TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g17070
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  215.6   20.67
 177.7 
 182.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  179.4   14.3
 169.5 
 164 
 196.6 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  190.8   20.88
 166.5 
 155.2 
 200.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  200.6   9.31
 196.2 
 212.9 
 215.4 
 0.70 Seedling (SL01)  283.5   5.18
 293.8 
 288.5 
 0.70 Seedling (SL02)  261.1   14.58
 237.3 
 234.6 
 0.70 Seedling (SL10)  305.1   16.54
 302.7 
 332.4 
 0.70 Seedling (SL12)  234.7   9.79
 254.2 
 242.4 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  403.6   16.5
 406.4 
 376.5 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  396.3   17.71
 430.9 
 407.2 
 1.00 Seedling (SL07)  287.8   0.17
 288.1 
 1.00 Seedling (SL09)  262.3   6.2
 249.9 
 255.7 
 1.00 Seedling (SL11)  186.5   37.87
 196.4 
 262.9 
 249 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  315.1   29.5
 356.8 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  214.6   8.3
 198.2 
 203.9 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  550.1   3.9
 547 
 542.4 
 1.02 Seedling (SL08)  531.9   43.15
 470.8 
 1.02 Roots (RT01)  322.9   57.35
 404 
 1.02 Lateral roots (RH01)  824.4   101.06
 876.7 
 681.5 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  314.6   48.24
 318.2 
 399.9 
 1.05 Rosette (LF11)  256.7   20.79
 246.7 
 286.6 
 1.14 Rosette (LF12)  526   86.27
 360.5 
 485.6 
 1.14 Rosette (LF13)  253   29.57
 294.8 
 3.20 Whole plant (WP05)  656.1   38.33
 579.5 
 614.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  262.6   22.25
 226.4 
 222.1 
 3.70 Adult leaf (LF02)  268.5   8.08
 258.6 
 252.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  381.5   21.4
 346.4 
 342.6 
 3.90 Adult leaf (LF03)  485.8   97.09
 455.7 
 304.6 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  222   62
 340.4 
 313.2 
 3.90 Rosette (SH01)  489   125.43
 714.4 
 506.3 
 3.90 Roots (RT04)  520.5   23.21
 475.9 
 486.9 
 3.90 Roots (RT05)  440.4   19.26
 442.3 
 474.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  210.8   21.06
 215.8 
 250 
 201.9 
 5.10 Flower, buds (FB01)  173.8   2.56
 170.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  218.1   22.5
 173.2 
 193.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  220.9   28.61
 176.6 
 230.1 
 5.10 Roots (RT02)  532.8   45.91
 597.7 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  289.5   29.49
 331.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  338.5   7.57
 349.2 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  508.9   28.62
 549.4 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  371.8   16.08
 349.1 
 6.00 Leaf (LF08)  471   26.85
 454.1 
 418.4 
 6.00 Leaf (LF16)  527.4   29.9
 525.1 
 578 
 6.00 Inflorescence (IN01)  251.7   4.97
 258.7 
 6.10 Leaf (LF10)  186   54.65
 245.9 
 295.1 
 6.10 Stem base (ST01)  321.3   21.02
 351 
 6.10 Stem top (ST02)  190   1.01
 188.6 
 6.10 Flower, open (FL01)  168.7   18.26
 142.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  258.9   59.66
 174.5 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  289   55.55
 318.4 
 396.5 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  209.2   27.81
 153.6 
 179.8 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  448.3   143.68
 705.4 
 688 
 Suspension cell culture (SU01)  716.4   23.44
 762.5 
 746.9 
 Suspension cell culture (SU02)  477.1   42.81
 416.5 
 Xylem (XL01)  443.4   23.25
 396.9 
 420.8 
 Cork (CR01)  479.1   23.54
 486.4 
 523 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  1032.2   455.87
 271.7 
 216.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  194.1   23.46
 237.9 
 230.5 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1313.5   673.4
 104.7 
 194.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  191.7   25.67
 214.8 
 243 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1016.4   446.49
 348.5 
 1195.7 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  376.9   137.86
 219.2 
 102.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  183.2   5.64
 191.6 
 180.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  55.8   78.93
 103.6 
 210 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  154.1   35.04
 215.4 
 214 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress