TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g01490
TIGR annotation:cation exchanger, putative (CAX4)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  242.6   113.54
 385.6 
 466.9 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  562.7   33.15
 640.9 
 586.3 
 586.3 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  596.7   50.86
 497 
 484.2 
 510.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  443.3   53.82
 434.1 
 335.7 
 358.5 
 0.70 Seedling (SL01)  443.7   31.74
 455.1 
 503.5 
 0.70 Seedling (SL02)  366.8   19.83
 406.1 
 391.2 
 0.70 Seedling (SL10)  227.5   2.09
 226.7 
 230.7 
 0.70 Seedling (SL12)  308.9   42.91
 394.7 
 350.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  371.3   72.22
 231.4 
 270.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  293.6   34.76
 235.6 
 297.8 
 1.00 Seedling (SL07)  372.6   35.74
 423.1 
 1.00 Seedling (SL09)  241.3   14.25
 266.8 
 243.1 
 1.00 Seedling (SL11)  260.1   57.83
 283.1 
 167.4 
 178.9 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  274.1   1.11
 275.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  470.9   13.48
 494.7 
 471.9 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  324.4   49.23
 398.8 
 417.5 
 1.02 Seedling (SL08)  394.5   105.76
 544.1 
 1.02 Roots (RT01)  323.8   10.25
 338.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  526.5   29.5
 517 
 471.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  546.9   61.97
 473.4 
 423.7 
 1.05 Rosette (LF11)  306   79.89
 462 
 413.8 
 1.14 Rosette (LF12)  443.9   28.64
 496.7 
 451 
 1.14 Rosette (LF13)  312.2   0.1
 312.1 
 3.20 Whole plant (WP05)  245.4   24.61
 274 
 294.4 
 3.70 Adult leaf (LF01)  330.5   31.63
 391.1 
 376.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  403   31.07
 363.9 
 425.2 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  378.6   37.29
 367.1 
 309.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  562.4   68.36
 429.4 
 523.3 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  539   48.7
 442.7 
 503.4 
 3.90 Rosette (SH01)  370.4   65.78
 402.8 
 497 
 3.90 Roots (RT04)  538.2   68.16
 674 
 616.1 
 3.90 Roots (RT05)  495.9   129.51
 696.7 
 738 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  422.4   45.93
 375 
 379 
 473.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  171.8   4.62
 178.3 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  394.6   66.11
 284.3 
 276.3 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  386.9   59.6
 273.8 
 297.7 
 5.10 Roots (RT02)  567.5   128.55
 385.7 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  451.4   20.7
 480.7 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  325.4   151.51
 539.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  497.1   47
 563.6 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  673.1   4.19
 667.2 
 6.00 Leaf (LF08)  396.4   72.14
 489.3 
 347.2 
 6.00 Leaf (LF16)  247.2   16.27
 221.7 
 216.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  342.6   55.15
 420.6 
 6.10 Leaf (LF10)  506.4   77.33
 353.5 
 409.7 
 6.10 Stem base (ST01)  371.9   47.7
 439.4 
 6.10 Stem top (ST02)  324.4   59.66
 408.8 
 6.10 Flower, open (FL01)  178.6   3.34
 183.3 
 6.30 Silique, young (FS01)  189.7   3.16
 185.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  497.2   28.66
 446.2 
 494.5 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  455.6   69.76
 354.3 
 321.8 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  627.8   92.2
 509.5 
 446.1 
 Suspension cell culture (SU01)  492.5   88
 319 
 380.1 
 Suspension cell culture (SU02)  457.6   13.76
 477 
 Xylem (XL01)  326.5   4.57
 321.9 
 317.3 
 Cork (CR01)  276.9   2.57
 280.8 
 281.8 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  605.1   171.57
 454.6 
 796.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  1242.8   344.91
 566.1 
 788.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  470.9   147.79
 765 
 592.6 
 Heart embryo, roots (EHR1)  474.1   86.1
 543.8 
 645.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  351.9   81.13
 496.7 
 487.9 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  395.3   29.52
 355.5 
 413.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  735.3   27.82
 749.9 
 789.1 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  454   189.52
 351 
 718.4 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  921   71.26
 937.6 
 1051.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress