TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g44790
TIGR annotation:copper-exporting ATPase / responsive-to-antagonist 1 / copper-transporting ATPase (RAN1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  682.5   50.37
 695.2 
 602.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  1575.1   113.66
 1492.6 
 1685.8 
 1747.6 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  1318   42.89
 1256.2 
 1315.4 
 1232.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  599.3   46.21
 553 
 536.9 
 638.8 
 0.70 Seedling (SL01)  1190.6   34.07
 1124.3 
 1143.7 
 0.70 Seedling (SL02)  741.5   40.68
 665.1 
 727.6 
 0.70 Seedling (SL10)  716.3   19.23
 693.1 
 731.3 
 0.70 Seedling (SL12)  863.7   66.03
 800.6 
 731.7 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  4233   372.16
 4064.7 
 4776.8 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  2581.4   328.39
 3163.7 
 2609.3 
 1.00 Seedling (SL07)  1238   39.77
 1294.2 
 1.00 Seedling (SL09)  2014.8   96.82
 1983.2 
 1833.5 
 1.00 Seedling (SL11)  1102.2   271.08
 1238.8 
 1479 
 829.6 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  2908.8   61.09
 2995.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  966.8   114.65
 750.4 
 793.1 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  989.3   55.68
 1005 
 901.6 
 1.02 Seedling (SL08)  1856.9   166.62
 1621.3 
 1.02 Roots (RT01)  2603.7   359.71
 2095 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1715.4   47.83
 1629.4 
 1636 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1119.3   71.79
 1022.3 
 979.2 
 1.05 Rosette (LF11)  607.6   48.86
 541.6 
 512.2 
 1.14 Rosette (LF12)  883.8   24.62
 846.7 
 893.3 
 1.14 Rosette (LF13)  612.5   103.01
 758.2 
 3.20 Whole plant (WP05)  286.1   20.01
 293.4 
 323.8 
 3.70 Adult leaf (LF01)  545.4   22.05
 503.2 
 513.3 
 3.70 Adult leaf (LF02)  532.2   25.35
 565.2 
 515.3 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  625.2   47.09
 687.4 
 595.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1096.1   213.65
 1481.3 
 1128.7 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1451.2   133
 1710 
 1527.4 
 3.90 Rosette (SH01)  898.7   195.82
 1286.3 
 1044.4 
 3.90 Roots (RT04)  2460.5   222.71
 2806.3 
 2390.2 
 3.90 Roots (RT05)  1942.4   102.16
 1929.9 
 2112.8 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  370.4   37.36
 448.1 
 398.6 
 444 
 5.10 Flower, buds (FB01)  702.6   92.59
 571.7 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1134.4   199.24
 962.2 
 737.1 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1141.2   307.03
 531 
 776.4 
 5.10 Roots (RT02)  2140.4   23.04
 2107.8 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  295.1   49.04
 364.4 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  317.1   52.9
 391.9 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  1274.8   72.43
 1377.3 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  3283.3   327.75
 3746.8 
 6.00 Leaf (LF08)  882.9   41.15
 848.2 
 800.9 
 6.00 Leaf (LF16)  949   111.92
 1008.7 
 1165.7 
 6.00 Inflorescence (IN01)  716.2   69.59
 814.6 
 6.10 Leaf (LF10)  656.4   52.63
 594.3 
 699 
 6.10 Stem base (ST01)  3955   134.29
 3765.1 
 6.10 Stem top (ST02)  674.9   30.27
 717.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  859.9   28.27
 820 
 6.30 Silique, young (FS01)  557.3   55.83
 636.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1313.7   116.47
 1512.1 
 1518.7 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  1371.4   265.32
 901.8 
 922.7 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1564.3   142.05
 1671.3 
 1389.9 
 Suspension cell culture (SU01)  1486.8   75.76
 1346.7 
 1466.7 
 Suspension cell culture (SU02)  868.5   31.81
 823.5 
 Xylem (XL01)  3834.4   744.75
 5107.4 
 5140.7 
 Cork (CR01)  3240.3   338.65
 3888.3 
 3393.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  334.2   65.73
 445.1 
 328.5 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  449.5   127.55
 671.1 
 450.9 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  619.7   145.61
 748 
 457.4 
 Heart embryo, roots (EHR1)  924.6   323.09
 298.2 
 748.9 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  416.3   246.71
 763.1 
 285.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  348.5   477.01
 180.8 
 1078 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  614.2   177.28
 563.2 
 284.8 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  226.2   406.84
 1001.3 
 399.3 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  586.4   205.93
 665.5 
 275.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress