TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g19690
TIGR annotation:iron-responsive transporter (IRT1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  40.5   3.32
 44.2 
 47.1 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  49.7   32.09
 115.6 
 57.7 
 48.4 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  62.3   10.15
 53.8 
 42.5 
 40.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  47.4   5.21
 55.6 
 51.8 
 43.6 
 0.70 Seedling (SL01)  49.2   3.27
 55.7 
 52.9 
 0.70 Seedling (SL02)  680.4   172.77
 529.4 
 335.8 
 0.70 Seedling (SL10)  34.9   1.62
 35.4 
 32.4 
 0.70 Seedling (SL12)  42.6   18.87
 68.3 
 31.5 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  59.2   11.47
 38.6 
 40 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  48.7   5.65
 37.9 
 40.5 
 1.00 Seedling (SL07)  69.5   0.2
 69.8 
 1.00 Seedling (SL09)  163.7   68.18
 35.9 
 58.6 
 1.00 Seedling (SL11)  1891.5   606.55
 1418.4 
 1958.6 
 2869.9 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  36.4   3.22
 31.8 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1117.1   179.38
 1193.4 
 851.7 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  38.2   6.01
 39.9 
 49.4 
 1.02 Seedling (SL08)  32.9   10.64
 48 
 1.02 Roots (RT01)  2416.8   698
 1429.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  102.8   117.71
 115.6 
 312.8 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  617.5   108.5
 442.5 
 641.1 
 1.05 Rosette (LF11)  48.8   4.66
 42.4 
 51.5 
 1.14 Rosette (LF12)  40.4   1.9
 42.9 
 39.2 
 1.14 Rosette (LF13)  205.8   40.76
 148.1 
 3.20 Whole plant (WP05)  37.8   2.62
 42.9 
 41.3 
 3.70 Adult leaf (LF01)  46.6   8.61
 59.3 
 63 
 3.70 Adult leaf (LF02)  48.7   15.67
 55.9 
 78.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  43.8   8.49
 56.3 
 60.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  64.6   22.84
 49.7 
 94.5 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  48.2   5.25
 58.7 
 53.6 
 3.90 Rosette (SH01)  35.4   16.07
 64.2 
 37.5 
 3.90 Roots (RT04)  613.8   753.55
 2104.3 
 1165.8 
 3.90 Roots (RT05)  4040.6   515.01
 3609.3 
 4635 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  39.8   4.84
 50.4 
 42.1 
 40.9 
 5.10 Flower, buds (FB01)  375.2   13.49
 356.1 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  78.3   10.56
 92 
 99.1 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  149.3   90.78
 299.3 
 135.8 
 5.10 Roots (RT02)  471.6   73.83
 367.2 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  65.3   12.14
 82.5 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  54.9   4.65
 61.5 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  66.6   16.32
 89.7 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  97.1   4.26
 103.1 
 6.00 Leaf (LF08)  45.9   4.67
 53.3 
 54.5 
 6.00 Leaf (LF16)  46.1   9.61
 29.4 
 29.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  86.8   21.56
 56.3 
 6.10 Leaf (LF10)  56   9.56
 39.4 
 39.5 
 6.10 Stem base (ST01)  49.3   14.6
 69.9 
 6.10 Stem top (ST02)  107.3   19.24
 134.5 
 6.10 Flower, open (FL01)  627   79.53
 514.6 
 6.30 Silique, young (FS01)  84.1   26.76
 46.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  49.5   5.18
 44.2 
 39.2 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  41.4   4.27
 49.8 
 44.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  51.3   9.57
 35.4 
 34.1 
 Suspension cell culture (SU01)  92.8   24.31
 47.4 
 54.9 
 Suspension cell culture (SU02)  49.4   33.91
 97.4 
 Xylem (XL01)  47.4   5.7
 37.6 
 37.6 
 Cork (CR01)  38.3   3.01
 32.9 
 37.8 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  121.3   17.34
 135 
 155.7 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  203.5   58.52
 89.6 
 123.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  84.4   57.39
 184.3 
 183.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  87.5   34.54
 146.3 
 148.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  65.4   17.2
 42.2 
 75.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  67.3   118.24
 262.2 
 48.8 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  142.9   29.99
 96 
 87.1 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  137.2   32.19
 79.4 
 132.8 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  153.8   143.44
 201 
 422.5 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress