TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g27830
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  318.5   112.29
 470.1 
 250.8 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  322.2   26.76
 265.6 
 320.6 
 293.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  359.1   28.99
 313.1 
 373.4 
 321.8 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  293   11.5
 309.1 
 281.4 
 298.3 
 0.70 Seedling (SL01)  297.3   16.53
 266.7 
 292.8 
 0.70 Seedling (SL02)  199.5   9.26
 197 
 182.4 
 0.70 Seedling (SL10)  245.2   7.21
 255 
 259.3 
 0.70 Seedling (SL12)  199.7   34.5
 241 
 172.4 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  357.2   21.83
 400.6 
 374.8 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  421.5   16.63
 447.7 
 452.3 
 1.00 Seedling (SL07)  198.7   2.99
 203 
 1.00 Seedling (SL09)  242   7.37
 241 
 228.8 
 1.00 Seedling (SL11)  227.6   32.06
 217.7 
 284.3 
 269.1 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  420.5   30.57
 463.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  252   45.58
 160.9 
 202.3 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  520.5   32.84
 463.1 
 464.2 
 1.02 Seedling (SL08)  324.6   32.52
 278.6 
 1.02 Roots (RT01)  281.8   24.95
 317.1 
 1.02 Lateral roots (RH01)  181.3   18.74
 149.2 
 182 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  223.6   14.53
 251.5 
 244.6 
 1.05 Rosette (LF11)  239   39.86
 164.9 
 176.5 
 1.14 Rosette (LF12)  438.1   26.13
 388.2 
 426.4 
 1.14 Rosette (LF13)  217.4   10.63
 232.4 
 3.20 Whole plant (WP05)  684.3   32.05
 620.4 
 647.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  253.6   15.78
 222.6 
 243 
 3.70 Adult leaf (LF02)  242.7   21.58
 199.6 
 223.1 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  320.3   22.58
 325.9 
 284.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  512.5   65.72
 624.1 
 628.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  343.9   65.94
 474.3 
 426.3 
 3.90 Rosette (SH01)  407.3   36.1
 476.7 
 459.2 
 3.90 Roots (RT04)  291.4   5.74
 294.1 
 302.5 
 3.90 Roots (RT05)  258.6   11.78
 247.4 
 271 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  201.4   5.48
 208.4 
 206.1 
 196 
 5.10 Flower, buds (FB01)  321.8   43.89
 259.7 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  284.5   45.44
 367.5 
 293.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  248.2   37.76
 288 
 323.7 
 5.10 Roots (RT02)  181.2   31.21
 225.3 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  571.8   119.01
 403.5 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  653.3   94.43
 519.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  355.6   67.46
 260.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  339.6   13.56
 358.8 
 6.00 Leaf (LF08)  548.4   129.33
 347.5 
 306.8 
 6.00 Leaf (LF16)  260.9   35.46
 318.7 
 325.4 
 6.00 Inflorescence (IN01)  283.6   13.14
 265 
 6.10 Leaf (LF10)  297   23.19
 250.8 
 277.3 
 6.10 Stem base (ST01)  605   85.8
 483.7 
 6.10 Stem top (ST02)  249   2.98
 253.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  344.5   39.19
 289.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  329.2   14.93
 308.1 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  271   35.21
 220.3 
 287.9 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  270.4   60.01
 357 
 241.7 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  386.9   56.1
 496.8 
 461.4 
 Suspension cell culture (SU01)  378   153.87
 670.4 
 607.3 
 Suspension cell culture (SU02)  535.3   215.86
 230 
 Xylem (XL01)  397.7   23.27
 381.6 
 427.4 
 Cork (CR01)  427.9   42.11
 435.6 
 504.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  222.1   192.2
 314.3 
 591.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  323.7   52.46
 357.3 
 254.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  270   86.54
 415.2 
 260.9 
 Heart embryo, roots (EHR1)  356.6   318.83
 138.8 
 766.7 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  508.2   230.02
 678.9 
 963.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  570.2   332.07
 256.2 
 920 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  200.2   252.64
 557 
 68.8 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  205.9   174.79
 525 
 241.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  273   91.75
 100.4 
 132.8 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress