TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g19380
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  376.3   25.13
 326 
 349.5 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  393.4   55.52
 334.5 
 408.3 
 469.7 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  400.7   33.19
 352.5 
 346.3 
 411.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  303.2   30.53
 362 
 302.3 
 347 
 0.70 Seedling (SL01)  397.5   35.58
 332.7 
 390.6 
 0.70 Seedling (SL02)  334   6.24
 323.1 
 333.9 
 0.70 Seedling (SL10)  163.8   8.12
 178.6 
 165.2 
 0.70 Seedling (SL12)  239.7   6.68
 252.5 
 242.6 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  346.6   19.69
 313.4 
 311.7 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  290.9   27.76
 263.9 
 319.4 
 1.00 Seedling (SL07)  299.2   20.9
 328.8 
 1.00 Seedling (SL09)  144.9   12.9
 149.3 
 125.1 
 1.00 Seedling (SL11)  207.1   51.54
 218 
 115.6 
 133.5 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  315.5   12.34
 332.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  320.2   70.18
 431.4 
 450 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  302   18.05
 321.6 
 338.1 
 1.02 Seedling (SL08)  283.8   67.51
 379.3 
 1.02 Roots (RT01)  315.2   5.44
 307.5 
 1.02 Lateral roots (RH01)  410.7   53.97
 395.6 
 310.6 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  471.3   89.56
 316.5 
 315.9 
 1.05 Rosette (LF11)  384.8   35.83
 329.2 
 396.2 
 1.14 Rosette (LF12)  380.9   33.17
 443.5 
 431.2 
 1.14 Rosette (LF13)  348.7   22.04
 317.5 
 3.20 Whole plant (WP05)  332.3   19.91
 370.1 
 362.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  328.6   20.96
 312.6 
 287 
 3.70 Adult leaf (LF02)  349.9   37.58
 381.7 
 306.8 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  357.1   2.33
 356.3 
 352.7 
 3.90 Adult leaf (LF03)  525.7   95.11
 371.9 
 351.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  584.5   105.81
 399.2 
 403.3 
 3.90 Rosette (SH01)  296.4   102.6
 491.1 
 449.9 
 3.90 Roots (RT04)  374.8   45.04
 354.9 
 288.8 
 3.90 Roots (RT05)  334.5   43.74
 415.9 
 402.8 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  384.5   27.95
 349.7 
 395.3 
 336.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  237.4   6.87
 227.6 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  540.3   157.04
 293.6 
 248.7 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  389.4   52.17
 285 
 335.9 
 5.10 Roots (RT02)  437.5   63.76
 347.3 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  577.1   116.74
 742.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  532.7   109.22
 687.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  550   20.65
 579.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  554.3   110.94
 711.2 
 6.00 Leaf (LF08)  348.2   51.48
 443.6 
 429.4 
 6.00 Leaf (LF16)  175.1   12.58
 154.2 
 152.6 
 6.00 Inflorescence (IN01)  532.9   64.61
 441.5 
 6.10 Leaf (LF10)  476   74.53
 330.4 
 430.8 
 6.10 Stem base (ST01)  461.8   70.59
 561.7 
 6.10 Stem top (ST02)  409.2   61.4
 496 
 6.10 Flower, open (FL01)  192.8   21.35
 223 
 6.30 Silique, young (FS01)  240.2   8.42
 228.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  403.3   39.38
 385.9 
 461.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  386.5   29.1
 329.7 
 347.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  522.5   60.81
 430.8 
 407.5 
 Suspension cell culture (SU01)  277.6   23.94
 235 
 237.5 
 Suspension cell culture (SU02)  541.9   144.79
 337.1 
 Xylem (XL01)  373.5   12.07
 384.1 
 397.5 
 Cork (CR01)  328.1   9.2
 333.6 
 315.7 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  574.8   181.57
 936.5 
 727.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  882.5   259.9
 1146.3 
 626.5 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  577.4   134.34
 834.3 
 774.1 
 Heart embryo, roots (EHR1)  581   161.92
 842.3 
 877.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  346.1   150.64
 611.1 
 602.7 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  437.8   72.18
 303.8 
 417.3 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  899.1   79.54
 970.2 
 811.4 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  661.3   252.2
 296.9 
 781.1 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  1723   474.51
 966.4 
 848.5 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress