TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g20310
TIGR annotation:hypothetical protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  102.7   27.5
 145 
 154.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  193.6   33.32
 273 
 245.4 
 226.6 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  231.4   29.02
 182.2 
 164 
 181.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  167.5   7.78
 151.4 
 150.6 
 156.5 
 0.70 Seedling (SL01)  159.9   10.71
 170.4 
 149 
 0.70 Seedling (SL02)  152.3   17.7
 166.7 
 131.5 
 0.70 Seedling (SL10)  96.6   12.1
 119.4 
 101 
 0.70 Seedling (SL12)  98   27.36
 140.6 
 89.6 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  137.8   21.45
 95.6 
 109.9 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  115.2   18.46
 89 
 79.6 
 1.00 Seedling (SL07)  124.2   10.28
 138.8 
 1.00 Seedling (SL09)  77.8   12.39
 102.3 
 86.9 
 1.00 Seedling (SL11)  66.3   17.54
 85.4 
 46.8 
 50.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  107   4.27
 101 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  138.8   14.91
 138.9 
 113 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  118.7   3.85
 126 
 120.1 
 1.02 Seedling (SL08)  78.8   52.67
 153.3 
 1.02 Roots (RT01)  124.5   2.42
 121.1 
 1.02 Lateral roots (RH01)  167.3   36.73
 193.9 
 121.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  130.4   20.83
 90.4 
 100.5 
 1.05 Rosette (LF11)  126.9   15.54
 155.9 
 131.7 
 1.14 Rosette (LF12)  107   19.32
 145.3 
 121.8 
 1.14 Rosette (LF13)  94.8   11.95
 111.8 
 3.20 Whole plant (WP05)  67.9   11.03
 89.7 
 81.4 
 3.70 Adult leaf (LF01)  136.2   9.69
 153.4 
 152.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  131.5   9.57
 138.2 
 150.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  112.3   12.11
 136.5 
 123.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  150.8   17.31
 156.2 
 183.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  165.5   8.66
 162.4 
 178.7 
 3.90 Rosette (SH01)  111.2   6.91
 110.6 
 98.9 
 3.90 Roots (RT04)  118.3   3.78
 111.3 
 112.5 
 3.90 Roots (RT05)  170.4   3.76
 166.7 
 174.2 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  125.3   22.35
 155.9 
 116.7 
 162.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  62   6.18
 53.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  143.5   13.1
 147.8 
 123.3 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  133.9   8.8
 127.7 
 116.5 
 5.10 Roots (RT02)  157.6   14.09
 137.7 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  172.3   34.77
 221.4 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  143.6   36.23
 194.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  302.1   4.15
 308 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  307.9   32.7
 354.1 
 6.00 Leaf (LF08)  129.5   6.69
 141.2 
 140.9 
 6.00 Leaf (LF16)  67.3   4.05
 65.6 
 59.6 
 6.00 Inflorescence (IN01)  141.6   28.06
 181.3 
 6.10 Leaf (LF10)  179.7   45.78
 94.7 
 107.8 
 6.10 Stem base (ST01)  125   8.41
 136.9 
 6.10 Stem top (ST02)  135.3   13.05
 116.8 
 6.10 Flower, open (FL01)  59.8   2.09
 56.8 
 6.30 Silique, young (FS01)  55   1.32
 56.9 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  203.7   18.04
 180.4 
 168.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  174.3   16.85
 170.8 
 143.5 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  151.7   23.21
 160.3 
 116.5 
 Suspension cell culture (SU01)  239.2   72.34
 108.9 
 119.6 
 Suspension cell culture (SU02)  135   12.89
 116.8 
 Xylem (XL01)  106.5   5.54
 97.4 
 107.5 
 Cork (CR01)  115.9   17.83
 97.8 
 80.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  336   85.75
 257.7 
 429 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  361   42.51
 279.5 
 341.2 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  197.6   100.64
 217.6 
 381 
 Heart embryo, roots (EHR1)  277.9   103.6
 482.6 
 352.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  218.5   38.87
 295.8 
 263.7 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  266.7   53.14
 218.5 
 324.6 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  544.5   183.6
 359.5 
 177.4 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  236   59.3
 327.2 
 347.3 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  231.3   43.71
 318 
 264.7 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress