TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g24270
TIGR annotation:calcineurin B-like protein, putative / calcium sensor homolog (SOS3)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  213.1   34.08
 254 
 186.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  437   13.63
 456.4 
 451.2 
 470 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  391.2   10.8
 403.3 
 386.6 
 410.1 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  261.7   18.03
 242.2 
 268.1 
 285.8 
 0.70 Seedling (SL01)  375.4   8.1
 380.4 
 364.5 
 0.70 Seedling (SL02)  273.2   24.4
 291.8 
 243.4 
 0.70 Seedling (SL10)  158.4   16.95
 139.9 
 124.5 
 0.70 Seedling (SL12)  253   28.05
 294.2 
 240.6 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  146.4   8.96
 129.2 
 142.2 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  136.9   10.46
 123.8 
 116.3 
 1.00 Seedling (SL07)  253   13.04
 234.5 
 1.00 Seedling (SL09)  394   45.01
 304.2 
 354.6 
 1.00 Seedling (SL11)  215.1   46.49
 219.6 
 307.6 
 284.7 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  141.3   3.19
 145.8 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  307   62.08
 206.3 
 193.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  179.4   27.72
 234.6 
 211.5 
 1.02 Seedling (SL08)  360.2   56.99
 279.6 
 1.02 Roots (RT01)  660.1   33.94
 612.1 
 1.02 Lateral roots (RH01)  445   78
 432.6 
 573.5 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  352   55.79
 379 
 459.2 
 1.05 Rosette (LF11)  206.7   17.12
 231.8 
 199.1 
 1.14 Rosette (LF12)  221.4   27.52
 167.3 
 203.2 
 1.14 Rosette (LF13)  257.9   24.4
 292.4 
 3.20 Whole plant (WP05)  224.9   6.35
 234.9 
 236.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  196.7   17.52
 231.7 
 215.5 
 3.70 Adult leaf (LF02)  195.2   6.17
 187.3 
 199.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  211.2   42.54
 244.1 
 295.6 
 3.90 Adult leaf (LF03)  238.5   27.89
 222.7 
 184.2 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  353.2   71.11
 216.9 
 250.1 
 3.90 Rosette (SH01)  292.5   35.77
 268.4 
 222.1 
 3.90 Roots (RT04)  413.8   106.27
 604.2 
 590.9 
 3.90 Roots (RT05)  686.3   100.82
 648.2 
 838.7 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  229.9   41.14
 133.5 
 170.3 
 156.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  215.5   35.07
 166 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  192.3   29.4
 133.6 
 166.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  229.2   45.36
 314.1 
 244.1 
 5.10 Roots (RT02)  389.2   112.2
 230.5 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  301.7   19.96
 273.4 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  246.1   1.72
 243.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  434.1   9.1
 421.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  421.3   19.14
 394.2 
 6.00 Leaf (LF08)  181.1   16.19
 177.5 
 207.1 
 6.00 Leaf (LF16)  270.2   21.07
 310.1 
 301.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  305.8   32.79
 259.4 
 6.10 Leaf (LF10)  233.7   32.41
 171.2 
 187.4 
 6.10 Stem base (ST01)  165.3   22.94
 197.8 
 6.10 Stem top (ST02)  227.5   33.36
 274.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  374.3   162.92
 604.7 
 6.30 Silique, young (FS01)  122.8   6.06
 114.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  250.9   76.02
 130.5 
 110.2 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  302.4   65.61
 385.1 
 255.5 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  272.8   77.51
 146.7 
 131.7 
 Suspension cell culture (SU01)  196.5   38.02
 128.8 
 132.6 
 Suspension cell culture (SU02)  217.7   33.54
 170.3 
 Xylem (XL01)  107.7   9.13
 122.3 
 105.5 
 Cork (CR01)  144.5   16.37
 164.1 
 131.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  247.7   56.13
 270.9 
 354.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  353.4   63.48
 232.4 
 259.6 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  217.4   147.53
 512.3 
 358.4 
 Heart embryo, roots (EHR1)  230.3   79.38
 359 
 214.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  117.9   14.75
 140.1 
 145.9 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  142.6   210.13
 503.5 
 136.7 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  582   182.75
 353.8 
 220.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  623.3   148.8
 374.9 
 357.1 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  551.8   172.23
 473.6 
 222.2 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress