TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g50350
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  593.6   25.7
 546.5 
 587.7 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  591.9   26.45
 624.7 
 645.4 
 591.3 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  510   32.47
 570.5 
 563.4 
 584 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  466.8   15.56
 453 
 484.9 
 485.1 
 0.70 Seedling (SL01)  388.6   32.22
 345.4 
 325.6 
 0.70 Seedling (SL02)  330.7   32.21
 380.9 
 320.8 
 0.70 Seedling (SL10)  371.8   49.05
 410 
 312.7 
 0.70 Seedling (SL12)  244   58.64
 337.7 
 229.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  160.4   2.16
 164.6 
 163.4 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  166.8   19.89
 193.1 
 154.1 
 1.00 Seedling (SL07)  305.5   4.02
 299.8 
 1.00 Seedling (SL09)  308.7   10.49
 302.3 
 322.8 
 1.00 Seedling (SL11)  247.5   13.89
 238.1 
 214.9 
 237.7 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  192.1   11.53
 175.8 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  333.3   32.52
 393.3 
 341.5 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  316.4   25.18
 271.1 
 274.7 
 1.02 Seedling (SL08)  218.8   41.89
 278 
 1.02 Roots (RT01)  278.3   103.89
 131.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  328.8   9.99
 336.4 
 316.6 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  354.9   53.17
 274.6 
 254.4 
 1.05 Rosette (LF11)  422.3   30.88
 393.4 
 360.6 
 1.14 Rosette (LF12)  369.9   11.4
 382.6 
 359.8 
 1.14 Rosette (LF13)  351   8.52
 363 
 3.20 Whole plant (WP05)  272.4   27.39
 218.5 
 237.3 
 3.70 Adult leaf (LF01)  358.8   24.99
 355.4 
 400.3 
 3.70 Adult leaf (LF02)  360.9   1.9
 359.2 
 363 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  312.6   17.06
 338.4 
 344.8 
 3.90 Adult leaf (LF03)  242.8   25.56
 240.5 
 285.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  249.8   21.38
 207.6 
 222.7 
 3.90 Rosette (SH01)  262.5   38.77
 314.8 
 239 
 3.90 Roots (RT04)  304.5   20.35
 264.1 
 288.4 
 3.90 Roots (RT05)  321.6   18.34
 357.8 
 334.8 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  363.7   27.47
 430.4 
 394.4 
 402.9 
 5.10 Flower, buds (FB01)  378.5   4.93
 371.5 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  474.4   24.14
 522.4 
 493.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  551.4   36.99
 507.8 
 477.8 
 5.10 Roots (RT02)  376.6   36.26
 427.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  443.8   87.84
 568 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  393.8   19.62
 366.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  176.3   12.42
 193.8 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  212.9   6.82
 203.3 
 6.00 Leaf (LF08)  320.2   35.09
 275.8 
 250.9 
 6.00 Leaf (LF16)  239.3   12.37
 215.1 
 222.7 
 6.00 Inflorescence (IN01)  685.3   108.4
 531.9 
 6.10 Leaf (LF10)  334.7   37.2
 276.3 
 265.6 
 6.10 Stem base (ST01)  283.8   5.03
 276.7 
 6.10 Stem top (ST02)  412.7   23.16
 379.9 
 6.10 Flower, open (FL01)  316.9   28.71
 357.5 
 6.30 Silique, young (FS01)  251.7   63.19
 341 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  334.5   29.32
 364.1 
 305.5 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  508.9   21.55
 540.8 
 499.7 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  454.3   26.23
 461.9 
 413.1 
 Suspension cell culture (SU01)  614.6   40.02
 633.9 
 691.5 
 Suspension cell culture (SU02)  725.4   187.13
 990.1 
 Xylem (XL01)  119.3   2.14
 120.3 
 123.4 
 Cork (CR01)  176.8   23.05
 158.8 
 131.1 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  516.8   28.8
 517.3 
 566.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  524.9   60.44
 563.4 
 444.9 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  414.1   27.84
 375.1 
 360.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  750.1   262.48
 298.7 
 292.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  272.7   13.83
 294.5 
 298.4 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  279.8   83.35
 421.6 
 274.8 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  523.9   51.72
 477.1 
 580.4 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  404.9   129.86
 248.9 
 506.8 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  315.1   70.62
 421 
 449 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress