TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g54430
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  2455.2   205.89
 2047.6 
 2301.9 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  3433.9   86.58
 3617.8 
 3615.1 
 3537.2 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  3183.6   174.72
 3330 
 3099.2 
 2911.4 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  2472.3   38.05
 2412.1 
 2488.6 
 2495.9 
 0.70 Seedling (SL01)  1717.7   52.74
 1690.5 
 1792.3 
 0.70 Seedling (SL02)  1392.7   67.8
 1396 
 1276.9 
 0.70 Seedling (SL10)  1742.3   40.19
 1817.7 
 1804.2 
 0.70 Seedling (SL12)  1096.1   123.44
 1316.6 
 1110.1 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  4884.8   231.85
 4863.7 
 4473.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  2993.6   202.95
 3229.5 
 2825.5 
 1.00 Seedling (SL07)  1997.9   162.43
 1768.2 
 1.00 Seedling (SL09)  1596.9   96.81
 1788.7 
 1669.9 
 1.00 Seedling (SL11)  1591.9   143.19
 1682.9 
 1817.9 
 1479.6 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  3669   39.07
 3724.3 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1829.3   159.72
 1614.5 
 1517.2 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1787.6   103.7
 1656.1 
 1582.9 
 1.02 Seedling (SL08)  2426.5   61.47
 2339.5 
 1.02 Roots (RT01)  1847.6   8.74
 1835.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1262.9   90.59
 1289.8 
 1431.5 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1832.5   13.71
 1858.4 
 1837.8 
 1.05 Rosette (LF11)  1399.6   67.16
 1271.1 
 1301.7 
 1.14 Rosette (LF12)  1879.3   49.98
 1977.6 
 1912.5 
 1.14 Rosette (LF13)  1411.3   100.18
 1553 
 3.20 Whole plant (WP05)  1889   47.37
 1889.8 
 1807.4 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1053.5   42.18
 1014 
 969.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  971.8   26.89
 951.1 
 1004.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1741.4   225.31
 1430.8 
 1303.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1901.4   502.41
 2768.1 
 2775 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1650.2   813.8
 3135.7 
 2969 
 3.90 Rosette (SH01)  1914.5   215.73
 2338.7 
 2194.6 
 3.90 Roots (RT04)  1887.7   187.21
 1927.1 
 2229.9 
 3.90 Roots (RT05)  1354.6   7.92
 1341.8 
 1356.3 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1328.3   194.78
 1779.8 
 1647.3 
 1675.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1915.4   75.44
 1808.7 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  2468.8   100.71
 2511.4 
 2660.6 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  2457.3   215.22
 2291.1 
 2030.4 
 5.10 Roots (RT02)  2157.5   69.67
 2059 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  1224.1   77.68
 1114.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1358.4   69.16
 1260.6 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  831.3   95.28
 696.5 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  488.7   193.37
 215.3 
 6.00 Leaf (LF08)  2070.4   310.08
 1605.8 
 1482.3 
 6.00 Leaf (LF16)  1763.8   150.52
 2012.5 
 2035.1 
 6.00 Inflorescence (IN01)  2210.4   119.51
 2041.4 
 6.10 Leaf (LF10)  1379.9   142.35
 1491 
 1662.4 
 6.10 Stem base (ST01)  3258.6   11.21
 3242.7 
 6.10 Stem top (ST02)  1833.6   67.95
 1929.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  1811.6   115.17
 1648.7 
 6.30 Silique, young (FS01)  1649.2   137.84
 1454.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  2429   198.71
 2169.1 
 2559.4 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  2726.4   225.98
 2276.2 
 2466.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1830.9   456.94
 2405.1 
 2733.7 
 Suspension cell culture (SU01)  2758.2   338.69
 3387.6 
 3289.8 
 Suspension cell culture (SU02)  2529.4   235.98
 2863.1 
 Xylem (XL01)  5366.5   296.82
 4914.8 
 4807 
 Cork (CR01)  3908.5   164.92
 3730.7 
 3579 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  1588.6   498.61
 593.2 
 1143.7 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  1499.6   578.74
 1205.8 
 383.1 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1174.2   402.3
 488.3 
 466.9 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1185   493.27
 1249.4 
 2069.8 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1068.4   370.65
 1809.7 
 1447.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1242.7   419.74
 767.6 
 1604.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  440.2   491.62
 1238.8 
 342.8 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  272.4   547.48
 1349.4 
 639.8 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  658   1003.71
 2237.5 
 374.8 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress