TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g26970
TIGR annotation:aconitate hydratase, cytoplasmic, putative / citrate hydro-lyase/aconitase, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1117.6   145.71
 1062.7 
 842.2 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  293.1   34.14
 229.3 
 298 
 246.2 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  386.4   11.99
 405.3 
 413.2 
 393.4 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  577.9   19.05
 624 
 602 
 595.5 
 0.70 Seedling (SL01)  1330.9   63.24
 1390.4 
 1457.3 
 0.70 Seedling (SL02)  1483   20.68
 1443.8 
 1474.8 
 0.70 Seedling (SL10)  1593.9   127.96
 1817.5 
 1813.6 
 0.70 Seedling (SL12)  1388.9   175.03
 1052.5 
 1304.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  2147.8   117.82
 2338.4 
 2123 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1798.1   148.27
 1725.6 
 2010.9 
 1.00 Seedling (SL07)  1383.8   81.4
 1498.9 
 1.00 Seedling (SL09)  2054.7   30.47
 2115.5 
 2088.2 
 1.00 Seedling (SL11)  1793.2   267.22
 1826.3 
 2300.1 
 1706.4 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  935.9   37.1
 883.4 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1631.6   145.74
 1417.9 
 1353.1 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1037.6   22.35
 1081.4 
 1067.3 
 1.02 Seedling (SL08)  2361.2   27.7
 2322 
 1.02 Roots (RT01)  2072.6   145.85
 2278.8 
 1.02 Lateral roots (RH01)  5960.7   271.69
 5682.7 
 5417.4 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  2123.8   52.73
 2121.2 
 2213.8 
 1.05 Rosette (LF11)  1448.8   165.87
 1193.4 
 1137.8 
 1.14 Rosette (LF12)  1784.8   175.2
 2134.1 
 1936.3 
 1.14 Rosette (LF13)  1308.7   104.26
 1456.2 
 3.20 Whole plant (WP05)  754.1   6.03
 749.3 
 742.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1330.9   27.92
 1306.2 
 1275.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1428.8   19.09
 1404.7 
 1391.1 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  2224.3   130.35
 2086.8 
 1963.7 
 3.90 Adult leaf (LF03)  952.9   79.08
 1097.3 
 1080.9 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1165.4   265.94
 1674.3 
 1553.9 
 3.90 Rosette (SH01)  1553.4   199.6
 1865.6 
 1494 
 3.90 Roots (RT04)  2703.4   171.75
 2917.4 
 2577.7 
 3.90 Roots (RT05)  2540.1   292.25
 2217.6 
 2801 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  752.4   95.26
 929.9 
 940.6 
 793.7 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1597.5   70.08
 1498.4 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1077.3   197.38
 1429.3 
 1098.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1386.8   112.16
 1480.3 
 1256.9 
 5.10 Roots (RT02)  5109.5   1040.87
 3637.5 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  2967.1   181.01
 3223.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  2975.9   168.59
 3214.4 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  2867   317.64
 3316.3 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  2471.1   528.21
 1724.1 
 6.00 Leaf (LF08)  1908.7   263.77
 1776.9 
 1400.4 
 6.00 Leaf (LF16)  1386.8   67.05
 1455.9 
 1520.8 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1026.1   186.69
 1290.1 
 6.10 Leaf (LF10)  1137.4   125.51
 1250.1 
 1388 
 6.10 Stem base (ST01)  1733.9   15.22
 1712.3 
 6.10 Stem top (ST02)  1310.4   49.02
 1379.8 
 6.10 Flower, open (FL01)  1662.3   24.95
 1697.6 
 6.30 Silique, young (FS01)  1307.9   43.08
 1246.9 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1568.5   304.81
 960.2 
 1299.4 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  1001.4   111.33
 803.2 
 814.4 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  2254.4   529.32
 2512.3 
 3272.6 
 Suspension cell culture (SU01)  1922.4   72.28
 1980.9 
 2066.1 
 Suspension cell culture (SU02)  1346.6   37.07
 1399.1 
 Xylem (XL01)  1600.2   70.38
 1717.9 
 1592.2 
 Cork (CR01)  1869   184.1
 1826 
 2164.2 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  1032.1   257.29
 567.3 
 608.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  563   805.72
 1831 
 335.8 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  819.3   300.9
 250 
 365.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1538   687.58
 300.2 
 400.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1541   269.25
 1470.6 
 1968.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1255.9   223.36
 997 
 1441.7 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  405.4   391.64
 1034.7 
 316.2 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  212.6   190.59
 200.3 
 536.4 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  652.9   204.76
 270.8 
 334.2 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress