TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g47740
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  73.8   6.51
 66.1 
 79 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  112   3.28
 104.8 
 110.3 
 106.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  87.7   8.33
 102 
 92.2 
 82.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  75.9   3.78
 77.3 
 83.3 
 82.8 
 0.70 Seedling (SL01)  84.3   2.29
 83.2 
 87.6 
 0.70 Seedling (SL02)  78.3   4.37
 77.8 
 70.5 
 0.70 Seedling (SL10)  102.8   20.83
 140.4 
 105.9 
 0.70 Seedling (SL12)  188   19.05
 191.3 
 156.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  68.2   6.03
 56.3 
 63.6 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  45.9   2.28
 50.4 
 49 
 1.00 Seedling (SL07)  108.8   4.46
 102.5 
 1.00 Seedling (SL09)  175.4   23.17
 215.9 
 215.1 
 1.00 Seedling (SL11)  56.4   11.47
 56.6 
 77.9 
 74.5 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  56.3   2.88
 52.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  75.4   4.35
 77.4 
 69.1 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  115.5   7.8
 107.6 
 99.9 
 1.02 Seedling (SL08)  113.9   26.98
 152 
 1.02 Roots (RT01)  551.4   249.69
 198.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  95.9   2.53
 95.7 
 100.2 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  87.4   17.46
 120.2 
 93.6 
 1.05 Rosette (LF11)  58.9   0.99
 59.9 
 58 
 1.14 Rosette (LF12)  54.6   6.38
 67.3 
 60.4 
 1.14 Rosette (LF13)  56.3   1.02
 57.8 
 3.20 Whole plant (WP05)  46.8   6.45
 59.6 
 51.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  66.8   6.25
 78.9 
 75.7 
 3.70 Adult leaf (LF02)  76.9   4.08
 70.6 
 69.2 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  49.2   10.4
 58.9 
 69.9 
 3.90 Adult leaf (LF03)  94.2   13.88
 68.4 
 72.5 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  67.4   3.92
 72.6 
 75.1 
 3.90 Rosette (SH01)  71.3   2.41
 66.9 
 70.8 
 3.90 Roots (RT04)  227.7   29.41
 285.7 
 248 
 3.90 Roots (RT05)  304.3   81.92
 268 
 424.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  65.1   8.95
 75.6 
 84.7 
 67.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  41.5   1.99
 44.3 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  67.8   18.02
 94.8 
 60.6 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  71.6   6.83
 59.6 
 60 
 5.10 Roots (RT02)  219.6   59.18
 135.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  81   1.37
 79.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  68   12.73
 86 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  76.8   13.74
 96.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  71.7   33.39
 118.9 
 6.00 Leaf (LF08)  69.8   3.25
 76.1 
 71.4 
 6.00 Leaf (LF16)  102.8   13.81
 118.9 
 130.3 
 6.00 Inflorescence (IN01)  83.1   12.34
 65.7 
 6.10 Leaf (LF10)  71.4   3.58
 70.8 
 64.9 
 6.10 Stem base (ST01)  79.9   14.83
 100.9 
 6.10 Stem top (ST02)  63.2   18.98
 90 
 6.10 Flower, open (FL01)  42.3   3
 38.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  39.5   2.69
 35.7 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  95   17.69
 63.4 
 65.4 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  81.7   7.92
 65.8 
 74.1 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  106.5   23.21
 63.7 
 69.4 
 Suspension cell culture (SU01)  127.7   13.09
 113 
 101.6 
 Suspension cell culture (SU02)  99.8   1.42
 101.8 
 Xylem (XL01)  58.4   4.27
 60.4 
 52.2 
 Cork (CR01)  58.2   1.66
 61.5 
 59.9 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  175   51.4
 273.4 
 198.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  205.7   26.24
 157.8 
 200.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  136.6   56.69
 223.5 
 243.1 
 Heart embryo, roots (EHR1)  101.8   49.82
 197.2 
 174.6 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  228   37.83
 301.9 
 279 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  285.4   63.53
 174.4 
 283.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  142.5   17
 118.9 
 151.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  248.6   47.85
 153 
 197.3 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  195.7   12.86
 200.5 
 176.2 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress