TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g44070
TIGR annotation:phytochelatin synthase 1 (PCS1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  368.3   87.45
 336.4 
 203.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  212.7   27.6
 145.1 
 178.2 
 176.6 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  178.9   4.94
 185.8 
 190.9 
 184.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  301.8   10.32
 320.2 
 326 
 315.8 
 0.70 Seedling (SL01)  717.6   29.78
 666.1 
 665.9 
 0.70 Seedling (SL02)  580.4   12.54
 585.7 
 604.3 
 0.70 Seedling (SL10)  553.5   44.03
 641.4 
 592.2 
 0.70 Seedling (SL12)  739.6   125.69
 504.1 
 697.9 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  985   61.31
 1088.3 
 1093.9 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  518.9   67.93
 587.5 
 451.6 
 1.00 Seedling (SL07)  588.7   27.55
 627.7 
 1.00 Seedling (SL09)  631   48.74
 685.4 
 588.2 
 1.00 Seedling (SL11)  757.3   108.09
 878.2 
 865.6 
 1020.6 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  544.8   75
 650.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  770.7   102.53
 565.9 
 659.2 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  785.4   62.41
 785.4 
 677.3 
 1.02 Seedling (SL08)  1102.8   60.5
 1017.3 
 1.02 Roots (RT01)  1164.7   10.18
 1150.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  957.4   60.84
 863 
 976.6 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1479.9   293.54
 1837.4 
 2062 
 1.05 Rosette (LF11)  611.1   64.94
 494 
 601.3 
 1.14 Rosette (LF12)  1608   230.23
 1262.4 
 1698.6 
 1.14 Rosette (LF13)  610.2   69.59
 708.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  545.6   26.45
 495.3 
 534.6 
 3.70 Adult leaf (LF01)  599.2   55.25
 489.7 
 531.5 
 3.70 Adult leaf (LF02)  509.8   23.54
 477.5 
 463.9 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1130.9   57.17
 1016.6 
 1076.8 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1188.3   531.58
 2163.9 
 2042 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  779.8   791.21
 2072.4 
 2216.7 
 3.90 Rosette (SH01)  1372.3   186.17
 1636.5 
 1277.2 
 3.90 Roots (RT04)  983.8   90.54
 1142.9 
 988.5 
 3.90 Roots (RT05)  822.3   28.36
 851.9 
 879 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  469.9   26.75
 521 
 463 
 498.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  658.7   140.07
 460.6 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  622.3   131.29
 392.4 
 617.1 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  637.2   168.05
 416.1 
 745.8 
 5.10 Roots (RT02)  1042.4   20.09
 1070.8 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  277.8   10.23
 292.3 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  280   3.67
 285.2 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  105.4   6.73
 95.9 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  87.9   2.49
 91.4 
 6.00 Leaf (LF08)  1441.3   262.81
 1060.9 
 937 
 6.00 Leaf (LF16)  1655   167.17
 1324.8 
 1535.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  304.5   14.13
 324.5 
 6.10 Leaf (LF10)  578.8   115.26
 652.1 
 804.8 
 6.10 Stem base (ST01)  1620   173.66
 1374.4 
 6.10 Stem top (ST02)  514.2   69.82
 415.5 
 6.10 Flower, open (FL01)  790.5   124.14
 615 
 6.30 Silique, young (FS01)  584   21.67
 553.4 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  595.9   28.67
 642.1 
 648.5 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  201.7   39.5
 133.5 
 133.1 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1174.3   390.45
 1735.3 
 1925.2 
 Suspension cell culture (SU01)  2915.9   24.11
 2869.9 
 2880.6 
 Suspension cell culture (SU02)  1014   155.78
 793.6 
 Xylem (XL01)  571   28.5
 532.6 
 515.3 
 Cork (CR01)  798   53.73
 891.6 
 890.5 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  154.5   24.25
 182 
 202.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  173.6   282.98
 594.2 
 55.9 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  165.3   64.7
 96.5 
 225.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  201.3   78.74
 156.9 
 309.9 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  96.6   178
 57.3 
 383.4 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  74.1   241.73
 51.9 
 481.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  97   377.41
 775.7 
 150.2 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  37   140.56
 299.8 
 81.9 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  175.8   46.28
 139.6 
 83.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress