TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g16980
TIGR annotation:NADP-dependent oxidoreductase, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  203.4   42.9
 289 
 241.9 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  1184   44.95
 1079.3 
 1139.1 
 1160.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  879.7   33.22
 828 
 842.1 
 799.9 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  205.3   24.44
 249.6 
 203.7 
 243.7 
 0.70 Seedling (SL01)  167.4   10.81
 185 
 187.2 
 0.70 Seedling (SL02)  146.7   12.49
 151 
 170.1 
 0.70 Seedling (SL10)  269.6   14.18
 258.4 
 286.6 
 0.70 Seedling (SL12)  151.1   2.32
 154.2 
 155.7 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  90.3   11.8
 67.7 
 73 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  70.6   8.6
 80.5 
 87.7 
 1.00 Seedling (SL07)  284.7   17.19
 309 
 1.00 Seedling (SL09)  115.2   9
 97.3 
 105.1 
 1.00 Seedling (SL11)  164.5   22.75
 133.6 
 110.4 
 146.3 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  71.3   6.49
 80.4 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  211.6   39.89
 183.9 
 133 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  141.6   2.39
 145.2 
 146.1 
 1.02 Seedling (SL08)  158.9   23.09
 126.3 
 1.02 Roots (RT01)  104.4   3.04
 108.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  163.5   29.42
 123.6 
 106.1 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  158.1   17.59
 153.4 
 125.6 
 1.05 Rosette (LF11)  105   9.71
 119.5 
 101.1 
 1.14 Rosette (LF12)  137.2   8.21
 125.6 
 121.3 
 1.14 Rosette (LF13)  132.6   2.64
 128.9 
 3.20 Whole plant (WP05)  153.3   3.43
 147.5 
 153.5 
 3.70 Adult leaf (LF01)  82.7   3.41
 84.6 
 89.3 
 3.70 Adult leaf (LF02)  82.5   9.11
 96.1 
 99.8 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  101.6   4.38
 106.6 
 110.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  135   31.19
 81.9 
 80.2 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  143.1   34.48
 76.5 
 94.6 
 3.90 Rosette (SH01)  83   64.19
 144.6 
 211.3 
 3.90 Roots (RT04)  74.1   13.44
 97.7 
 97.1 
 3.90 Roots (RT05)  107.9   14.11
 135.4 
 116.2 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  101.1   9.49
 90.6 
 109.7 
 111.3 
 5.10 Flower, buds (FB01)  67.4   4.28
 73.5 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  109.3   14.53
 90 
 80.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  97.5   6.42
 84.7 
 89.9 
 5.10 Roots (RT02)  93.4   13.02
 75 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  299   35.87
 248.3 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  244.4   18.49
 270.6 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  301.6   18.6
 327.9 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  243.8   70.89
 344.1 
 6.00 Leaf (LF08)  134.9   17.53
 108.1 
 101.9 
 6.00 Leaf (LF16)  81.3   10.35
 80.4 
 62.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  125.2   33.72
 77.5 
 6.10 Leaf (LF10)  248.1   63.33
 152.7 
 128.2 
 6.10 Stem base (ST01)  82.7   6.08
 91.3 
 6.10 Stem top (ST02)  103.5   19.39
 130.9 
 6.10 Flower, open (FL01)  50   2.3
 53.3 
 6.30 Silique, young (FS01)  55.9   4.11
 50.1 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  202.5   53.46
 113.9 
 106.3 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  565   258.99
 531.1 
 995.7 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  182.3   34.1
 157.4 
 114.9 
 Suspension cell culture (SU01)  269.7   7.27
 257 
 269.5 
 Suspension cell culture (SU02)  245.5   7.81
 256.5 
 Xylem (XL01)  94   9.33
 75.5 
 87.1 
 Cork (CR01)  74   4.28
 80.4 
 72.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  148.7   28.5
 200.6 
 195.2 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  323.1   121.47
 134.8 
 362 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  142.3   3.77
 144.1 
 149.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  117.8   47.81
 204.5 
 196.1 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  161.1   15.61
 173.1 
 192.1 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  151.6   18.95
 177.5 
 188.6 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  240.8   57.64
 144 
 138.1 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  288.3   42.18
 205 
 235.4 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  272.1   94.13
 151 
 86.7 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress