TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g43750
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  57.4   17.73
 79.4 
 92.5 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  49.8   17.68
 89.6 
 58.6 
 57 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  48.6   2.49
 44.6 
 50.2 
 46.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  70.4   4.06
 77.9 
 73.7 
 68.7 
 0.70 Seedling (SL01)  1414.5   41.76
 1331 
 1372.3 
 0.70 Seedling (SL02)  2343.9   87.34
 2501.1 
 2488.3 
 0.70 Seedling (SL10)  843.9   78.93
 1001.5 
 931.6 
 0.70 Seedling (SL12)  1941.1   81.46
 1875.7 
 1779.2 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  46.4   3.07
 43.2 
 40.2 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  43.9   6.12
 50.6 
 56.1 
 1.00 Seedling (SL07)  1644.1   43.96
 1706.3 
 1.00 Seedling (SL09)  1744.9   138.21
 1830.2 
 1559.8 
 1.00 Seedling (SL11)  1589.1   320.78
 1622.1 
 1121.5 
 1894.3 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  54.8   1.17
 56.4 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  2163.3   290.49
 1607.9 
 1738 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  433.2   8.35
 428.3 
 416.9 
 1.02 Seedling (SL08)  817.9   7.5
 807.3 
 1.02 Roots (RT01)  107.3   0.42
 107.9 
 1.02 Lateral roots (RH01)  99   6.52
 101.2 
 111.2 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1371.7   111.97
 1152.3 
 1223.1 
 1.05 Rosette (LF11)  1919.9   181.05
 2179.9 
 2268.2 
 1.14 Rosette (LF12)  1847.9   79.07
 1948.1 
 1792.1 
 1.14 Rosette (LF13)  2318.2   44.94
 2254.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  1804   39.19
 1806.5 
 1873.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  2500.2   114.27
 2408 
 2635.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  2474.4   25.24
 2467.9 
 2514.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1375.4   316.59
 1805.6 
 1188.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1303.5   294.91
 756.9 
 838.3 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1268.7   299.71
 709.5 
 802 
 3.90 Rosette (SH01)  1315.2   124.43
 1080.9 
 1125.5 
 3.90 Roots (RT04)  123   6.2
 133.8 
 123.1 
 3.90 Roots (RT05)  109.2   9.72
 118.9 
 128.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1480.3   137.71
 1223.7 
 1177.2 
 1224.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  636.5   83.1
 754 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  505.4   83.05
 460.2 
 621.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  642.4   119.23
 821.7 
 595.9 
 5.10 Roots (RT02)  104.5   11.81
 87.8 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  65   4.96
 72 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  65.4   7.4
 75.9 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  82.1   8.84
 94.6 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  111.5   2.64
 107.8 
 6.00 Leaf (LF08)  1484.6   216.97
 1916.6 
 1736.3 
 6.00 Leaf (LF16)  1316.8   127.28
 1402.4 
 1567.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  359.8   18.67
 386.2 
 6.10 Leaf (LF10)  2251.9   101.54
 2333.3 
 2131.4 
 6.10 Stem base (ST01)  345.1   40.29
 402.1 
 6.10 Stem top (ST02)  862.8   128.85
 680.6 
 6.10 Flower, open (FL01)  424.5   77.12
 533.6 
 6.30 Silique, young (FS01)  1127.9   100.96
 985.1 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  914.2   382.34
 1649.5 
 1100 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  43.2   11.18
 56.3 
 65.4 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  304.6   99.19
 441 
 497.5 
 Suspension cell culture (SU01)  49.3   3.51
 43.2 
 43.2 
 Suspension cell culture (SU02)  52.3   9.6
 65.9 
 Xylem (XL01)  52   3.59
 47.7 
 54.8 
 Cork (CR01)  57.2   3.13
 56.5 
 51.5 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  130.9   25.8
 178 
 136.2 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  157.9   47.05
 248.6 
 181.5 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  175.4   746.15
 120.8 
 1439.6 
 Heart embryo, roots (EHR1)  135.8   0.49
 136.4 
 135.4 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  190.8   12.18
 172.8 
 167.6 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  203.9   29.38
 165.4 
 146.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  157.6   7.88
 165 
 173.4 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  134.8   18.99
 99.5 
 129.1 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  126.3   99.37
 84.6 
 273.7 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress