TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g23540
TIGR annotation:26S proteasome regulatory subunit, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  2494   184.06
 2690.2 
 2322.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  1775.6   45.59
 1794.8 
 1876.3 
 1842 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  2109.6   50.47
 2065.4 
 2163.7 
 2051.9 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  2820   109.21
 2712.9 
 2865.5 
 2622.4 
 0.70 Seedling (SL01)  1697.9   39.57
 1681.7 
 1756.9 
 0.70 Seedling (SL02)  1629.4   69.13
 1730.1 
 1597.7 
 0.70 Seedling (SL10)  2184.4   161.35
 2503.1 
 2387.6 
 0.70 Seedling (SL12)  1610.1   31.67
 1655.8 
 1670.9 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  2115.6   216.33
 2520.5 
 2450.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1629.3   74.61
 1519.6 
 1662 
 1.00 Seedling (SL07)  1335.6   20.15
 1307.1 
 1.00 Seedling (SL09)  1418.2   114.97
 1348.8 
 1193.7 
 1.00 Seedling (SL11)  1402.1   203.29
 1701.8 
 1770.8 
 1875.7 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1344.6   72.71
 1241.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1533.5   178.33
 1178 
 1380.3 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1658.9   83.28
 1548.1 
 1711.2 
 1.02 Seedling (SL08)  1292.1   43.65
 1230.3 
 1.02 Roots (RT01)  2033.2   93.16
 1901.5 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1801   29.22
 1753.2 
 1748 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1806   174.97
 1731.2 
 1472.5 
 1.05 Rosette (LF11)  1428.3   114.77
 1200 
 1293.7 
 1.14 Rosette (LF12)  1612.2   62.57
 1494.9 
 1591.3 
 1.14 Rosette (LF13)  1264.9   104.36
 1412.5 
 3.20 Whole plant (WP05)  830.7   33.07
 794.1 
 764.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1208.2   61.63
 1094 
 1110.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1238.3   41.05
 1162.5 
 1173.2 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1540.4   117.39
 1741 
 1534.9 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1493.1   59.7
 1564.1 
 1445.5 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1614.2   96.93
 1427.2 
 1564.9 
 3.90 Rosette (SH01)  1491.4   385.25
 1902.9 
 2261.3 
 3.90 Roots (RT04)  1830.8   157.23
 1516.5 
 1681.2 
 3.90 Roots (RT05)  2003.3   138.12
 1981.4 
 1753.9 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1240   116.49
 1334 
 1501.9 
 1444.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1990.1   98.87
 1850.3 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1837.6   61.06
 1810.7 
 1927.3 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1533.8   216.55
 1956.3 
 1827.6 
 5.10 Roots (RT02)  2350.1   225.91
 2030.6 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  2407.9   21.25
 2438 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  2444.4   4.65
 2437.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  865.5   5.42
 873.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  771.6   336.99
 295 
 6.00 Leaf (LF08)  2042   537.24
 1229.3 
 1026.9 
 6.00 Leaf (LF16)  1066.5   192.37
 1379.8 
 1416.6 
 6.00 Inflorescence (IN01)  2033.3   47.88
 2101 
 6.10 Leaf (LF10)  1118.1   164.98
 830 
 1113.4 
 6.10 Stem base (ST01)  1543.4   45.57
 1478.9 
 6.10 Stem top (ST02)  1736.2   17.8
 1761.3 
 6.10 Flower, open (FL01)  2393.8   63.39
 2304.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  2435.9   213.08
 2134.6 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  2461.6   425.36
 1621.6 
 1925.4 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  2153.3   87.61
 1982.2 
 2100.6 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  3180.4   379.56
 2433.7 
 2688.6 
 Suspension cell culture (SU01)  2728.4   261.91
 3125.4 
 3222.9 
 Suspension cell culture (SU02)  1821.7   605.04
 2677.3 
 Xylem (XL01)  1824.9   144.15
 1580.2 
 1570.6 
 Cork (CR01)  1709.7   81.89
 1546.6 
 1615.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  2164.1   653.3
 1030.6 
 1034.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  1574.8   734.75
 1196.7 
 156 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1058.6   503.13
 226.2 
 152.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1060.9   344.6
 1688.1 
 1127.1 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1236.3   102.83
 1036.3 
 1178.1 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1042.9   421.6
 509.1 
 1341.3 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  982.6   100.18
 1019.2 
 1171.5 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  415   304.89
 872.6 
 294.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  429   169.29
 102.2 
 188.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress