TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g14420
TIGR annotation:copine-related
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  259.5   17.12
 287.2 
 290.8 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  532.8   14.39
 558.1 
 533.6 
 558.2 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  586.5   35.92
 526 
 608.3 
 555.8 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  347.3   23.99
 367.2 
 309.4 
 340.6 
 0.70 Seedling (SL01)  434.6   10.6
 418.5 
 414.6 
 0.70 Seedling (SL02)  368   12.24
 384.7 
 391.8 
 0.70 Seedling (SL10)  209.4   23.33
 245.1 
 253.2 
 0.70 Seedling (SL12)  504.2   36.77
 462.1 
 431 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  276.7   20.05
 311.8 
 277.4 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  262.1   41.17
 260.8 
 332.8 
 1.00 Seedling (SL07)  391.2   42.39
 451.2 
 1.00 Seedling (SL09)  381.1   17.34
 381.2 
 351.1 
 1.00 Seedling (SL11)  469   60.12
 470.8 
 402.4 
 345.4 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  379.6   1.93
 382.3 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  460.4   57.53
 348.1 
 382.4 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  284.7   12.6
 297.8 
 309.9 
 1.02 Seedling (SL08)  288.8   21.59
 319.3 
 1.02 Roots (RT01)  378.6   6.76
 369.1 
 1.02 Lateral roots (RH01)  295.3   44.49
 360.9 
 276 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  351.7   38.23
 279.8 
 293.3 
 1.05 Rosette (LF11)  354.5   10.19
 344.7 
 365 
 1.14 Rosette (LF12)  339.7   30.66
 284.8 
 336 
 1.14 Rosette (LF13)  316.6   12.13
 333.8 
 3.20 Whole plant (WP05)  327.4   15.77
 358.4 
 348.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  317.1   17.26
 351.5 
 337.3 
 3.70 Adult leaf (LF02)  306.5   14.12
 326.6 
 299.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  338.2   16.71
 349.2 
 316.4 
 3.90 Adult leaf (LF03)  526.5   70.9
 391.7 
 420.9 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  454.1   41.08
 378.5 
 388.5 
 3.90 Rosette (SH01)  307.9   27.2
 325.4 
 361.2 
 3.90 Roots (RT04)  346.6   23.38
 377.7 
 392.4 
 3.90 Roots (RT05)  367.7   52.28
 360.5 
 454.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  344.2   31.32
 287.9 
 344 
 358.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  575.2   89.02
 449.3 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  877.1   257.89
 393.6 
 479.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  701   157.91
 402 
 639.6 
 5.10 Roots (RT02)  535   150.41
 322.3 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  387.5   34.18
 435.8 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  351.9   102.25
 496.5 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  397.5   68.19
 494 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  306   63.18
 216.6 
 6.00 Leaf (LF08)  334.6   3.73
 336.5 
 341.8 
 6.00 Leaf (LF16)  284.7   11.53
 285.6 
 305.1 
 6.00 Inflorescence (IN01)  368.2   35.66
 418.6 
 6.10 Leaf (LF10)  359.3   16.15
 334 
 364 
 6.10 Stem base (ST01)  311.2   47.75
 378.7 
 6.10 Stem top (ST02)  391.4   52.9
 466.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  513   53.86
 436.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  466.1   0.01
 466.1 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  336.5   17.56
 346.3 
 370.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  575   87.85
 573.4 
 422 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  386.9   12.92
 409.8 
 388 
 Suspension cell culture (SU01)  908   68
 775 
 866.3 
 Suspension cell culture (SU02)  627   5.81
 635.2 
 Xylem (XL01)  209.5   8.42
 202.9 
 192.8 
 Cork (CR01)  258.4   5.5
 255.3 
 266 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  215.1   44.21
 155.5 
 241.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  207.9   30.75
 202.8 
 152.3 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  442.3   35.26
 375.8 
 429.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  437.9   128.56
 235.7 
 199.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  781.4   311.61
 248.1 
 235.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  129.4   312.15
 738.2 
 314.1 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  290.1   56.65
 243.6 
 177.4 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  748.5   436.3
 442.6 
 1303.3 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  226.6   10.57
 223.5 
 243.2 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress