TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g06730
TIGR annotation:peroxidase, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  53.9   7.95
 58.1 
 42.7 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  60.2   8.54
 80.2 
 67.7 
 64.7 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  62.9   3.53
 67.4 
 59.4 
 60.6 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  47.3   2.14
 50.7 
 52.3 
 51 
 0.70 Seedling (SL01)  77.5   5.35
 67.5 
 75.8 
 0.70 Seedling (SL02)  73.4   3.56
 77.8 
 70.8 
 0.70 Seedling (SL10)  68.5   4.71
 77.3 
 75.9 
 0.70 Seedling (SL12)  70   4.89
 62.5 
 71.7 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  100.6   21.39
 143.3 
 119.5 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  192.6   12.75
 203.9 
 218.1 
 1.00 Seedling (SL07)  62.7   4.36
 68.9 
 1.00 Seedling (SL09)  99.2   11.86
 99.6 
 78.9 
 1.00 Seedling (SL11)  64.5   4.8
 70 
 62.5 
 58.5 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  108.5   27.34
 147.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  80.5   19.13
 72.3 
 108.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  88.5   7.46
 75 
 87.2 
 1.02 Seedling (SL08)  101.6   16.7
 78 
 1.02 Roots (RT01)  94.8   101.41
 238.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  69.3   6.05
 70.2 
 59.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  91.6   9.17
 76.8 
 93.7 
 1.05 Rosette (LF11)  64.9   1.74
 62.7 
 61.5 
 1.14 Rosette (LF12)  87.8   13.01
 65.5 
 88.2 
 1.14 Rosette (LF13)  66.5   0.58
 67.3 
 3.20 Whole plant (WP05)  82.2   7.13
 75.3 
 67.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  61.4   14.33
 81.4 
 89.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  88.4   8.96
 70.8 
 76.6 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  74   7.63
 87.4 
 74.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  82.2   8.59
 76.4 
 65.3 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  70.4   1.52
 71.3 
 73.3 
 3.90 Rosette (SH01)  71.3   6.37
 79.4 
 83.8 
 3.90 Roots (RT04)  295.8   41.44
 236.1 
 216.1 
 3.90 Roots (RT05)  146.3   2.4
 143.8 
 148.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  76.8   8.04
 66.4 
 58.4 
 61.5 
 5.10 Flower, buds (FB01)  49.5   8.23
 37.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  59.9   7.49
 45.5 
 49.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  44.6   7.6
 57.5 
 44.2 
 5.10 Roots (RT02)  282.1   125.65
 104.4 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  66.4   8.09
 77.9 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  62.1   4.84
 55.3 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  86.5   29.52
 128.3 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  149.2   2.15
 152.3 
 6.00 Leaf (LF08)  72.9   1.47
 72.9 
 70.3 
 6.00 Leaf (LF16)  56   8.98
 68.7 
 73.4 
 6.00 Inflorescence (IN01)  58.6   0.51
 57.9 
 6.10 Leaf (LF10)  85.5   10.19
 65.5 
 72 
 6.10 Stem base (ST01)  47   13.76
 66.4 
 6.10 Stem top (ST02)  47.7   9.92
 61.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  62.9   2.8
 58.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  52.7   6.65
 43.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  61.6   4.73
 53.4 
 53.5 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  60.9   5.98
 58.5 
 69.8 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  65.5   13.79
 58.4 
 38.9 
 Suspension cell culture (SU01)  396.5   137.2
 637.9 
 630 
 Suspension cell culture (SU02)  412.8   14.3
 392.5 
 Xylem (XL01)  59.8   1.62
 57.3 
 56.9 
 Cork (CR01)  125   13.5
 99.6 
 120.2 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  239.3   26.7
 265.6 
 212.2 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  229.6   3.61
 222.7 
 224.1 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  199.4   191.17
 561.4 
 273.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  140.8   60.32
 248.2 
 242 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  138.5   29.94
 178.7 
 197.1 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  179.1   18.46
 192 
 155.6 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  195.1   116.08
 138.3 
 361.6 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  259   125.92
 117.7 
 368.8 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  470   155.46
 304 
 159.4 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress