TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g35870
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  236.7   3.91
 239.3 
 244.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  317.5   31.7
 377.5 
 389.3 
 353.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  351.8   27.09
 312.3 
 293.5 
 343.1 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  230.1   22.54
 263.8 
 226.8 
 210 
 0.70 Seedling (SL01)  322.8   13.41
 346.8 
 324.4 
 0.70 Seedling (SL02)  197.2   17.39
 217.1 
 182.5 
 0.70 Seedling (SL10)  125.8   3.71
 131.4 
 132.8 
 0.70 Seedling (SL12)  118   12.85
 133.2 
 107.6 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  416.9   16.89
 385 
 391.4 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  209.2   32.78
 233.7 
 274.1 
 1.00 Seedling (SL07)  272.4   6.77
 262.9 
 1.00 Seedling (SL09)  162.9   7.76
 178.4 
 170.2 
 1.00 Seedling (SL11)  128.7   24.18
 145.1 
 184.1 
 139.1 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  252.5   2.83
 248.5 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  260.2   38.02
 228.6 
 184.5 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  179.5   27.12
 187.1 
 229.8 
 1.02 Seedling (SL08)  209.8   55.73
 288.6 
 1.02 Roots (RT01)  165.8   14.46
 186.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  256.2   37.66
 263.1 
 194.7 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  275.4   55.77
 220.6 
 163.8 
 1.05 Rosette (LF11)  234.9   8.52
 228.6 
 218 
 1.14 Rosette (LF12)  241.5   2.24
 244.9 
 240.6 
 1.14 Rosette (LF13)  187.7   8.31
 176 
 3.20 Whole plant (WP05)  131.7   1.01
 130.1 
 132 
 3.70 Adult leaf (LF01)  198.5   20.26
 237.6 
 227.1 
 3.70 Adult leaf (LF02)  232.8   15.77
 201.3 
 216.9 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  208.8   29.83
 248.2 
 267.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  451.7   98.44
 271.3 
 293.3 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  374   83.24
 214.5 
 335.5 
 3.90 Rosette (SH01)  193.9   38.5
 200.5 
 263.6 
 3.90 Roots (RT04)  227.3   15.79
 255.9 
 253.3 
 3.90 Roots (RT05)  280.1   40.9
 361.8 
 324.2 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  200   24.46
 207.4 
 230.5 
 254.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  223.2   14.07
 203.3 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  413.6   107.79
 224.3 
 229.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  274   29.8
 223.4 
 221.5 
 5.10 Roots (RT02)  329.1   93.9
 196.3 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  347.5   69.35
 445.6 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  306.5   71
 406.9 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  443.8   49.85
 514.3 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  532.1   51.08
 604.4 
 6.00 Leaf (LF08)  251   16.28
 283.6 
 265.8 
 6.00 Leaf (LF16)  125.6   19.64
 147 
 164.8 
 6.00 Inflorescence (IN01)  226.4   27.9
 265.9 
 6.10 Leaf (LF10)  297.7   46.84
 220 
 213.5 
 6.10 Stem base (ST01)  362.8   116.51
 527.6 
 6.10 Stem top (ST02)  260.8   112.02
 419.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  181.2   7.76
 192.2 
 6.30 Silique, young (FS01)  224.6   11.68
 208.1 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  446.7   114.46
 257.4 
 240.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  303.5   41.67
 246.5 
 222.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  525.3   160.12
 272.2 
 228.9 
 Suspension cell culture (SU01)  269.3   2.24
 267.1 
 264.8 
 Suspension cell culture (SU02)  487.6   14.36
 507.9 
 Xylem (XL01)  264.2   8.57
 273.9 
 256.8 
 Cork (CR01)  262.2   10.14
 268.9 
 282.1 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  338   73.98
 400.5 
 485.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  414.4   43.83
 402.8 
 483.9 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  354.2   80.41
 298.5 
 457 
 Heart embryo, roots (EHR1)  270.1   43.9
 352.4 
 337.7 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  244.5   72.59
 109.6 
 130.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  84.1   147.04
 375.2 
 193.4 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  137.9   98.91
 242.4 
 335.6 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  382.2   134.8
 255.1 
 112.8 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  165.9   137.45
 238 
 431.7 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress