TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g01270
TIGR annotation:double-stranded RNA-binding domain (DsRBD)-containing protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  223.9   32.26
 288.4 
 256.1 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  227.8   13.1
 202 
 219.9 
 231.3 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  236.1   9.37
 258.7 
 243.8 
 246.9 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  204.7   11.45
 213.9 
 224.1 
 230.8 
 0.70 Seedling (SL01)  104.5   5.95
 116.2 
 108.5 
 0.70 Seedling (SL02)  126.2   4.04
 119.2 
 119.2 
 0.70 Seedling (SL10)  173.4   17.84
 176.6 
 144.2 
 0.70 Seedling (SL12)  174.2   5.58
 163.1 
 168.9 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  294.2   11.84
 296.2 
 274.8 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  197.5   11.6
 218.1 
 198.6 
 1.00 Seedling (SL07)  150.6   8.09
 139.2 
 1.00 Seedling (SL09)  224.1   9.72
 241 
 240.8 
 1.00 Seedling (SL11)  156.9   41.54
 136.4 
 196.3 
 229.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  175.3   1.96
 178.1 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  115.9   28.09
 168.1 
 160 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  107   11.62
 128.9 
 124.9 
 1.02 Seedling (SL08)  196.5   23.24
 163.6 
 1.02 Roots (RT01)  168.5   30.3
 211.4 
 1.02 Lateral roots (RH01)  171.6   28.74
 152.1 
 208.7 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  161.1   20.18
 186.7 
 200.9 
 1.05 Rosette (LF11)  181.9   6.77
 191.6 
 194.9 
 1.14 Rosette (LF12)  146.5   24.5
 195 
 164.6 
 1.14 Rosette (LF13)  185.1   4.6
 178.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  138.8   5.12
 148.9 
 142.4 
 3.70 Adult leaf (LF01)  270.4   18.5
 237.5 
 239.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  267.6   18.04
 235.5 
 237.3 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  171.4   16.91
 138.8 
 147.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  151.4   9.67
 137.8 
 156.5 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  112.7   15.48
 140.6 
 138.3 
 3.90 Rosette (SH01)  218.5   10.09
 201.7 
 200.4 
 3.90 Roots (RT04)  221   18.2
 254.9 
 249.5 
 3.90 Roots (RT05)  169.2   12.38
 159 
 144.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  198   4.44
 203.8 
 199.8 
 193.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  234.6   3.31
 230 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  136.8   27.38
 184.5 
 183.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  143.7   20.12
 183.7 
 167.9 
 5.10 Roots (RT02)  156.2   13.56
 175.4 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  150.9   12.32
 168.3 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  160   15.17
 138.5 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  177.3   1.4
 179.3 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  204.6   42.83
 265.1 
 6.00 Leaf (LF08)  204.4   17.45
 170.9 
 179 
 6.00 Leaf (LF16)  234.2   21.64
 264.9 
 275.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  217.2   13.19
 198.6 
 6.10 Leaf (LF10)  170.1   33.51
 236.6 
 211.1 
 6.10 Stem base (ST01)  146.4   17.31
 170.9 
 6.10 Stem top (ST02)  163.4   17.08
 139.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  244.6   4.77
 251.4 
 6.30 Silique, young (FS01)  228.3   13.41
 209.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  118.4   30.23
 131.5 
 176.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  226   17.75
 204.8 
 190.8 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  160   18.08
 124 
 138.9 
 Suspension cell culture (SU01)  145.1   6.63
 152.2 
 158.4 
 Suspension cell culture (SU02)  134.7   11.14
 150.5 
 Xylem (XL01)  301.9   14.18
 274.6 
 294.8 
 Cork (CR01)  256.1   15.24
 237.7 
 268 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  150.8   29.87
 119.4 
 179.1 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  192.9   61.05
 218.5 
 309.1 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  149.8   41.97
 142.8 
 218.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  155.5   39.5
 234.4 
 198.4 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  168.2   15
 198.2 
 182.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  197.4   32.92
 137.4 
 143.9 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  226.9   66.21
 154 
 94.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  235.4   28.15
 289.9 
 250.6 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  213.4   37.16
 139.1 
 173.4 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress