TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g30120
TIGR annotation:ATPase E1-E2 type family protein / heavy-metal-associated domain-containing protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  68   20.12
 107.6 
 94.2 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  110.4   16.58
 98.7 
 126.2 
 87.4 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  94.1   6.23
 91.8 
 98.4 
 83.6 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  98.7   6.21
 98.6 
 96.1 
 85.6 
 0.70 Seedling (SL01)  107.6   14.52
 91.3 
 78.6 
 0.70 Seedling (SL02)  78.1   7.69
 90.2 
 76 
 0.70 Seedling (SL10)  60.7   20.71
 101 
 72.6 
 0.70 Seedling (SL12)  100.4   23.04
 135.1 
 91.5 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  80.1   2.24
 76.3 
 80.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  86.5   16.26
 68.7 
 101.1 
 1.00 Seedling (SL07)  80.2   6.05
 71.7 
 1.00 Seedling (SL09)  43.2   7.07
 57.3 
 49.5 
 1.00 Seedling (SL11)  64   13.8
 79.6 
 45.8 
 61.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  71.9   6.18
 80.6 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  96.1   4.74
 89.9 
 86.7 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  75.6   19.71
 97.7 
 115 
 1.02 Seedling (SL08)  92.3   5.13
 85.1 
 1.02 Roots (RT01)  102.3   12.62
 84.4 
 1.02 Lateral roots (RH01)  83.6   4.9
 92.4 
 84.4 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  83.8   3.58
 89.4 
 90.5 
 1.05 Rosette (LF11)  86.9   6.61
 98.6 
 87.4 
 1.14 Rosette (LF12)  71.2   15.09
 82.6 
 101.1 
 1.14 Rosette (LF13)  89   9.93
 74.9 
 3.20 Whole plant (WP05)  76   8.32
 92.4 
 81.6 
 3.70 Adult leaf (LF01)  96.4   12.1
 92.2 
 114.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  113.1   4.36
 110.6 
 104.6 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  91.5   4.59
 100.6 
 95.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  103   8.56
 96.3 
 86 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  99.4   9.02
 83.9 
 83.8 
 3.90 Rosette (SH01)  88.2   9.94
 73.2 
 91.9 
 3.90 Roots (RT04)  121   23.58
 162.1 
 161.5 
 3.90 Roots (RT05)  181.5   101.77
 179.8 
 356.9 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  86.7   5.02
 74.7 
 78.7 
 80.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  56.9   3.71
 62.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  78   7.31
 64.7 
 66 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  71.5   1.04
 71.1 
 73 
 5.10 Roots (RT02)  106.3   3.91
 111.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  117   14.7
 96.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  102   9.81
 115.9 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  150   2.65
 153.7 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  157   6.3
 165.9 
 6.00 Leaf (LF08)  90.6   7.31
 104.6 
 93.8 
 6.00 Leaf (LF16)  59   3.2
 64.6 
 59.1 
 6.00 Inflorescence (IN01)  63.8   7.44
 74.4 
 6.10 Leaf (LF10)  75.3   11.15
 87.2 
 97.6 
 6.10 Stem base (ST01)  93   0.69
 92 
 6.10 Stem top (ST02)  79.5   5
 86.6 
 6.10 Flower, open (FL01)  65.7   1.02
 67.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  63.9   6.32
 55 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  101.2   9.33
 83.7 
 98.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  74.8   10.72
 91.9 
 72.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  117.5   13.02
 103.2 
 91.6 
 Suspension cell culture (SU01)  71.2   15.92
 96.3 
 100.8 
 Suspension cell culture (SU02)  100.3   18.85
 73.7 
 Xylem (XL01)  96   6.7
 84.2 
 84.6 
 Cork (CR01)  88.7   4.03
 91.9 
 96.7 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  187   34.95
 256.7 
 226.1 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  292   49.39
 222.7 
 196.3 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  185.7   93.53
 358.2 
 209.3 
 Heart embryo, roots (EHR1)  194.5   53.16
 299.6 
 233.5 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  134   22.03
 173.4 
 170.7 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  155.6   7.42
 143.6 
 142 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  273.6   105.49
 209.3 
 415.5 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  151.1   102.52
 113.1 
 306.6 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  381.3   140.52
 225.4 
 100.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress