TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g07350
TIGR annotation:tudor domain-containing protein / nuclease family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1444.4   73.5
 1591.3 
 1514.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  1019.8   137.47
 739.1 
 788.1 
 974.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  854.2   89.28
 751.4 
 959.7 
 909.4 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  1506   61.32
 1513.2 
 1462.1 
 1607.8 
 0.70 Seedling (SL01)  737   12.76
 749.8 
 762.5 
 0.70 Seedling (SL02)  833.7   20.82
 825.6 
 865 
 0.70 Seedling (SL10)  1378.8   98.36
 1570.3 
 1513.6 
 0.70 Seedling (SL12)  1052.4   52.71
 966 
 956.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  1210.8   143.91
 1414.6 
 1488.7 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1621.5   81.72
 1459.1 
 1556.6 
 1.00 Seedling (SL07)  762.6   37.96
 816.3 
 1.00 Seedling (SL09)  1105.8   82.17
 1006.8 
 942.7 
 1.00 Seedling (SL11)  837.7   136.02
 1113.6 
 1135.1 
 1054.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1177.9   3.32
 1173.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  875.4   86.76
 969.7 
 1048.7 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  663.7   38.06
 634.7 
 588.2 
 1.02 Seedling (SL08)  1066   2.52
 1062.5 
 1.02 Roots (RT01)  1605.1   215.84
 1299.9 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1386.5   121.37
 1292.4 
 1145.6 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1189.5   87
 1107.1 
 1015.6 
 1.05 Rosette (LF11)  973.1   52.19
 1074.3 
 1001.7 
 1.14 Rosette (LF12)  637.6   59.06
 662 
 749.9 
 1.14 Rosette (LF13)  847.3   39.85
 903.7 
 3.20 Whole plant (WP05)  412.5   15.56
 381.5 
 394.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  709.5   17.69
 693.3 
 674.1 
 3.70 Adult leaf (LF02)  686.9   36.58
 752.7 
 692.2 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  951.4   117.25
 729.8 
 774.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  522.6   122.41
 701 
 757 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  874.9   24.19
 877.6 
 834.4 
 3.90 Rosette (SH01)  886   185.55
 1214.7 
 901.2 
 3.90 Roots (RT04)  1458   169.45
 1183.1 
 1148.9 
 3.90 Roots (RT05)  1074.5   130.89
 1142.4 
 889.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  912.4   99.54
 1121.4 
 1103.6 
 1107.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1129.5   36.97
 1077.3 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  804.2   142.47
 1070.6 
 849.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  944.4   205.62
 1337.2 
 1035.2 
 5.10 Roots (RT02)  1320.4   176.3
 1569.7 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  1392.7   27.41
 1431.5 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1410.7   17.52
 1435.5 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  1271.6   86.55
 1149.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  865.7   234.9
 533.5 
 6.00 Leaf (LF08)  569.5   25.79
 520.9 
 530.2 
 6.00 Leaf (LF16)  740.4   76.9
 831.7 
 893.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1509.8   73.34
 1613.5 
 6.10 Leaf (LF10)  449.1   261.23
 756.7 
 968.7 
 6.10 Stem base (ST01)  702   42.61
 641.8 
 6.10 Stem top (ST02)  1153.6   191.03
 883.4 
 6.10 Flower, open (FL01)  941.8   70.39
 1041.3 
 6.30 Silique, young (FS01)  1014.1   30.12
 1056.7 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  977.5   36.28
 977.9 
 1040.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  916   33.29
 883.6 
 849.4 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1680.3   303.57
 1195.3 
 1121.4 
 Suspension cell culture (SU01)  814.6   18.76
 797.1 
 834.6 
 Suspension cell culture (SU02)  873   236.21
 1207 
 Xylem (XL01)  1394.3   153.69
 1599.5 
 1298.8 
 Cork (CR01)  1429.6   37.1
 1375.6 
 1358.5 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  1179   622.63
 1815.9 
 570.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  1767   416.57
 959.6 
 1185.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1499.3   883.94
 584.8 
 2352.3 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1848.6   812.99
 3020.4 
 1458.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  2362.5   133.13
 2096.7 
 2243.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  3001.7   1404.63
 287.2 
 2271.1 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  596.3   195.59
 981.9 
 846.3 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  176.2   451.68
 1078.7 
 593.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  1500.7   578.59
 386.5 
 673 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress