384.7   22.29
 2341.1 
 2355.1 
 1.14 Rosette (LF13)  1317   6.17
 1308.3 
 3.20 Whole plant (WP05)  820.4   19.77
 780.9 
 802.5 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1037.5   35.93
 1000.7 
 1072.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  845.6   19
 847.2 
 813.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  2245.2   178.68
 2595.1 
 2357.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1027   76.15
 1102.4 
 950.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1504.8   70.92
 1387.9 
 1515.9 
 3.90 Rosette (SH01)  1483.7   206.08
 1075.2 
 1232 
 3.90 Roots (RT04)  539.2   50.02
 484.6 
 439.4 
 3.90 Roots (RT05)  584.8   48.91
 682.1 
 624.7 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  714.5   30.14
 788.3 
 750.3 
 749.5 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1472.5   190.91
 1202.5 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1728.8   140.63
 1533 
 1456.1 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1474.3   87.18
 1550.4 
 1376.5 
 5.10 Roots (RT02)  682   47.9
 614.3 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  438.4   14.38
 458.7 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  382.1   37.92
 435.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  397.8   32.31
 443.5 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  360.4   58.69
 443.4 
 6.00 Leaf (LF08)  1327.4   507.99
 1888.8 
 2341.4 
 6.00 Leaf (LF16)  2004.6   163.12
 2258.6 
 2308.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1118.5   162.13
 1347.8 
 6.10 Leaf (LF10)  3531.6   1126.48
 1608.1 
 1553.9 
 6.10 Stem base (ST01)  1257.4   49.84
 1186.9 
 6.10 Stem top (ST02)  1388.5   56.72
 1308.3 
 6.10 Flower, open (FL01)  1004.9   75.53
 898.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  1208.4   138.34
 1012.8 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1620.9   209.14
 1394.7 
 1203.2 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  797.6   158.09
 654.8 
 481.9 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1157.7   145.43
 927.4 
 1196.4 
 Suspension cell culture (SU01)  618.6   172.16
 312 
 329.5 
 Suspension cell culture (SU02)  511.2   141.55
 711.4 
 Xylem (XL01)  880.6   31.38
 839 
 819.1 
 Cork (CR01)  929.2   30.89
 888.5 
 949.2 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  295.3   47.1
 252.9 
 347 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  214.6   56.63
 322.5 
 298.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  688.4   211.03
 467 
 266.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  445.7   113.08
 243.3 
 257.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  296.3   133.09
 217.5 
 477.1 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  452.8   317.66
 930.9 
 329.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  276.8   438.19
 318.2 
 1055.6 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  1188.1   463.37
 877.2 
 276.6 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  370.1   57.68
 265.7 
 275.4 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress