TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g02410
TIGR annotation:DIE2/ALG10 family
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  405.3   27.3
 362.1 
 412.6 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  282.2   28.78
 221.5 
 256.9 
 282.4 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  286.5   7.87
 276.8 
 272.3 
 268.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  316   22.35
 348.7 
 342.2 
 370.3 
 0.70 Seedling (SL01)  294.7   11.57
 294.9 
 274.7 
 0.70 Seedling (SL02)  285   33.48
 225.2 
 281.3 
 0.70 Seedling (SL10)  197.2   11.65
 202.1 
 219.4 
 0.70 Seedling (SL12)  268.5   6.63
 267.7 
 256.6 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  266.6   13.08
 291.1 
 270.9 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  309.8   16.58
 336.9 
 339.9 
 1.00 Seedling (SL07)  233.6   33.05
 280.4 
 1.00 Seedling (SL09)  163   5.24
 171.8 
 162.5 
 1.00 Seedling (SL11)  209.8   22.04
 212.7 
 202 
 165 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  260   7.57
 270.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  364.3   44.03
 423.3 
 450.4 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  257.2   13.98
 266 
 238.6 
 1.02 Seedling (SL08)  232.6   14.93
 253.7 
 1.02 Roots (RT01)  373.7   12.08
 356.6 
 1.02 Lateral roots (RH01)  346.9   20.09
 340.4 
 309.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  277.5   20.31
 237.4 
 263.4 
 1.05 Rosette (LF11)  310.1   34.08
 246.3 
 299.1 
 1.14 Rosette (LF12)  280   23
 325.9 
 305.5 
 1.14 Rosette (LF13)  253.8   21.97
 222.7 
 3.20 Whole plant (WP05)  289.7   31.34
 328.4 
 351.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  236.7   7.91
 220.9 
 227.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  250.6   14.59
 254.6 
 227.6 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  412.3   30.15
 354.9 
 399.7 
 3.90 Adult leaf (LF03)  410.5   100.75
 261.9 
 218.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  402.7   97.68
 216.2 
 259.1 
 3.90 Rosette (SH01)  234.2   90.54
 404.2 
 373.4 
 3.90 Roots (RT04)  269.8   27.75
 321.1 
 277.2 
 3.90 Roots (RT05)  201   49.79
 298.9 
 265.3 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  301.7   23.67
 342.4 
 337.1 
 296.5 
 5.10 Flower, buds (FB01)  243.6   40.48
 300.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  343.3   58.91
 237.2 
 245.7 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  358   38.44
 289.9 
 293 
 5.10 Roots (RT02)  420.2   63.21
 330.8 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  628.9   14.51
 649.4 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  644.7   1.18
 646.4 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  323.2   1.13
 324.8 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  262.8   78.32
 373.5 
 6.00 Leaf (LF08)  283.2   11.68
 303.7 
 283.7 
 6.00 Leaf (LF16)  133.5   4.08
 126.2 
 133.1 
 6.00 Inflorescence (IN01)  350.2   53.47
 274.6 
 6.10 Leaf (LF10)  282.8   60.78
 339.5 
 404.3 
 6.10 Stem base (ST01)  428.7   19.73
 400.8 
 6.10 Stem top (ST02)  420.2   1.9
 422.9 
 6.10 Flower, open (FL01)  220.8   7.5
 231.4 
 6.30 Silique, young (FS01)  305.4   5.49
 297.6 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  227.8   28.89
 252.6 
 285.4 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  286.6   25.76
 264.2 
 235.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  266.5   49.57
 358 
 345.3 
 Suspension cell culture (SU01)  232.4   14.62
 261.6 
 247.4 
 Suspension cell culture (SU02)  328.1   115.43
 164.8 
 Xylem (XL01)  260.5   21.79
 298.8 
 297.8 
 Cork (CR01)  242.7   14.39
 266 
 268.9 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  395.7   84.18
 525.2 
 367.2 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  473   47.91
 377.2 
 427.1 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  346.1   31.93
 382.4 
 409.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1110.3   379.23
 466.4 
 441.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  195.4   150.07
 413.6 
 483 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  170.7   97.94
 313.7 
 358.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  633.4   188.41
 898.6 
 534.2 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  362.3   109.52
 170 
 357 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  265.7   153.31
 558.6 
 490.7 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress