TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g22580
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  157.6   33.28
 187.5 
 224 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  204.4   38.84
 280.7 
 197.4 
 208.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  150.3   14.41
 185 
 170.5 
 164 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  332.7   51.02
 331.6 
 373.7 
 251.8 
 0.70 Seedling (SL01)  195.1   12.57
 208.4 
 183.3 
 0.70 Seedling (SL02)  355.6   63.89
 359.8 
 247.1 
 0.70 Seedling (SL10)  286.5   28.21
 230.2 
 256.6 
 0.70 Seedling (SL12)  222.3   21.4
 214.7 
 255 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  121.1   12.63
 96.8 
 115 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  109.3   8.15
 101 
 93 
 1.00 Seedling (SL07)  1066.1   101.36
 922.8 
 1.00 Seedling (SL09)  359.6   75.79
 449.9 
 510.2 
 1.00 Seedling (SL11)  516.3   154.53
 431 
 778.6 
 664.9 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  507   51.86
 433.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  737.6   29.83
 779.5 
 721.7 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  3477.7   152.5
 3704.6 
 3767.7 
 1.02 Seedling (SL08)  1452.9   324.44
 1911.7 
 1.02 Roots (RT01)  189.5   6.73
 180 
 1.02 Lateral roots (RH01)  169.9   43.64
 226.7 
 141 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1909.7   300.95
 1419.2 
 1362.3 
 1.05 Rosette (LF11)  2196.4   621.54
 1018.6 
 1263.2 
 1.14 Rosette (LF12)  4014.2   1478.08
 1260.5 
 3568.6 
 1.14 Rosette (LF13)  1471.9   289.15
 1063 
 3.20 Whole plant (WP05)  4614.5   280.19
 4742.6 
 4206.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  498.5   24.5
 454.9 
 457.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  346.1   31.54
 308.5 
 371.1 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  7008.7   981.23
 8221.5 
 8951.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  5500.6   1364.64
 4036.3 
 2773.9 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  3873   993.35
 1997.5 
 2367.8 
 3.90 Rosette (SH01)  2885.7   331.95
 3201.9 
 3549.4 
 3.90 Roots (RT04)  305.2   81.64
 159.7 
 168.4 
 3.90 Roots (RT05)  205.9   20.81
 244.8 
 238 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1510.1   308.68
 1059.1 
 948.6 
 791.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  3018.6   317.65
 3467.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  979.8   317.26
 1413 
 1597.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  3099.4   1456.46
 4776.7 
 1875.6 
 5.10 Roots (RT02)  213.2   20.99
 242.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  186.7   49.76
 257.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  133.6   28.37
 173.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  194.1   43.04
 255 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  247.4   4.54
 240.9 
 6.00 Leaf (LF08)  675.5   197.22
 297.3 
 389.5 
 6.00 Leaf (LF16)  410.5   21.35
 391.8 
 367.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  5265.1   759.52
 4191 
 6.10 Leaf (LF10)  1652.9   1110.97
 3859 
 2985.3 
 6.10 Stem base (ST01)  588.3   71.7
 486.9 
 6.10 Stem top (ST02)  3884.7   103.48
 4031 
 6.10 Flower, open (FL01)  6458   260.06
 6090.2 
 6.30 Silique, young (FS01)  4563.9   1499.54
 2443.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  542.3   451.97
 907.7 
 1441 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  218.9   223.6
 597.5 
 202.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  386.5   134.03
 158.8 
 150.2 
 Suspension cell culture (SU01)  264.5   80.29
 122.1 
 129 
 Suspension cell culture (SU02)  152.7   47.19
 219.4 
 Xylem (XL01)  97.8   7.75
 82.6 
 87.6 
 Cork (CR01)  94.3   9.03
 81.7 
 76.8 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  220.8   12.87
 211.1 
 236.6 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  230.2   15
 201.5 
 208.2 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  391.7   114.4
 176.9 
 216.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  163.3   939.3
 1809.9 
 203.4 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1020.4   69.24
 1042.3 
 912.9 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  125.2   152.27
 334.1 
 421.6 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  211.2   419.39
 963 
 265.1 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  608.8   459.41
 1099.6 
 181.5 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  142.2   178.32
 200.1 
 475.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress