TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g24090
TIGR annotation:acidic endochitinase (CHIB1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  81.5   1.58
 80.3 
 83.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  115.2   21.74
 161.7 
 116.1 
 129.5 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  121.2   9.28
 98.7 
 107.1 
 109.8 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  89.2   2.65
 89.4 
 90.7 
 94.9 
 0.70 Seedling (SL01)  331   46.97
 370.8 
 424.6 
 0.70 Seedling (SL02)  311.2   12.65
 314.5 
 291.1 
 0.70 Seedling (SL10)  211.5   17.34
 176.9 
 193.3 
 0.70 Seedling (SL12)  157.7   7.86
 169.3 
 172.7 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  1035.7   80.03
 1187 
 1066.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  409.1   44.87
 491.7 
 420.1 
 1.00 Seedling (SL07)  326.1   13.87
 306.5 
 1.00 Seedling (SL09)  440.1   15.01
 427.9 
 457.7 
 1.00 Seedling (SL11)  414.8   57.61
 384.6 
 359 
 280.3 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  190.2   54.13
 113.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  362.2   75.9
 219.4 
 246.1 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  190.7   9.3
 189.1 
 173.8 
 1.02 Seedling (SL08)  299.7   24.39
 265.2 
 1.02 Roots (RT01)  1699.1   131.14
 1513.6 
 1.02 Lateral roots (RH01)  139.4   145.9
 198.1 
 416.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  407.8   51.75
 415.4 
 501 
 1.05 Rosette (LF11)  85.9   4.45
 94.4 
 92.4 
 1.14 Rosette (LF12)  92.1   2.76
 91.1 
 96.3 
 1.14 Rosette (LF13)  103.2   2.41
 99.8 
 3.20 Whole plant (WP05)  235.4   27.34
 228.5 
 185 
 3.70 Adult leaf (LF01)  143.8   1.68
 140.5 
 142.8 
 3.70 Adult leaf (LF02)  164.8   3.52
 158 
 159.9 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  89   4.94
 98.1 
 96.9 
 3.90 Adult leaf (LF03)  221.5   35.08
 155.2 
 168.3 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  274.7   43.43
 225.8 
 188.1 
 3.90 Rosette (SH01)  168.3   12.66
 145.5 
 166.5 
 3.90 Roots (RT04)  309.8   37.95
 384 
 360.6 
 3.90 Roots (RT05)  263   14.77
 262.7 
 237.3 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  89.3   9.72
 76.7 
 77.5 
 96.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  333.9   21.04
 304.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  408   217.14
 714.3 
 294.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  120.2   26.9
 142.8 
 173.8 
 5.10 Roots (RT02)  675.4   256.88
 312.2 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  129.8   25.04
 165.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  124.9   14.05
 144.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  332.7   31.62
 377.5 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  286.9   17.53
 311.7 
 6.00 Leaf (LF08)  179.7   24.57
 208.7 
 159.9 
 6.00 Leaf (LF16)  171.7   21.59
 131.5 
 138 
 6.00 Inflorescence (IN01)  134.3   30.37
 91.3 
 6.10 Leaf (LF10)  109.8   14.1
 81.6 
 96.7 
 6.10 Stem base (ST01)  139.6   2.22
 136.4 
 6.10 Stem top (ST02)  221.2   49.01
 290.5 
 6.10 Flower, open (FL01)  132.5   0.19
 132.8 
 6.30 Silique, young (FS01)  186.8   17.59
 161.9 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  121.4   21.68
 92.9 
 78.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  118.9   12.66
 97.1 
 96.7 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  129.8   24.08
 86.8 
 89.4 
 Suspension cell culture (SU01)  190.6   57.91
 84.1 
 97.8 
 Suspension cell culture (SU02)  147.8   12.86
 166 
 Xylem (XL01)  720.5   31.28
 744.2 
 682.2 
 Cork (CR01)  562.7   39.24
 587.7 
 639.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  172.8   18.84
 204.6 
 206.1 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  267.2   74.87
 259.5 
 133.9 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  124.3   124.62
 373.3 
 258.1 
 Heart embryo, roots (EHR1)  150.6   36.37
 223 
 180.6 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  188.3   24.73
 231 
 231.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  205   202.13
 589.9 
 290.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  401.1   70.24
 305.2 
 442 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  725.2   175.04
 378.3 
 510.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  731.4   207.15
 333.6 
 432.3 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress